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[Biologie Moléculaire] Charge des acides aminés

Bonjour, je suis en Paces et en biochimie on nous apprend que les acides aminés basiques sont chargé + et les acides aminés acides sont chargés - et j'aimerais comprendre pourquoi, pour moi c'est l'inverses les acides étant capables de céder un ou plusieurs proton H+ Ils devraient être chargés positivement. Merci beaucoup.  [...] Les acides aminés chargés + ont pour la plupart un groupe aminé -NH2 supplémentaire. Cette fonction est basique et capte les protons sous forme NH3+.  [...]

[Génétique] Myoglobine

Mes documents pour m'aider sont la représentation en 3D de cette molécule et la comparaison d une partie de la séquence des acides aminés de la myoglobine de quelques vertébrés.  [...] ..) et/ou des liaisons covalentes de type ponts disulfures (entre deux cystéines). Finalement, c'est bien la séquence en acides aminés qui va conditionner la prise de forme, c'est-à-dire la structure 3D.  [...]

[Biochimie] Acides amines / proteines

Par contre, le fait que nos acides aminés soit tous D ou tous L, ça n'a probablement été qu'une histoire de hasard, puisque rien empêche, dans l'état actuel de nos connaissances et jusqu'à preuve expérimentale du contraire, d'imaginer une forme de vie parfaitement fonctionnelle qui utilise les acides aminés D plutôt que les L.  [...] Tout d'abord, d'un point de vue historique, cette découverte que la plupart des acides aminés contenus dans les protéines sont de la même forme (à part la glycine qui est achirale) est relativement récente. Ce n'est qu'à partir du début des années 1930, grâce aux travaux de Dorothy Jordan Lloyd (1889-1946), qu'on commence à trouver dans la littérature scientifique des phrases du style.  [...]

Origine de la chiralité

Mais à l'origine, il n'y avait pas de raison qu'une molécule asymétrique, tel qu'un acide aminé, par exemple, ne présente pas ses 2 énatiomères en quantités égales. Et donc, comment se fait-il aujourd'hui que tous les acides aminés naturels soient uniquement L (levogyres) Ou, de la même façon pourquoi l'ADN forme une hélice alpha et non beta Je ne sais pas si c'est clair.  [...] Enfin tous les acides aminés ne sont pas d'une forme énatiomériquement pure, car il est possible de retrouver des acides aminés sur des corps célestes par exemple, et sauf futur grand titre de la presse scientifique, ils sont alors... racémiques.  [...]

[Biochimie] le pH d'un peptide!!!

salut j'ai vraiment une question qui me fait tordre je veut savoire comment calculer le pH d'un peptide à partire des pKa de ces acides aminés s'ils vous plait aider moi.  [...] Donc faut que tu dessine ta protéine avec ses différents acides aminés en fonction des pKa que tu connais.. puis après tu repères ta forme zwitterion et tu prends le pKa de la forme juste avant et celle juste après, tu fais la somme et tu divises par 2.Et voilà ton pHi.  [...]

ADN et protéines

La forme et la composition de cette poche est essentielle (et spécifique à la protéine). Un seul acide aminé modifié peut faire perdre toute activité à la protéine (par exemple les sites à cystéines actives ou à acides aspartiques...).  [...] 4. La mutation de l'ADN se passe sur un codon d'un acide aminé impliqué dans le repliement de la protéine. Pour fonctionner, les protéines doivent se replier sous une forme très spécifique appelée structure tertiaire. Certains acides aminés clés sont impliqués dans ces repliements (cystéines pour les ponts disulfures, liaisons ioniques avec acides aminés chargés, liaisons H.  [...]

Immunohisto

Le paraformaldehyde (PFA) sert a fixer ton echantillon. C'est un fixateur chimique, un agent pontant, qui va creer des liens covalents entre les proteines en particulier entre les amines libres. L'interet est multiple. 1-l'echantillon, le tissu, reste dans l'etat ou tu l'a fixe l'histologie et la cytologie sont conserves, 2-il n'y a plus degradation des elements cellulaires donc les antigenes a detectes sont preserves, 3-le tissus peut etre plus facile a couper si tu le fixe avant la coupe.  [...] Les anticorps peuvent alors reconnaitre des epitopes conformationnels (par exemple, un motif d'acides amines regroupes spatialement mais eloignes sur la sequence, ou bien des boucles...). Cette structure spatiale n'a pas forcement la meme forme en fonction du tissu, puisque la proteine cible n'est pas forcement la meme exactement (glycosylation, phosphorylation, acylation...etc...).  [...]

[Biochimie] Acides aminés

Quelques exemples. - les acides aminés sont plus répandus sous la forme (énantiomère) L que sous la forme D. l'occurrence de L-acides aminés est donc plus importante que celle des D-acides aminés.  [...] Il me semble que cette question de pourcentage est relative à la fonction des protéines et donc à leur structure (primaire en l'occurrence hihi). En effet, si tu regardes la composition et l'encombrement de certains acides aminés, tu dois t'apercevoir qu'ils seront plus faciles à synthétiser, à transporter, à dégrader ou à recycler pour la cellule que d'autres.  [...]

Chromatographie échageuse d'ions

Il est indiqué que le pH est trés basique, par conséquent les acides aminés chargées (Lysine et arginine) seront sous forme déprotonée et puisqu'ils contiennent respectivement une fonction amine et guanidine, on obtiendra NH2. Or dans la correction il est noté que ce peptide est retenu par une résine échangeuse d'anions.  [...] Ici tu dis que le pH est très basique, donc supposément très élevé et sans doute supérieur au pI. Du coup on suppose que les acides aminés sont chargés négativement.  [...]

[Biologie Moléculaire] Génotypage--pcr

Il existe au sein des populations d'ovins différentes formes de PrP non pathologiques. En fonction de la structure de leur gène PrP, on s'est aperçu que les moutons ne développaient pas de la même manière la maladie. Ce qui distingue ces différentes formes de PrP entre elles, c'est la nature de trois acides aminés que l'on trouve aux positions 136,145 et 171 et que l'on désigne sous leurs initiales.  [...] je dois faire un criblage de genotypes résistants.j'utilise le gène Prp d'une chaine de 253 acides aminés.j'ai tenté de diluer l'échantillon et d'ajouter de la taq polymérase mais le groupe arr/arr n'est pas formé.l'appareil n'arrive pas à grouper les memes génotypes ensembles.  [...]