• Forum - éthanol, Liaisons, Migration

Sds Page

après traitement au SDS, detergeant anionique, les protéines sont uniformément chargées negativement et migrent donc en fontion de leur poids moléculaire uniquement. Mais peut on dire qu'elles migrent aussi en fonction de leur forme.   [...] Le traitement au Beta mercapto ethanol se fera pour rompre les liaisons dissulfure et permettre ainsi une bonne migration.  [...]

Biochimie : Pourquoi a-t'on besoin d'éthanol pour extraire le fructose du citron?

En fait l'ajout d'éthanol va changer/déséquilibrer la charge en électrolytes du mélange. Comme il y a moins de liaisons ioniques avec les phosphates de la molécules d'ADN, cela va changer la solvatation de l'ADN. S'ajoute par-dessus la polarité inférieur de la molécule d'éthanol qui modifie les liaisons hydrogènes et polaires du mélange, ce qui change encore la solvatation de l'ADN.  [...] .et dans ce cas, si les ions Na+ viennent se lier au charges négatives de l'ADN, je comprends que ce dernier ne puisse plus effectuer de liaisons hydrogènes avec le solvant.. Et donc, ça aurait pu fonctionner avec de l'eau aussi, mais puisque, comme vous le précisez, le moment dipolaire de l'éthanol est inférieur, alors l'ADN précipitera encore plus facilement dans ce solvant..c'est bien cela.  [...]

[Biologie Moléculaire] altération des ponts disulfures dans des anticorps

alors voila ma question, est-ce que les ponts disulfures d'un anticorps (igG) peuvent être altérés par le SDS ou le SLB 4X utilisés pour une migration SDS-PAge.  [...] Le SDS supprime les liaisons non-covalentes. Pour les ponts disulfures on peut utiliser du ²-mercapto-éthanol.  [...]

[Biochimie] [electrophorese] La premiere dimension de l'electrophorese bidimensionelle

Est il routinier de separer au prealable les sous unités par SDS + eventuel B-mercapto ethanol, ou bien la separation [disons uniquement pour l'instant] des liaisons faibles se fait automatiquement dans la premiere dimension.  [...] Retour à notre portéine dimérique à liaisons faibles... C'est à dire des liaisons type Van Der Waals, je suppute, parce qu'avec des liaisons ioniques, ce n'est pas problématique (une sous-unité plus chargée va continuer de migrer pendant que l'autre s'arrête là où elle devient globalement neutre / isoélectrique).  [...]

Les glycérophospholipides

Et c'est le cas de nombreuses autres molécules non-chargées. l'éthanol, le glucose, l'urée, etc. Toutes ces espèces en ont commun le fait de posséder des fonctions chimiques capables d'établir des liaisons faibles avec l'eau (liaison H ou interactions dipôle-dipole ou charge-dipôle essentiellement).  [...] Dans le cas de la phosphatidyléthanolamine, ce sont les fonctions phosphates et ammoniums (ainsi que l'ester) qui vont conférer l'hydrophilie a cette molécule.  [...]

Conversion du monoxyde de carbone en bioéthanol, cas d'une aciérie.

Pour produire de l'éthanol à partir de CO ou de CO2 il faut forcément apporter de l'énergie, cette même énergie qui est d'ailleurs libérée à la combustion de cet alcool et qui correspond à la nature des liaisons. Il faut arrêter de croire au miracle.  [...] Non, il s'agit de thermodynamique de base. Une modification de liaisons atomiques entraine forcément une différence d'énergie, ici il faut en apporter pour produire de l'éthanol. De la même façon que la masse l'énergie se conserve toujours.  [...]

[Biologie Moléculaire] Transcription in vitro de sondes ARN marquées

Enfin bon, je lance ma transcription et j'ai des super rendements, les DO sont impeccables. Par contre à la migration de ces ARN après purification (lithium/ethanol) je vois des smears, et quelques bandes secondaires apparaitre. Le poids moléculaire de mes transcrits est aussi plus haut qu'attendu (peut-être à cause de la DIG ou de la biotine ).  [...] J'ai pourtant dénaturé mes échantillons 10min à 70°C (puis glace) avant l'électrophorèse. Il faudrait donc carrément faire une migration en agarose + formaldehyde.  [...]

[Divers] Contenu "Matériels et méthodes" - rapport stage M1

Les extraits protéiques sont dénaturés à 95°C pendant 5 minutes en présence de LSB 1X final avant d'être déposés sur un gel de polyacrylamide dénaturant à 6%. Les immunoprécipitations sont dénaturées à 95°C pendant 5 minutes dans 25 µl de LSB 2,5X. Après migration électrophorétique, les protéines sont transférées en milieu liquide sur une membrane de nitrocellulose (HybondTM C Extra, Amersham Bioscience) pendant 1h30 dans un tampon de transfert (50 mM Tris base, 40 mM Glycine, 1,3 mM SDS et 10% éthanol).  [...] En tout cas le matériel et méthodes doit être universel par rapport à tes manips. Si tu as fais varier plusieurs paramètres d'une manip au cours de ton stage, tu mets le protocole qui a marché dans M&M de la façon la plus concise qui puisse exister, et après tu discute des différentes optimisations et changements protocolaires dans la partie résultats.   [...]

Différence de fixation des cellules

Bref, tout ca pour vous demandez si vous savez pourquoi on observe une telle différence entre les deux fixations, pouvant expliquer ce que j'ai pu observer. Je sais que le PFA crée des liaisons covalentes entre les cellules, et que l'ethanol aura plutôt tendance à coaguler par deshydration les protéines, mais je sais pas pour autant expliquer ce résultat.  [...] Avec le methanol, la fixation s'effectue par deshydradation (denaturation des proteines) alors qu'avec les aldehydes (formaldehyde, glutaraldehyde) on conserve la structure 3D de la proteine (fixation par pontage). Donc effectivement, si tu utilises un anticorps conformationnel, la detection de ton antigene sera impossible apres une fixation en methanol.  [...]

[Génétique] Principe de l'extraction d'ARN???

Pour simplifier les ARN sont retenus essentiellement par des laisons hydrogènes. La silice réagit plus ou moins selon la teneur en eau du milieu (d'où l'utilisation d'éthanol). Pour réactiver une silice on la charge en eau d'où l'élution finale de l'ARN dans l'eau qui la libère de l'ARN en remplaçant les liaisons H silice-ARN par des liaions H silice-eau.  [...] Cependant d'autres liaisons peuvent intervenir Van der Walls ou polaires mais négligeables je pense surtout que les charges des acides nucléiques sont neutralisées dans les tampons.  [...]