• Forum - Enzyme, Rapport, Substrat

[Biochimie] Kd calcul avec protéines

Le Kd est la constante de dissociation de ton enzyme par rapport à son substrat. en gros cela mesure la facilité qu'à ton enzyme à se dissoscier de son substrat (après réactions catalytiques). Tu te fais ainsi une idée de l'affinité qu'a ton enzyme pour ce substrat.  [...] Tu peux trouver le Kd théorique/connu de ton enzyme pour ce substrat, et le comparer à ta valeur calculée.  [...]

enzymes de restriction

A noter que dans des applications de biologie moléculaire du gène impliquant les techniques courantes du génie génétique, la spécificité de coupure (on parle alors de fidélité de l'enzyme) peut être artificiellement altérée par les conditions dans lesquelles la digestion d'ADN s'effectue par chaque enzyme de restriction.  [...] On parle alors d'activité star qui altère la fidélité de l'enzyme. Les conditions expérimentales de rapport enzyme.substrat, volume de digestion, temps de digestion, force ionique et pH des tampons de digestion, présence ± concentrée de glycérol ont toutes un fort impact sur la fidélité de l'enzyme à couper la séquence d'ADN à l'endroit désiré et pas n'importe où ailleurs.  [...]

[Divers] Pharmacocinétique ordre 1

Je ne fais pas de pharmaco, mais j'ai eu de l'enzymo et en enzymologie les ordres interviennent surtout dans les vitesses cinétiques. Ainsi, la vitesse initiale vi pour un ordre zéro est vi=k ( k = constante de vitesse ) tandis que pour l'ordre 1 elle est de vi=k[x].  [...] Faut-il en déduire une dépendance de la vitesse par rapport à la concentration d'un substrat ou de l'enzyme....  [...]

[Biochimie] Étude enzymatique et cinétique d'ordre 0 ?

- quelle en est la conséquence logique pour le choix de leur concentration (en unité Km) (sous entendu concentration en substrat et enzyme).  [...] La conséquence logique est que pour que le substrat puisse saturer l'enzyme, sa concentration doit être en large excès par rapport à celle de l'enzyme afin d'atteindre très rapidement la phase stationnaire.  [...]

michaelis et menten

Je ne comprends pas pourquoi dans les cours d'enzymologie d'une part on dit que le substrat est en quantité bien supérieure à l'enzyme pour simplifier l'équation de Michaelis et Menten et d'autre part on dit qu'à concentration saturante de substrat l'équation de Michaelis et Menten n'est pas utilisable pour trouver la vitesse.  [...] A très haute concentration en substrat le Km devient négligeable par rapport au [S] en dénominateur. Les deux [S] peuvent se simplifier et on a v = Vm (la vitesse de l'enzyme est donc maximale à très haute concentration en substrat), c'est la concentration saturante.  [...]

[Biochimie] Equation de Scatchard

J'ai réussi à retrouver l'équation de scatchard à partir des vitesses de reaction à l'équilibre sans probleme cependant je ne vois pas trop l'interet du rapport ligand lié/ligand libre.. (autant Ligand lié/ concentration de proteine liante totale ne me choque pas, et ligand lié/ligand total ne me choquerait pas non plus.  [...] Est-ce que ce ne serait pas la courbe traduisant la dissociation du complexe enzyme-substrat Dans ce cas, il serait normal que ES diminue et S augmente donc au final le rapport ES/S diminue...Mais je dis peut-être des bêtises.  [...]

[Génétique] Groupe sanguin et parentalité

Imaginons que le programme génétique transmis par le papa du groupe O est gène 1NF et gène 2A, l'enzyme 2A ne sert à rien le papa est du groupe O.  [...] -Le groupe de l'enfant a été déterminé à quelques jours, je crois me souvenir que le pédiatre m'avait expliqué qu'en général, on ne demande pas le groupe si tôt... je ne me rappelle plus trop en fait. Est-ce qu'un groupe sanguin 'mesuré' dans les 1ers jours de vie peut changer (ça y est, je vais passé pour une folle. ).   [...]

[Biochimie] Enzymologie et KM

Le KM mesure l'affinité de l'enzyme pour son substrat. Donc quand le KM est faible, il faut peu de substrat pour avoir une forte activité catabolique, et inversement quand ton KM est fort.  [...] Inversement, plus la proportion d'enzyme liée à son substrat (ES) est forte par rapport à l'enzyme libre, plus cela signifie que ton enzyme est disposée, dans ces conditions expérimentales, a former des complexes et donc plus son affinité est forte, donc sa capacité a s'en dissocier (révélé par son Km) est faible.  [...]

[Divers] aide révision questions diverses

Dans ce cas l'inhibiteur ne modifie pas la fixation du substrat, et donc l'inhibiteur diminue [E]T sans modifier le rapport enzyme libre/lié.vmax devient alors Vmax' = Vmax / (1 + [I]/KI ) avec KI = KIs et K1 = K1i.  [...] On dit que l'activité spécifique d'une enzyme c'est le rapport de l'activité spécifique sur le nombre de protéines. Mais les protéines dont-il est question c'est toutes les protéines du mélange.  [...]

[Biologie Moléculaire] Comment mesurer l'affinité à un récepteur ?

Est-ce que ça peut être dû à une meilleure affinité de l'enzyme pancréatique ou est-ce un autre aspect (vitesse de réaction, vitesse de relargage du substrat ayant réagi, solubilité et osmolarité...).  [...] C'est (entre autres) une question de temps de contact entre le substrat et l'enzyme forcément plus court au niveau salivaire par rapport au temps de contact avec l'amylase pancréatique.  [...]