• Forum - Fonction, Forme, Acides aminés

[Biologie Moléculaire] Structures

=. la structure primaire conditionne la structure tertiaire, qui elle meme impose la fonction -si on dénature, donc fait perdre sa structure 3D a la protéine, elle devient inactive-. (Qu'est-ce qui conditionne la structure secondaire ).  [...] - La structure primaire, c'est la séquence en acide aminés. En fonction de la nature des groupements ( -R ) des acides aminés présents, des structures secondaires peuvent se former ou non. Certaines séquences favorisent plus facilement telle ou telle structure secondaire du fait de l'encombrement et des charges des groupements des AA qui la forme.  [...]

[Génétique] Myoglobine

Ou parce que la myoblobine a la même structure spatiale chez tous les vertébrés et peu d'acide aminés qui différènt entre les différents vertébrés donc la molécule a la meme fonction chez tous les vertébrés.  [...] ..) et/ou des liaisons covalentes de type ponts disulfures (entre deux cystéines). Finalement, c'est bien la séquence en acides aminés qui va conditionner la prise de forme, c'est-à-dire la structure 3D.  [...]

[Biologie Moléculaire] Charge des acides aminés

A l'inverse les acides aminés acides ont une fonction COOH supplémentaire qui libère un proton pour former du COO-.  [...]

[Biochimie] Acides amines / proteines

Par contre, le fait que nos acides aminés soit tous D ou tous L, ça n'a probablement été qu'une histoire de hasard, puisque rien empêche, dans l'état actuel de nos connaissances et jusqu'à preuve expérimentale du contraire, d'imaginer une forme de vie parfaitement fonctionnelle qui utilise les acides aminés D plutôt que les L.  [...] Tout d'abord, d'un point de vue historique, cette découverte que la plupart des acides aminés contenus dans les protéines sont de la même forme (à part la glycine qui est achirale) est relativement récente. Ce n'est qu'à partir du début des années 1930, grâce aux travaux de Dorothy Jordan Lloyd (1889-1946), qu'on commence à trouver dans la littérature scientifique des phrases du style.  [...]

[Biochimie] le pH d'un peptide!!!

salut j'ai vraiment une question qui me fait tordre je veut savoire comment calculer le pH d'un peptide à partire des pKa de ces acides aminés s'ils vous plait aider moi.  [...] Donc faut que tu dessine ta protéine avec ses différents acides aminés en fonction des pKa que tu connais.. puis après tu repères ta forme zwitterion et tu prends le pKa de la forme juste avant et celle juste après, tu fais la somme et tu divises par 2.Et voilà ton pHi.  [...]

Immunohisto

Le paraformaldehyde (PFA) sert a fixer ton echantillon. C'est un fixateur chimique, un agent pontant, qui va creer des liens covalents entre les proteines en particulier entre les amines libres. L'interet est multiple. 1-l'echantillon, le tissu, reste dans l'etat ou tu l'a fixe l'histologie et la cytologie sont conserves, 2-il n'y a plus degradation des elements cellulaires donc les antigenes a detectes sont preserves, 3-le tissus peut etre plus facile a couper si tu le fixe avant la coupe.  [...] Les anticorps peuvent alors reconnaitre des epitopes conformationnels (par exemple, un motif d'acides amines regroupes spatialement mais eloignes sur la sequence, ou bien des boucles...). Cette structure spatiale n'a pas forcement la meme forme en fonction du tissu, puisque la proteine cible n'est pas forcement la meme exactement (glycosylation, phosphorylation, acylation...etc...).  [...]

Origine de la chiralité

Mais à l'origine, il n'y avait pas de raison qu'une molécule asymétrique, tel qu'un acide aminé, par exemple, ne présente pas ses 2 énatiomères en quantités égales. Et donc, comment se fait-il aujourd'hui que tous les acides aminés naturels soient uniquement L (levogyres) Ou, de la même façon pourquoi l'ADN forme une hélice alpha et non beta Je ne sais pas si c'est clair.  [...] Enfin tous les acides aminés ne sont pas d'une forme énatiomériquement pure, car il est possible de retrouver des acides aminés sur des corps célestes par exemple, et sauf futur grand titre de la presse scientifique, ils sont alors... racémiques.  [...]

[Biochimie] Acides aminés

Quelques exemples. - les acides aminés sont plus répandus sous la forme (énantiomère) L que sous la forme D. l'occurrence de L-acides aminés est donc plus importante que celle des D-acides aminés.  [...] Il me semble que cette question de pourcentage est relative à la fonction des protéines et donc à leur structure (primaire en l'occurrence hihi). En effet, si tu regardes la composition et l'encombrement de certains acides aminés, tu dois t'apercevoir qu'ils seront plus faciles à synthétiser, à transporter, à dégrader ou à recycler pour la cellule que d'autres.  [...]

Chromatographie échageuse d'ions

Il est indiqué que le pH est trés basique, par conséquent les acides aminés chargées (Lysine et arginine) seront sous forme déprotonée et puisqu'ils contiennent respectivement une fonction amine et guanidine, on obtiendra NH2. Or dans la correction il est noté que ce peptide est retenu par une résine échangeuse d'anions.  [...] Ici tu dis que le pH est très basique, donc supposément très élevé et sans doute supérieur au pI. Du coup on suppose que les acides aminés sont chargés négativement.  [...]

nutriments et conséquence

Mais pas seulement. dans certains cas, surtout pour les enzymes (les protéines qui jouent le rôle de catalyseur) mais pas seulement, des cofacteurs se rajoutent à l'apoprotéine (l'édifice d'acides aminés) pour former l'holoprotéine qui a la fonction désirée.  [...] Je devrais demander à un biochimiste si les acides aminés ne se dégradent pas spontanément (désamination) ce qui nécessite un apport constant et un renouvellement (bref, il faudrait que je demande pourquoi on ne peut pas fonctionner en recyclant indéfiniment les mêmes acides aminés).  [...]