• Forum - Exposé, Interactions, ADN, Protéines, UV

UV footprinting

Je prépare un exposé sur les intéractions ADN-protéines et plus précisément sur les footprinting par UV.  [...] Si mes sources sont bonnes, la T4 endonucléase V clive l'ADN au niveau des dimère cyclobutyliques de thymines grâçe à ses activités glycosylases et AP lyases.  [...]

dangerosité des ultraviolets

Comment agissent les UV sur l'ADN Celui-ci est formé de deux brins enroulés en hélice. Chaque brin est un assemblage de bases, nommées adénine, thymine, guanine et cytosine, reliées entre elles par des liaisons chimiques fortes. Les deux brins d'ADN sont liés par des interactions faibles, et non des liaisons fortes, car il est nécessaire qu'ils puissent se séparer pour que les gènes s'expriment.  [...] Quelle en est la raison Les rayons UV A changent la structure électronique des bases, c'est-à-dire l'organisation de leurs nuages d'électrons autour des atomes. L'ADN passe alors dans un état dit excité, favorisant les réactions chimiques entre les bases, notamment la dimérisation des thymines.  [...]

photoréactivation

Bonsoir à tous, puisque la photoréactivation a été perdue chez nous, comment arrive-t-on à réparer les dommages causés à l'ADN si on a été exposé au UV et qu'on a formé des dimères de pyrimidine.  [...] Par un mécanisme de réparation de type NER (non spécifique des dimères) par exemple, via des protéines particulières du TF2H.  [...]

[Biologie Cellulaire] La cellule mystère.... - Page 11

Donc c'est l'ADN en lui même (nucléotides) qui est fluorescent, non Et donc les petits points lumineux autour seraient des nucléotides Ca me parait un peu gros mais en même temps je suis pas un pro.  [...] Non ce qui est imporant ce sont les lignes lumineuses. Le reste c'est du bruit de fond. Mais regardes... est ce que tu crois que c'est commun de l'ADN linéaire comme ça Ne connais tu pas une technique qui permette d'obtenir cette linéarisation (j'en ai trop dit).  [...]

[Biologie Cellulaire] transfection

le séquençage étant bon, je pouvais à présent transfecter mes cellules, et donc j'ai préparé des midipreps pour transfecter et là je découvre que je n'ai rien, mon stockage devait être mauvais ou pour une autre raison que j'ignore, mes bactéries ne servaient plus à rien, tout ce que j'avais c'était mes minipreps de départ, alors j'ai lancé ma transfection avec mes minipreps, sachant que le protocol d'extraction des mini differe de celui des midi je ne sais pas ce que ça va donner y en a t il parmis vous qui s'y connaissent.   [...] pas top). De plus, le plasmide n'est généralement pas très concentré. enfin, tu peux vérifier tout ces paramètres en dosant au nanodrop (ou lecture de l'absorbance dans l'UV et proche UV) avec le rapport 260/280 (protéine/ADN).  [...]

Polymérases infidèles....

Un autre exemple. la fumée de clope. Les composés de cette fumée sont souvent aromatiques et se fixe sur l'ADN par interaction hydrophobe, on appelle ça des adduits. Ca fait une sorte de protusion sur l'ADN et la polymérase de base va là aussi bugger. Donc il y a intervention d'une polymérase mutagène, la polymérase kappa il me semble, qui va passer ce dommage au prix de mutation.  [...] Si j'ai bien compris ce type de polymérase intervient lorsque l'ADN ne peut être réparé ad integrum, évitant l'apoptose. moins fidèles certes mais plus enclines à passer outre les anomalies déjà existantes sur le brin matrice.  [...]

les longues années (3.5 milliards!) qui ont abouti à l'évolution d'une B à une ArchB?

Même si des êtres vivants se multiplient sans contraintes significatives, les erreurs non réparées de réplication de l'ADN provoquent quand même des mutations. Pour le soleil, cela dépend de la dose d'UV reçue.  [...] Les mutations se font très bien même sans UV, pour preuve la grosse majorité des cancers dont la cause est connue n'a rien à voir avec les UV. N'importe quelle molécule interagissant fortement avec l'ADN est susceptible de provoquer des mutations. Les mutations peuvent même se produire complètement par hasard, sans cause externe.  [...]

Longueur d'onde et temps d'exposition radis

Pour mon tpe sur les UV et l'ADN, on aimerait irradier des graines de radis aux uv pour ainsi avoir des radis difformes.  [...] le temps n'est pas important, c'est la quantité de rayonnement fournie qui compte (donc ça dépend de la source). il faudra évidement faire des essais dans une gamme large (0, 1min, 5 min, 1h, 5h...etc).   [...]

[Divers] Un agent mutagéne: les ultraviolets ! Aide ?

Les mécanismes de réparation fonctionnent chez tout le monde. Mais ce n'est pas ça l'universalité du code. L'universalité du code est démontrée par le fait que si j'introduis un gène humain codant pour la protéine tartampion dans E. coli, il sera transcrit et son ARNm donnera la même protéine que chez l'Humain.  [...] D'ailleurs, c'est là que c'est marrant avec le code génétique des mitochondries (exception à l'universalité du code génétique). lorsque l'on a essayé de produire des protéines proprement mitochondriales dans E. coli, on s'est cassé les dents parce qu'il fallait ré-éduquer les bactos pour lire le code mitochondrial correctement.  [...]

bronzage

une exposition au soleil (rayon UV) de la peau induisent une mutation de l'ADN, cette mutation est repéreé par des systeme de reparation.  [...] Cholestérol de la peau + rayons UV = vitamine D. Si c'était si simple... La synthèse de la vitamine D débute à partir d'un précurseur du cholestérol qui est le 7-déhydrocholestérol qui subit une transformation chimique sous l'action des UV qui donne le cholécalciférol.  [...]