• Forum - Exercice, Enzyme, Coupe

[Biologie Moléculaire] electophorese des fragements d'ADN

apres electophorese des 2 genes A et B on obtient le profil 1 alors je vois que dans le profil 1 on a migration de 2 fragement de gene B ça veut dire on a déja subit l'ADN a une enzyme de restriction qui a coupé B mais pas A (alors que ça n'est pas indiqué dans l'exercice).  [...] dans le profil 1 on a migration de 2 fragement de gene B ça veut dire on a déja subit l'ADN a une enzyme de restriction qui a coupé B mais pas A (alors que ça n'est pas indiqué dans l'exercice).  [...]

[Biochimie] Enzyme de restriction

Je voulais avoir une petite précision sur les enzymes de restriction. Dans mon exercice j'ai un tableau avec différentes enzymes de restriction et les séquences clivées correspondant a chaque enzyme. Cela veut dire que si j'ai par exemple pour une enzyme X, la sequence clivee.  [...] Du coup si on nous dit qu'une enzyme coupe la séquence 5'CCCAAA en son milieu, elle coupera aussi une séquence 5'AAACCC (vu qu'elle coupe 3'AAACCC) ou elle différenciera une paire de base AC d'une paire de base CA dans le grand sillon.  [...]

microbiologie - CARTE DE RESTRICTION

digestion de restriction. certaines protéines sont capables de couper l'ADN à des endroits bien précis (par exemple. gaa. ttc). Ce sont les enzymes de restriction. Dès que l'enzyme trouve son site, elle coupe l'ADN comme tu couperais un bout de ficelle avec un ciseau.  [...] La somme des tailles des fragments obtenus doit donner la taille du plasmide initial. Si ce n'est pas le cas, il faut penser à des sites qui donnent des fragments différents mais de même taille. Par exemple, si tu obtiens 1 seul fragment dont la taille est la moitié de la taille du plasmide, ça veut dire que l'enzyme a coupé 2 fois pile-poil au milieu (les sites sont à six heures et midi ).  [...]

plasmide -digestion par enzymes de restriction

Je suis désolée mais je comprends pas ce que je dois faire... J'ai bien compris que si on coupe un plasmide circulaire via une enzyme de restriction il devient linéaire mais les extrémités c'est quoi.  [...] d'accord, je regarderais dès que ce sera validé. Après, si tu as besoin d'exercices, je peux t'en proposer par mail si tu as besoin d'entrainement.  [...]

Plasmide recombinant

J'ai un petit problème en génétique, alors dans plusieurs exercices on me demande de faire la carte de restriction d'un plasmide, suite une simple et ensuite une double digestion, là c'est bon, mais après quand on me dit qu'on hybride le plasmide recombiné après la double digestion avec une sonde formée par l'ADN copie, alors ici j'arrive même pas à comprendre d'ou provient cet ADN copie, autrement dit il est la copie de quel ARNm au juste et puis on me donne la taille des fragments obtenus (après hybridation) et on demande de trouver la taille du fragment et ou il est placé.  [...] Ton plasmide a été coupé par deux enzymes de restriction différentes, on ligue ensuite un insert. S'il s'agit d'une rétrotranscription d'un ARNm, on parle d'ADN complémentaire et pas d'ADN copie. Pour la compréhension de ton exercice, je pense qu'on s'en fiche de savoir d'où vient cet ADN à liguer.  [...]

[Biochimie] RFLP et application !

Tu as 2 allèles ayant au moins un nucléotide muté dans la séquence et qui se trouve avantageusement dans un site de coupure d'une enzyme de restriction, EcoR I si j'arrive à bien décrypter. Donc dans un cas, l'enzyme peut couper ce site, dans l'autre non.  [...] - Si elle coupe, là y a probléme, quand on a 2 bandes, je me suis dite que peut être ça représente les fragments issus justement de la coupure. mais quand l'enzyme coupe et on a une bande hétérozygote.. comment c'est possible.  [...]

[Génétique] clonage orienté ou non

Comme on le voit ici, cette enzyme coupe spécifiquement les sites methylés. Cette methylation ne survient qu' in vivo dans les organismes vivants. Donc dans une PCR faite sur un plasmide seul ce dernier est methylé. Vous ne coupez que le plasmide et ne conservez que votre fragment de PCR.  [...] Oui mais si ton site de clonage est bclI tu dois etre dans une souche dam-dcm- sinon ton enzyme ne coupe pas. Maintenant dans ce cas la, la technique a la DpnI ne marchera pas.  [...]

[Génétique] Principe de la technique RFLP

Bon tout d'abord un fragment de restriction est un morceau de DNA qui a été coupé par un enzyme de restriction (enzyme coupant le DNA).  [...] La majorité de ces enzymes coupent le DNA une fois qu'ils ont reconnu une séquence particulière dans celui ci (par exemple l'enzyme EcoR1 coupe dès qu'il repère la séquence GATC).  [...]

enzymes de restriction

1) exemple avec l'enzyme BamHI qui coupe dans la séquence 5'-G*GATCC-3'. L'enzyme va couper la liaison covalente phosphodiester entre les 2 G de la séquence et va laisser un groupe phosphate 5' exposé et un groupe hydroxyle 3' en retrait. On parle alors d'une extrémité collante 5' (5' cohesive ends, ou 5' overhang ou surplomb 5').  [...] 2) exemple avec l'enzyme Sac I qui coupe dans la séquence 5'-GAGCT*C-3'. L'enzyme va couper la liaison phosphodiester entre le T et le C de la séquence et va laisser un groupe phosphate 5' en retrait et un groupe hydroxyle 3' exposé. On parle alors d'une extrémité collante 3' (3' cohesive ends, ou 3' overhang ou surplomb 3').  [...]

[Biologie Moléculaire] Marqueurs dominants et codominants

Prenons un exemple simple, une enzyme de restriction qui coupe au site de restriction A.  [...] l'enzyme de restriction coupe au niveu du site de restriction et doit générer 2 fragments de restrictions pour le homozygotes et les hétérozygotes.  [...]