• Forum - Fonction, Idée, Séquence

[Génétique] Myoglobine

D'accord. En cours de traduction, la protéine se replie instantanément tout d'abord en fonction des interactions hydrophobes qui sont déterminées par les acides aminés... hydrophobes. Viennent ensuite les autre interactions faibles, ioniques, hydrogènes, toujours en fonction de la nature des acides aminés (polaires, chargés,  [...] Oui. Avec ce que je viens de dire, si on constate que plusieurs séquences se ressemblent, à quoi peut-on s'attendre concernant la structure de chacune des protéines qui découlera de ces séquences quasi-identiques.  [...]

Question : Identifier une protéine dans un anabolisme

Ici on peut voir le nom des enzyme qui catalyse des réactions. Ma question est la suivante. Comment des chercheurs on ils pus identifier ces enzymes.   [...] En fait, de nos jours, on aurait probablement déja identifié la protéine (du moins virtuellement) et le gène correspondant. En effet, maintenant que les organismes sont entièrement séquencés, on connait théoriquement toutes les protéines potentielles et on a une idée de leur fonction (par analogie de structure, analogie de séquence).  [...]

Transgene / Protéine Recombinante

Partir de la protéine pour remonter au gène est possible si on arrive à isoler une protéine dans un sécrétome par exemple. Des méthodes pour séquencer les protéines existent. Remonter à la séquence d'ADN devra être fait en tenant compte de l'épissage, épissages alternatifs, éventuelles modifications post-traductionnelles effectuées après la traduction etc.  [...] De nos jours, quand on veut cloner une protéine, en général on connait déjà sa fonction et son gène (du moins son gène, pour la fonction à part de rares cas on a une idée par analogie de séquence/fonction avec ce qui est connu).  [...]

Biochimie Exons

On ne peut pas connaitre le nombre d'exons dans un gène à partir de sa seule séquence non annotée. Il existe des algorithmes de prédictions d'exons/introns, mais j'imagine que ce n'est pas cela que tu cherches.  [...] C'est un exercice je ne pense pas que ce gène existe vraiment, en plus d'avoir cette séquence j'ai aussi la séquence du brin ARNc du coup j'ai pu trouver le nombre d'Exons en fonction de ce qui était codé et ce qui ne l'était pas. Maintenant on me demande de trouver le nombre de nucléotide de la région non codante 3' UTR mais j'ai aucune idée de comment y parvenir. Une aide.  [...]

[Biologie Moléculaire] Fonctionnement des enzymes

J'ai de nouveau une idée de plan avec cette probmèmatique. comment une différence dans la séquence d'AA provoque un dysfonctionnement de l'enzyme.  [...] Changer la séquence peptidique des régions déterminants le site actif (conformation, activité catalytique) joue sur la fonction de l'enzyme.  [...]

[Biochimie] Trouver la fonction d'une protéine avec sa structure primaire

- Vous disposez de la séquence de la séquence primaire d'une protéine dont le gène a été cloné chez Arabidopsis thaliana, mais vous ne connaissez pas sa fonction.  [...] Une option serait d'aller chercher sur des alignements de séquences connues si il y a une clusterisation de la protéine. On peut aussi chercher des homologies dans différentes espèces.  [...]

[Biochimie] Hélice Alpha

Seulement, encore pour une histoire de fonction, on a des coudes (avec proline) qui permette de réorienté l'enchainement d'acides aminés. Les hélices sont différentes seulement dans leur longueurs et leur composition d'AA mais on a les mêmes angles phi et psi (enfin il me semble ).  [...] En fait VilCrocrotte tu expliques que c'est une question de fonction mais je ne suis pas tout à fait d'accord avec toi. ce n'est pas la fonction qui donne sa forme à la protéine, mais plutôt sa séquence primaire, qui ensuite déterminera sa fonction.  [...]

[Biochimie] mutation...

sa veut dire que on peut avoir une mutation dans la séquence des nucléotides de notre ADN tout en étant parfaitement normal.  [...] -ou bien la mutation entraine effectivement une modification de la séquence de ta protéine, mais sans en affecter la fonction.  [...]

[Biologie Moléculaire] Le nucléole

D'après ce que je sais,le nucléole est une zone active durant toute la phase du noyau interphasique,donc oui les ribosomes sont crées durant la traduction,mais il faut savoir que la vitesse d'exportation des sous unités ribosomiques est plus lente que la vitesse de synthétisation de ces unités,et sachant qu'on exporte les sous unités ribosomiques en fonction du besoin de la cellule,la plupart des sous unités ribosomique sont stockées dans le composant granulaire du nucléole.  [...] Et je ne suis pas tout à fait d'accord avec cette idée que le nucléole est associé à de l'hétérochromatine. Le nucléole est organisé autour des région chromosomiques appelées organisateurs nucléolaires qui comportent les gènes codant pour l'ARN47S,certes cette séquence ADNr(47S) est une séquence de gènes répétitifs mais c'est une séquence active à la transcription,c'est donc bien de l'euchromatine,ou encore fibre de 30nm.  [...]

une famille de gènes

Vu que la séquence détermine la fonction, un gène découlant d'un autre possède une fonction différente du premier si sa séquence change ( en comptant la redondance du code génétique ).  [...] moi aussi g un petit probleme dans le genre qui me pose problèmeC est toujours avec l'avt, l'ot,etl'adh, il ya un tableau indiquant la séquence peptidique des hormones, un sur la répartition de ces hormones chez différents groupes de vertébrés et un sur les principaux rôles physiologiques de ces hormonesMais la question finale est de proposer un arbre présentant la filiation des gènes codant ces hormones à partir de l'ensemble des données fournies et ca j'ai pas réussit a le faire et si quelqu un pourrait m'aider ca searit sympa merci d'avance.  [...]