• Forum - Enzyme, Forme, Groupement

[Biochimie] oméga oxydation=>bêta ox des deux côtés!

Alors voila, au cours d'une oméga-oxydation, dans le réticulum endoplasmique - arrêtez moi si je me trompe - on peut assister à la formation (entre autre, l'autre étant l'acide carboxylique tout court + 1 alcool) d'acide dicarboxylique.  [...] Il est sous une forme réduiste S-CoA-SH. Ce groupement est un cofacteur de l'enzyme et il manque tout simplement à ton équation bilan. D'ailleurs il y manque aussi un proton dans les produits (c'est ce proton qui réduit le SCoA).  [...]

type d'enzyme

je sais q'un enzyme est formé d'un apoenzyme + coenzyme et les coenzyme sont soit groupement prosthétique soit cosubstrat.  [...] Cosubstrat = liaison faible / Groupement prosthétique = liaison forte.  [...]

[Biochimie] transamination

le phosphate de pyridoxal (PPal), coenzyme necessaire à la transamination et transporteur intermédiaire de la fonction amine, se charge du groupement amine de l'acide aminé 1 et se transforme en phosphate de pyridoxamine (PPNH2). Il y a alors libération du premier produit. l'acide alpha-cétonique 1.  [...] Il y'a d'abord fixation de l'aspartate (S1)sur l'enzyme (E). Il suit le départ d'un groupement aminé qui se fixe sur le phosphate de pyridoxal (groupement prosthétique intimement lié à l'enzyme) donnant ainsi la forme phosphate de pyridoxamine.  [...]

[Divers] Oximes

Il se forme une phosphyloxime qui est elle-même un bon inhibiteur de cholinestérase et peut effectivement inactiver une autre enzyme, ou s'hydrolyser, ou phosphyler une autre protéine.  [...] Lorsque l'oxime réagit sur l'enzyme phosphylée, le groupement phosphyle est transféré de la sérine de l'enzyme à l'oxime, conduisant à la formation d'une phosphyloxime et à la régénération de l'enzyme libre. Mais la phosphyloxime est capable de re-phosphyler l'enzyme.  [...]

[Biochimie] Charge nette d'un peptide

Salut, pour calculer la charge nette d'un peptide a un pH donné il faut connaitre la forme ionique de ton groupement -R pour chaque acide aminé. Il faut pas oublier de prendre en compte la forme ionique de l'NH2 terminal et du COOH terminal.  [...] Pour savoir quel forme ionique a un groupement il faut connaitre le pH du milieu ainsi que du pHi (isoélectrique) de ton groupement.  [...]

Apoenzyme=Apolipoprotéine...?

Je sais qu'une partie apoprotéique d'un complexe protéique est sa partie non protéique. Et je suis quasiment sûr que pour ta molécule, ils font précéder apo car il y a un groupement lipidique qui est donc ici le groupement apoprotéique de ton enzyme.  [...] Une enzyme a toujours besoin d'un cofacteur Je trouve ça bizarre, la présence d'un cofacteur n'est pas forcément nécessaire pour qu'une enzyme catalyse. Je prends par exemple le cas d'une isomérase (la phosphohexose isomérase je crois) qui convertit le glucose-6-phosphate en Fructose-6-phosphate, elle a pas besoin de NAD+ ou FAD ou de n'importe quel autre type de cofacteur, a moins qu'il ne soit déjà fixé à l'enzyme.  [...]

protéine: hydrophile ou hydrophobe

A pH acide, les groupements amines sont sous forme NH3+ et le groupement acide est dans une certaine proportion (suivant le pH et le pKa du groupement alpha COOH) sous forme COOH ou COO-. A ph très acide, on a alors une charge nette de +1.  [...] A pH basique, les groupements acides sont alors sous la forme COO- et les groupements NH3+ tendent à leurs tours à se dissocier dans une certaine proportion suivant le pKa du groupement amine pour ainsi obtenir des groupements sous la forme NH3+ ou NH2. A un pH très basique la forme prédominante du groupement est NH2. La charge nette est de -1.  [...]

[Biochimie] Les anomères !

Ces oses ne diffèrent que par la place des groupements - à droite ou à gauche de la chaîne (carbonée) principale - par convention, le groupement le plus oxydé est toujours à droite (= forme D ) en C 1.  [...] Donc on a deux molécules qui sont épimères parce que leurs groupements ne sont pas disposés du même côté de la chaîne principale. Et comme tout ces groupements sont inverses l'un de l'autre (du C 1 au C n ) d'une molécule par rapport à l'autre, un petit malin a un jour décider de les représenter côte-à-côte à travers un jeu de symétrie axiale.  [...]

[Génétique] UV et dimères de pyrimidines

c'est donc 12 lésions qu'il faut pouvoir quantifier dans l'ADN. Pour cela, nous réalisons tout d'abord une hydrolyse enzymatique qui libère les bases normales sous forme de nucléosides. Les photoproduits sont eux hydrolysés en dinucléosides monophosphate, soit deux nucléosides reliés par un groupement phosphate.  [...] En effet, ces dernières étant en quantités infimes (106 fois plus faibles que les bases normales dans les cellules), il faut une détection à la fois spécifique et sensible pour les mesurer précisément. En utilisant cette approche, il est ainsi possible, en une seule injection de quantifier les 12 photoproduits bipyrimidiques ainsi que de déterminer la quantité d'ADN analysée.   [...]

CAPES ext SVT: celà fait-il parti du programme...?

rassure moi au moins sur un point... il faut aussi connaitre les formules développées ou alors les noms de molécules suffit (genre X + enzyme Y = molécule z).  [...] En gros l'insuline fait le contraire. Par un recepteur tyrosin kinase, elle active la PFK-2 et inhibe la F-2,6-Pase (toujours cette meme enzyme bifonctionnelle..). La PFK-2 ajoute un groupement phosphate au F-6-P pour former du F-2,6-biP. Sachant que le F-2,6-P active la phosphofructokinase transformant le F-6-P en F-1,6-biP, on peut dire que l'insuline active la glycolyse.  [...]