• Forum - Extraction, ADN, Espèce

identification bactérienne en qq heures

Techniquement il doit etre possible de créer des amorce PCR spécifique d'une espèce bactérienne, que se soit sur le 16S ou même des marqueurs alternatifs type ARN polymérase. Et là on évite les problèmes de prélevement polymicrobien. Si on met bout a bout la PCR (3H), une étape de restriction enzymatique pour vérifier si on a le bon fragment (1H) et le gel d'électrophorèse pour voir tout ça (1H) ca fait 5H.  [...] En effet, comme il l'a déjà été dit, il faut savoir quelle espèce on recherche, un peu comme un test par immunodetection. De plus les conditions de PCR directement sur colonie ou milieu liquide (sans extraction d'ADN) sont souvent variables d'une espèce à l'autre.  [...]

problème de mucilage

S'il vous plait est que quelqu'un me redondera sur l'extraction ADN de l'espèce opuntia ficus indica,cactus, au problème de mucilage comment.  [...] je peux débarrasser cette matière en cours de broyage.   [...]

[Microbiologie] dégradation de l'ADN

1) j'ai constaté que L'adn de la Mycoplasma se dégrade rapidement, j'ai respecté le protocole d'extraction de l'adn mes réactifs sont en bon état je soupçonne l'interférence de la mutation de la souche dans ça est il possible de considérer que les mutations et/ou la présence d'une activité exonucléasique chez la souche soient impliqués dans la dégradation de l'ADN.  [...] merci d'avoir répondu à mes questions, mais maintenant on doit se focaliser sur la dégradation D'ADN presque tous mes collègues rencontrent le même problème pour la souche Mycoplasma meleagridis sachez qu'on travaille dans les normes, je ne sais pas franchement à quoi est dû spécialement pour cette espèce, je me suis posée la question % à la présence de Dnase mais si c'étais le cas ça ne marcherait pas pour toutes les espèces aidez moi s'il vous plaît sachant qu'on utilise la méthode d'extraction d'adn au phénol chloroforme.  [...]

PCR sur pseudomonas aeruginosa

), extraire l'ADN avec phénol et chloroforme, extraire l'ADN en rajoutant une étape avec du CTAB tout en ayant déjà testé certains kit d'extraction commo le DNeasy tissue kit de QIAGEN...Le problème touche uniquement Pseudomonas aeruginosa dont l'ADN semble se détériorer avec le temps mais on ne parvient pas à trouver un meilleur protocole d'extraction d'ADN.  [...] Je ne suis pas du tout spécialiste de l'extraction d'ADN bactérien mais ça m'étonne qu'une espèce particulière pose problème.  [...]

[Biochimie] extraction de l'adn

je travail sur une maniulation de l'extraction de l'ADN à partir des annélides (ver de terre aquatique), j'ai trouvé plusieurs protocoles sur internet et sur des bouquin, j'aimerais savoir si le protocole pour une plante est identique à une espèce animale.  [...] Le problème est que j'avais une extraction foireuse car mes protéines étaient partiellement dénaturé, donc l'ADN, je ne sais pas si c'est aussi fragile.  [...]

rDNA ou rRNA?

L'amplification a partir du rDNA me semble avoir plus d'avantage qu'a partir du rRNA. L'ADN est plus stable, moins degradés, ensuite il n'y a pas de RT necessaire, une etape en moins, sans parler de l'extraction d'ADN qui est souvent plus facile a faire.  [...] Sinon pour l'extraction, par exemple pour un profiling de bacteries, lorsque tu veux determiner quelles especes sont presentes a tel endroit, en fait tu extrais l'ADN total de tes bacteries, et apres tu fais une PCR (amplification de l'ADN) avec des amorces universelles des 16S des bacteries.  [...]

protocole d'extraction d'ADN

oui j'ai essayé mais ce que je trouve c des these de doctorat et la partie qui m'interesse il parle brievement de l'extraction d'ADN on a utulisé pour l'extraction la methode X... et quand je cherche la methode je n'y trouve rien, je vais ressayer encore une fois si je tombe sur quelque chose.  [...] Tout ce qui s'appelle miniprep midiprep ou maxiprep correspond à une extraction d'ADN plasmidique. Le lien que vous proposez est une méthode de miniprep. Il ne vous intéresse donc pas si vous cherchez à purifier l'ADN génomique.  [...]

demande d'infos!!! extraction de l'ADN

j'ai pas une question. plutot une demande... je ne sait pas si quelqu'un pourra m'envoyer un document complet concernant l'extraction de l'ADN, avec le principe de chaque étape, pourquoi chloroforme pourquoi phenol.  [...] L'extraction d'ADN est au programme au lycée en seconde, et c'est une manip qui est faite à la fac donc si dans google tu tapes TP extraction ADN tu devrais trouver ce que tu veux.  [...]

recherche d'un contact par mail avec un laborantin

j'ai l'impression que tu n'as pas bien compris à quoi servait l'électrophorèse. Si tu essaies de faire migrer ton ADN brut d'extraction tu n'obtiendras rien d'intéressant. Il te faut d'abord le découper en morceaux (enfin, c'est une des méthodes possibles) à l'aire d'enzymes qui coupent en certains sites bien particuliers.  [...] Le plus long est l'étape d'extraction de l'ADN, car il faut un temps d'attente d'une nuit (environ 16h). Puis l'extraction en elle même n'est pas spécialement longue (2-3h). Dans mon ancien labo, on préférait que l'ADN se re-suspendre après purification sur la nuit également, à 4°C, mais cela n'est pas obligatoire.  [...]

Possible de faire une extraction d'ADN puis PCR sur E.coli ou entérocoques

pensez vous que une extraction d'ADN sur des bactéries E.coli et entérocoques contenus dans une eau de la Seine est possible Puis la mise en place de la méthode PCR sur celles-ci pour démontrer leur présence.  [...] Si on veut détecter une bactérie, une espèce, une sous espèce de façons spécifique oui on peut faire de la PCR, mais entre l'extraction, la PCR et son interprétation, c'est plus complexe.  [...]