• Forum - Facteurs, Séquence, Consensus

[Génétique] Adn et arn

Oui effectivement ce schéma est un peu bizarre, le brin retardé est reconnu par le fait que ce soit de petit fragments d'ADN en discontinu (et donc comporte plusieurs amorces), alors que le brin avancé est en continu et ne comporte aucune discontinuité (et donc comporte une seul amorce).   [...] c'est l'arn plyerase 2 qui va detecter la sequence consensus a la region -35 et se fixé sur elle puis il a le facteur tf2 D qui va se lier a cette sequence puis les facteurs TF2 A, B,D, H.  [...]

biologie cellulaire, transcription ARN

Dans la réplication de l'ARN, on sait que ( pour la séquence TATAAA), des facteurs de transcriptions généraux vont se fixer sur la séquence type consensus et que l'ARN polymérase va commencer la transcription 30 AA plus loin. Jusqu'ici j'ai compris.  [...] Ce sont donc les facteurs spécifiques de la transcription qui permettent en partie l'expression des gènes selon les conditions données dans laquelle la cellule se trouve.  [...]

[Biologie Moléculaire] Site d'initiation de la transcription

Je sais que vers le -10 se trouve normalement la TATA box, séquence consensus permettant la mise en route de la transcription. l'arn polymérase ouvre alors la double hélice d'adn et débute son travail (après avoir recruter tous les facteurs de transcription).  [...] ..). S'il y a utilisation d'un point +1 en amont du promoteur considéré, alors ce promoteur est transcrit (dans ce cas là on ne dit pas que c'est un promoteur, c'est juste une séquence faisant partie de l'unité de transcription débutant par le point +1 considéré).  [...]

épissage alternatif VS épissage complet

Pour l'épissage alternatif tout va dépendre des facteurs d'épissage et des snARN + hnRNP car ce sont eux qui contrôle l'épissage mais aussi des séquences consensus de l'épissage qui sont le site donneur, le site accepteur, le site de branchement et la séquence polypyrimidique.  [...] Si par exemple tu as une mutation au niveau du site donneur (ou autre site consensus) celui-ci ne sera pas reconnu par les snARN et donc ton exon sera épissé.  [...]

séquence consensus

Une séquence consensus peut etre proteique ou nucleique, c'est une sequence que tu retrouves dans plusieurs genes ou proteine par ex et qui a la même fonction ex la Tata box. tataa.  [...] Il y aussi dans cette région du génome des motifs palindromiques qui sont reconnus par les Dam-méthylase pour méthyler certaines bases. D'ou la relative conservation de cette séquence quand on la compare entre différentes espèces de bactérie (on peut donc en déduire une séquence consensus entre toutes ces séquences).  [...]

Mutation?!

Je suis un peu à l'ouest depuis quelques jours, mais là je ne comprends pas... Une séquence consensus est une séquence qui regroupe les bases les plus fréquemment rencontrées dans les cas de plusieurs possibilités... Or, j'ai l'impression qu'ici tu utilises le mot polymorphisme pour parler de variabilité. Ai-je raison.  [...] Eh ben, effectivement, je croyais qu'une séquence consensus, était la même séquence partout, or ce n'est pas le cas d'après ce que m'as dit, donc il y a un polymorphisme si on veut d'un promoteur a un autre.  [...]

[Biologie Moléculaire] Technique SELEX aidez moi!

A la fin vous allez récupérer des fragments que vous souhaitez identifier. Ce que vous savez à priori c'est qu'ils vont tous être similaires à priori avec de petites variations. Ce que vous souhaitez c'est établir une séquence consensus de fixation de votre protéine.  [...] Vous allez donc avoir une collection de fragments identifiés qui vont vous permettre de déterminer une séquence consensus de fixation.  [...]

regulation de l'expression genique

Une séquence consensus est une séquence obtenue à partir des brins obtenus par différents cycles de PCR. on fait alors une étude statistique pour savoir quel est le brin qui revient le plus souvent, et ainsi limiter les erreurs. Ceci est utilisé en paléogénétique par exemple, lorsqu'on utilise du matériel génétique assez vieux, et qu'il se peut qu'il y ai des erreurs de réplication.  [...] Il s'agit effectivement probablement de primer, ce sont de courtes sequences d'ADN utiliser pour la PCR. Ils permettent d'encadrer, limiter la zone d'ADN a amplifier.  [...]

[Génétique] promoteur??

Les promoteurs des gènes des procaryotes sont pour la plupart situés en 5' (ou en amont) du site +1 d'initiation de la transcription. Ces promoteurs ne sont donc pas transcrits. La comparaison des séquences des promoteurs de nombreux gènes de procaryotes (E.  [...] une séquence de six nucléotides riche en A et T. La séquence dite consensus (statistiquement la plus rencontrée) est TATAAA. Cette boîte fixe un facteur général de transcription appelé TFIID (TF. facteur de transcription. II pour l'ARN polymérase II). Ce facteur est absolument nécessaire pour l'initiation de la transcription.  [...]

[Biologie Cellulaire] question sur les séquences consensus

je suis en PCEM1 et pendant le cours, nous avons évoqué les séquences consensius. Il nous a été dit que l'on pouvait alors déterminer tout les récepteurs GABA mais aussi autre chose que je n'ais pas entendu. J'ai fait des recherches sur le net et je n'ais rien trouvé sur le sujet, j'espère que vous pourrez m'aidez car ce chapitre de biologie cellulaire est l'un des plus gros pavet que l'on a à étudier cette année.  [...] Une séquence consensus est une séquence moyenne qui résulte de la comparaison d'un grand nombre de séquence dont la fonction est identique.  [...]