• Forum - Enzyme, Substrat, Forme

[Biochimie] transamination

Au cours de la réaction enzymatique Bi-Bi ping pong aucun complexe ternaire n'est formé. Un premier substrat (S1) se fixe sur l'enzyme (E) et entraîne la libération du premier produit (P1). Un deuxième substrat (S2) se fixe et entraîne la libération du deuxième produit (P2).  [...] Avant d'être transformé en produit, le premier substrat laisse des traces (atomes) au niveau du site actif de l'enzyme. celles ci se fixeront sur le second substrat (réaction de transfert). Il y'a donc mise en jeu d'une forme d'enzyme intermédiaire ou enzyme transitoire (E').  [...]

[Biochimie] fonctionnement des enzymes

Dans cette question il y a deux aspects. l'aspect spatial et l'aspect chimique. D'un point de vue spatial, les enzymes sont des protéines qui ont une structure particulière qui va permettre au composé que l'on nomme Substrat de s'ajuster dans la protéine formant le complexe Enzyme-Substrat, imaginez que l'enzyme ait un creux en forme de triangle et que le substrat ait justement une forme de triangle (comme les jeux pour bébés).  [...] Comble du raffinement, souvent pour les hydrolases, s'il y a trop de produit P dans le milieu, il va s'attacher à l'enzyme et changer sa forme spatiale (Inhibition). Le Substrat ne peut plus former de complexe ES ni réagir. Cela permet donc une régulation du produit P dans le milieu.  [...]

Enzymes S.O.S :(

Pour les enzymes allostériques, il s'agit d'enzymes possédant plusieurs sous-unités ayant chacune un site actif possédant une fonction semblable. Ces enzymes sont un peu différentes. En effet, elles peuvent être sous une forme tendue (où elles sont compressées et ne peuvent accueillir de substrat) et une forme relâchée (où elles sont actives).  [...] L'enzyme passe constamment de la forme tendue à la forme relâchée Si on ajoute un peu de substrat, elles vont démarrer plus lentement car le substrat n'aura d'effet que si la forme est relâchée. Une fois qu'elles ont fixé un premier substrat, elles démarrent beaucoup plus rapidement jusqu'à arriver à saturation.  [...]

[Biochimie] glycolyse et potentiel redox

Son substrat est le 3-phosphoglycéraldéhyde, et son coenzyme libre le NAD oxydé. Le mécanisme est de type bibi ordonné. Le complexe enzyme-substrat se forme grâce à une liaison covalente entre la fonction thiol d'une cystéine de l'enzyme et la fonction aldéhyde du substrat.  [...] Le complexe enzyme-substrat ainsi formé, réagit avec le NAD+ par une oxydoréduction couplée, où les hydrogènes du carbone 1 sont transférés sur le coenzyme, qui sera libéré réduit, avec un proton.  [...]

[Génétique] Questions

c'est la conformation globale de l'enzyme qui permet le rapprochement du substrat au niveau du site actif et qui donne également sa forme au site actif.  [...] Donc, l'enzyme a une conformation spatiale telle que le site actif se forme et telle que le contact entre lui et le substrat soit optimal.  [...]

[Biochimie] Groupes sanguins

Tout Ag (A, B ou O) est composé d'un précurseur formé d'un résidu osidique, de galactose et de N-acétylglucosamine puis l'intervention de l'enzyme H (donc génotype Hh ou HH) va permettre l'ajout d'un fucose et enfin l'intervention d'une seconde enzyme va déterminer le groupe final (A si enzyme A, B si enzyme B, O si pas d'enzyme).  [...] L'absence d'enzyme H (génotype hh) entraîne une absence de modification du précurseur et correspond au phénotype Bombay. Ainsi, même si l'enzyme A ou B est présente elle ne peut pas agir car son substrat n'a pas été formé (pas d'ajout de fucose).  [...]

[Biochimie] Spécificité de substrat

J'ai bien compris mon chapitre et ce que c'était la spécificité de substrat mais je n'arrive pas à élaborer un plan pour expliquer cela. (je pense que ça a un rapport avec la réalisation du complexe enzyme/substrat et leur complémentarité de forme...).  [...] Il faut ensuite faire une partie où tu expliques ce qui se passe au niveau moléculaire (formation d'un complexe enzyme substrat).  [...]

BIOCHIMIE le cycle du glucose

voila je ne comprenais pas si pourquoi la protéine kinase quand elle était phosphorylée était active et quand elle était déphosphorylée était inactive... de même que pour la glycogène synthase il y a-t-il un lien logique (ou cela vient y d'une multitude de réactions ).   [...] Les phosphorylations modifient généralement la forme de l'enzyme de manière très locale, et donc soit la capacité de l'enzyme a fixer le substrat (augmente l'affinité ou la diminue), soit le site actif ou se fait la réaction enzymatique (empêche ou favorise la réaction).  [...]

[Biochimie] Marquage enzymatique

J'ai également lu qu'une deuxième possibilité était de révéler un substrat par son enzyme. seulement, je ne comprends pas en quoi cette deuxième technique diffère de la première...Ne révèle-t-on pas le substrat par le produit coloré qu'il forme avec l'enzyme.  [...] dans un cas on cherche a détecter une enzyme, dans l'autre un substrat. Le principe est le même mais ce n'est pas dans le même sens.  [...]

Modulation allostérique

Une fois que les sites actifs sont accessibles, le substrat peut venir s'y fixer. Une fois un substrat fixé sur une sous-unité de l'enzyme, celui-ci va encourager l'enzyme à rester sous sa forme relaxed, qui aura d'autant plus facile à fixer une nouvelle molécule de substrat sur ces autres sites.  [...] Cette caractéristiques donne une réactivité particulière aux enzymes, qui démarrent assez lentement (plus lentement que les enzymes à un site actif, voir sur la courbe en bleu), puis accélèrent d'autant plus rapidement qu'il y a du substrat pour finir par se stabiliser quand les sites actifs sont occupés (voir courbe rouge).  [...]