• Forum - échantillon, Plateau, Pente

courbes qpcr et dilution

Cette dilution est fait pour 3 génotypes différents (donc a chaque fois des échantillons de départ différents). Les 3 premeirs et les 3 deuxième points sont a des concentrations identiques.  [...] Ensuite la courbe de l'échantillon plus concentrée donne un plateau plus bas et une pente plus faible.  [...]

[Biochimie] Km

V omax (plateau) augmente quand [E] total augmente MAIS Km reste le même car bien que le plateau soit plus haut, la pente de la courbe sera plus importante et on aura toujours Vo=Vomax/2 eb [S]=Km.  [...] Ces explications te montrent comment le Km pourrait rester constant. Pour prouver qu'il est constant, il suffit de reprendre sa définition initiale qui est bien Km = rapport de constantes de réaction (honnetement ej ne me souviens plus très bien ^^) donc Km ne dépend que de la température (et du pH et des molécules méchantes qui voudraient du mal à l'enzyme, mais ça c'est autre chose).   [...]

[Biochimie] Dosage des sucres

Sans entrer dans les details, j`ai effectue une hydrolyse d`Arabidopsis thaliana, puis mesure le taux de glucose qui avait ete produit. Pour cela, j`ai pris comme gamme etalon des solutions de glucose a 0, 100... jusque 500 microgrammes/mL, afin de mesurer l`absorbance grace a la methode de dosage au phenol et acide sulfurique.   [...] J`ai pese 0.1g d`Arabidopsis, dans un volume total de 50mL (tampon+enzyme). J`obtiens en concentration max 380microgrammes/mL (absorbance de mon echantillon divisee par la pente de la droite etalon). Ensuite, j`ai multiplie cette concentration par 50 (dilution au 50eme avec les 50mL d`enzyme et tampon), et encore multiplie par 10 (0.  [...]

[Biologie Moléculaire] calcul d'efficacité de PCR

est il possible de la calculer sans connaitre la concentration de l'ADN de départ, juste en calculant la pente de la droite. Ct en fonction du log du facteur de dilution (en valeur absolue bien sure).  [...] Comme dit au dessus, pour calculer l'efficacité d'une PCR, pas besoin de connaitre la concentration exacte de ton échantillon standard. Tu peux par exemple attribuer une valeur arbitraire 1 au standard non dilué, puis faire les dilutions comme ca te chante par la suite (dilution en série par 4 ou 10 ou autres), et le calcul de la pente te permettra de calculer l'efficacité.  [...]

Musculation a t'elle pu arreté ma croissance ???

6 Si tu regardes bien tu t'apercevra qu'en début de vie, la pente de la courbe est forte puis plus faible, puis à nouveau plus forte puis enfin se ralentit jusqu'à devenir quasiment plate.  [...] Eh bien tu as la réponse à la question sur le fait d'avoir presque teeminé sa croissance et que par définition lorsque la courbe est très plate, ta croissance evolue très peu (ce qui est le cas entre 16 et 18 ans, eh bien tu as presque terminé ta croissance.  [...]

[Biologie végétale] echantillonnage vegetation

Pour un travail de recherche dans le cadre d'une étude des facteurs déterminants dans la répartition des espèces arborées sur un espace donné, j'ai opté pour un échantillonnage stratifié systématique non aligné. J'ai donc choisi de diviser mon terrain d'étude en secteurs homogènes (pente et exposition).  [...] Pour chaque secteur, un nombre de relevés est déterminé. Mes relevés sont donc répartis selon un maillage couvrant chacun des secteurs. Cette méthode permet de couvrir de manière homogène mon espace.   [...]

[Microbiologie] identification d'une bactérie

Pour le lactose - en 48h c'est normal, il y a oxydation du glucose en anaerobiose. cette oxydation produit du CO2 (acide volatile) qui fait virer dans un 1er temps la pente au jaune. Quand il n'y a plus de glucose et comme la souche ne sait pas utiliser le lactose,elle degrade les peptones ce qui alcalinise la pente qui redevient rouge d'ou le caractere lactose -.  [...] Je pense plus à un bacille G-. Les entérobactéries (majorité des bacilles G-) sont des petits bacilles ayant une coloration dite bipolaire. c'est à dire que les extrémités sont plus foncées que le centre du bacille. Donc, quand on n'a pas l'habitude, on peut les prendre pour des cocci G- ou cocci G+.   [...]

[Biologie Moléculaire] Efficacité PCR quantitative

J'ai besoin de lumière. lorsque je fais des manips de PCR quantitaive (absolue), il m'arrive parfois d'obtenir des pentes dans la courbe standard de l'ordre de -3.28, ce qui me donne une efficacité supérieure à 100%... Qu'est-ce que ça veut dire Pourtant, la courbe standard est nickel et il n'y a qu'un seul pic... Merci à ceux qui peuvent m'aider.  [...] Car une chose m'intrigue. lorsqu'on fait le calcul pour savoir de combien doit être la pente pour avoir une efficacité maximale égale à 1 (donc dans le cas ou E est compris entre 0 et 1) et bien on tombe sur une pente = -1 / log 1 qui mathématiquement impossible.  [...]

96-well plates Beer-lambert

...Maintenant, la valeur ainsi trouvée sera fausse, car ce n'est pas fait pour. La surface du liquide a l'intérieur du puits n'est pas plate. Il se forme un ménisque et donc la hauteur calculée sera erronée.  [...] Seulement une fois que j'ai mesuré la pente de ma droite (mA/min j'ai fait une mesure toutes les 10 sec pendant 10 min), j'aimerais mettre ça en activité spécifique et pour ca il me faut le l de la loi de beer-lambert... comme j'ai fait ca dans des plaques de 96 puits car j'avais bcp d'échantillons, je savais pas si le l je pouvais prendre la hauteur du liquide.  [...]

[Biologie Moléculaire] Interprétation PCRq en temps réel (SYBER Green)

A partir du moment ou la spécificité de ton amplification d'ADN champignon est avéré, il me semble que tu peux en conclure que ton échantillon est positif pour ce champignon. même en faible quantité, ce dernier est présent et se multiplira de toute façon.  [...] Il ne faut pas oublier non plus que la progression de la concentration dans ton échantillon n'est pas linéaire. Un Ct d'écart entre 2 tubes, ça veut dire que la concentration de tes cibles était de 1 et de 2 entre tes tubes, un écart de 10 Ct c'est 1 et 1024.  [...]