• Forum - Enzymes, Restriction, Fragments

[Biologie Moléculaire] polymorphisme/mutation???

Les SNP et RFLP, mais également mini- et micro-satellites sont des mutations touchant un nombre très restreint de nucléotides, entrainant donc les polymorphismes.   [...] Les RFLP (Restriction Fragments Lenth polymorphism) sont des SNP particuliers. Ils touchent des sites d'enzymes de restriction.  [...]

Carte de restriction d'un plasmide

Des digestions avec une ou 2 enzymes sont réalisées, les produits de la digestion sont soumis à une électrophorèse. On dtermine pour chaque puits le nombre et la taille des fragments de restriction par comparaison avec la migration de fragments d'ADN de taille connue. Les résultats sont dans le tableau suivant.  [...] Bonjour à tous j'ai également un problème au sujet d'un exercice sur les cartes de restriction j'ai mis le fichier en question, il s'agit de la fin de l'exercice 1 de ce TD ou il faut donner la carte de restriction du plasmide pk rec.  [...]

Mémoire en génétique : questions diverses

- TRANSCRIPTION. ( se fait dans le noyau pour synthétiser l'ARN messager ( 1 seul brin ) qui va sortir du noyau au cytoplasme, cette transcription commence par une ouverture d'ADN par une enzyme, ARN polymerase qui va synthétiser l'ARNmessager en fait intervenir les nucléotides en complémentarité.  [...] Qu'est-ce-que ces fragments de restriction Les sites de restriction Et les enzymes de restriction.  [...]

[Biochimie] Preparation et analyse de plasmides

Apres on a utiliser les des enzymes de restriction HINd3 et ECOR1, si j'ai bien compris ces enzymes vont decouper l'ADN plasmidique en plusieurs parties, je me trompe.  [...] est ce que les enzymes de restriction vont decouper les plasmides de HRPN, PGAG, etc... de la meme facon Mais je ne pense pas en fait avec ce que vous m'avez expliqué avant, ca depend de la carte de restriction.Elles sont trouvables sur internet ces fameuses cartes Il parait qu'on connait parfaitement E.coli aujourd'hui.  [...]

biochimie

Une même quantité de DNA double brin d'un virus est complètement hydrolysée par différentes enzymes de restriction utilisées seules (digestions simples) ou conjointement (digestions doubles). Après séparation par électrophorèse en gel d'agarose, la taille des fragments générés est estimée (tableau ci dessous).  [...] C) Donner, en justifiant, la structure de ce fragment de DNA double brin sachant que la séquence ci-dessus appartenait à un DNA double brin obtenu lors de l'attaque de l'extrémité d'un DNA linéaire par l'enzyme de restriction BbvI qui reconnaît le site.  [...]

[Biotechnologie] Problèmes sur les notions/calculs de plasmide

La première partie du devoir vise à vous faire trouver la taille du plasmide. D'où proviennent les fragments générés par la digestion enzymatique Pensez vous que le plasmide puisse faire 5807 pb alors que la digestion par BspI génère un fragment de cette parmis d'autres.  [...] Aussi, j'allais vous demander est ce que si je scannais ma carte de restriction, vous pourriez me dire si celle ci est correcte De même pour le reste de mon énoncé, j'ai répondu à tout mais c'est pour avoir une confirmation belle et bien sure.  [...]

[Biochimie] Mapping et Bal 31

Extracellular nucleases of pseudomonas BAL 31. III. Use of the double-strand deoxyriboexonuclease activity as the basis of a convenient method for the mapping of fragments of DNA produced by cleavage with restriction enzymes.  [...] In a more stringent test of the method, 18 of the 24 fragments produced by cleavage of coliphage lambdab2b5c DNA with the Pst I nuclease have been mapped, and five of the six remaining fragments have been assigned to small regions of the genome.  [...]

fragment de restriction

Bonjour à tous, j'ai un petit soucis concernant les fragments de restriction. Que j'aie un gène qui soit clivé soit par des enzymes de restriction générant des bouts collants 5' ou 3' sortant, si je mets dans mon milieu réactionnel une DNA polymérase avec des nucléotides amorce etc elle va m'allonger ces 4 fragments sans problème ou bien est ce que 3' sortant je n'ai pas de groupement OH donc pas possible d'allonger.  [...] C'est le principe d'une PCR. Par contre les extrémités cohésives des fragments peuvent s'hybrider avec un des autres fragments créant ainsi une sorte de fusion. Mais comme le groupement 3' des tes fragments ne contient pas de OH normalement la polymérase seule ne devrait pas pouvoir allonger/compléter les trous de ton brin d'ADN.  [...]

[Microbiologie] Analyse plasmidique

Je ne comprends pas comment conclure, lorsqu'on obtient plusieurs fragments de taille différentes à l'électrophorèse, qu'il s'agit bien de fragments différents et non du même fragment dans une configuration différente (forme linéaire, surenroulée..).  [...] Lorsqu'on observe des fragments de plasmide sur gel, cela veut dire la plupart du temps qu'on l'a clivé avec des enzymes de restriction. Il n'y a que la forme circulaire du plasmide qui peut être sous forme surenroulée, mais les formes linéaires le restent.  [...]

Sos....rflp

restriction. La coupure est alors détectée par Southern ou par coupure d'un fragment de PCR.  [...] RFLP sont les initiales de restriction fragment length PCR. C'est une technique qui consiste à amplifier un fragment d'ADN par PCR, puis de le soumettre à l'action d'une enzyme de restriction qui va couper les fragments amplifiés. Selon la présence et la position des sites de restriction, des amplicons qui semblaient identiques à première vue peuvent se révéler différents.  [...]