• Forum - Duplex, ARN, ADN

biologie moléculaire

connaisons que toutes les cellules d'un meme animal contiennent des génomes identiques, dans une expérience, un tissu composé de multiples types cellulaires est fixé et soumis à une hybridation avec une sonde d'ADN spécifique d'un géne particulier. à votre grande surprise, le signal d'hybridation est brin plus fort dans certaines cellules que dans autre, est ce quelqu'un peut me donner une explication détaillée.  [...] si ta sonde hybride les ARN (les duplex ARN/ADN ca existe ), ca vient juste représenter la différence d'expression des gènes dans les différentes celulles,  [...]

[Biologie Moléculaire] Que devient l'ARNr dans une reaction de RT

Effectivement, je n'ai pas utilisé de RNAse, ma transcriptase reverse a une petite activité RNase H (élimine les ARN des Hybrides ARN.ADN), j'utilise des oligo DT pour que ma RT soit spécifique des ARNm...alors dans mon tube de RT j'ai de l'ARN total, donc quand je depose moin cDNA sur puce, j'ai de L'ARNt, l'ARNr l'ARNm et du cDNA...alors ou sont passés mes ARNr.  [...] Ceci expliquerait peut être vos résultats. lorsque que j'utilise les puces ARN nano et que j'obtiens une smire, c'est généralement une contamination ADN (ou de l'ARN dégradé).  [...]

HIV-1 : cycle réplicatif

Comment passez de l'ARN monobrin de polarité positive à un double brin d'ADN,  [...] La transcriptase inverse permet d'obtenir un duplex ARN-ADNc l'ARN est alors degradé par l'activité RNAseH, ensuite une DNApol synthetise le deuxieme brin d'ADN.  [...]

structure moleculaire acides nucleiques

Il est aussi écrit dans mon livre que la présence de l'hydroxyle en 2' du ribose dans l'ARN interdit tout appariement pour former des duplex de chaînes, comme c'est le cas pour l'ADN, mais je comprends pas pourquoi puisque de toute façon, les brins sont pas reliés entre les sucres mais entre les bases.  [...] Ce que dit ton livre est faux. L'ARN peut former des duplex comme chez certains virus par exemple. L'hydroxyle en position 2' change juste la conformation du sucre par rapport à celle dans l'ADN, ce qui donne un autre type d'hélice. Regarde ici pour plus de détails.  [...]

[Biologie Moléculaire] Régulation de la réplication bactérienne

benRNA 1 et le brin Arn 1 du premier brin d'adn et RNA 2 est un 2ème brin d'arn non codant qui intervient dans la replication en intégrant la bulle de replication et en servant damorce.  [...] D'après ce que j'ai lu, la réplication commence si l'ARN II entre dans la bulle de réplication au niveau de l'ori du plasmide et qu'il est clivé par la RNase H. Mais ceci arrive peu fréquemment. Dans la plupart des cas, l'ARN I va s'hybrider à l'ARN II et apparemment Rop (sous forme dimérique) facilite cette hybridation.  [...]

ARN en PCR

Ça n'a absolument rien à voir avec la structure simple brin ou double brin. l'ARN peut tout à fait exister sous forme double-brin. La Taq Polymérase amplifie l'ADN parce parce qu'elle se lie à l'ADN pour produire de l'ADN. On parle d'ADN polymérase ADN dépendante.  [...] - La PCR nécessite de passer par de très hautes températures (95°C pour l'ADN) pour déshybrider les duplex après polymérisation. L'ARN étant assez instable, de telles températures conduisent assez rapidement à sa dégradation. De plus, à ma connaissance, les ARN polymérases ARN dépendantes ne résistent pas à de telles températures.  [...]

[Biologie Moléculaire] Différence RNase A / RNase H

Est-ce que vous pouvez m'expliquer la différence entre la RNase A et la RNase H Si j'ai un peu compris la première est plus thermorésistante et les deux sont utilisées pour détruire l'ARN dans les hybrides ARN-ADN.  [...] La RNAse A est une enzyme qui va te dégrader tout les ARN présent dans ta solution. La RNAse H est une enzyme qui va spécifiquement dégrader l'ARN lorsque ce dernier est en duplex avec un brin d'ADN.  [...]

[Biochimie] Différence entre ADN et ARN

Bonjour à vous. Svp après la différence ribose.. desoxyribose et Thymine.. Uracile quelle autre différence structurale existe t-il entre l'ADN et l'ARN.  [...] Sinon, Pyvoine, pour répondre. du point de vue structural, les différences s'arrêtent là. Mais l'ADN peut prendre d'autres formes notamment dans les cellules où il contient deux brins (ADN bicaténaires) qui s'associent le plus souvent en un duplex en double hélice basé sur la complémentarité des bases azotées, tandis que l'ARN a tendance à être monocaténaire et peut adopter des conformations assez variées (notamment les ARNt) et avoir une activité catalytique.  [...]

[Biologie Moléculaire] Température de fusion

Voici ce que dit internet (traduit de l'anglais). les nucléotides LNA sont des analogues d'acide nucléique contenant un pont méthylène entre l'hydroxyle en position 2 et l'atome de carbone 4 du sucre confèrant la conformation idéale pour l'hybridation. Cela a pour conséquence que les LNA présentent une grande stabilité thermique lorsqu'elle est hybridée à un brin d'ADN ou d'ARN complémentaire.  [...] Sa conformation fait que la température de fusion Tm augmente de 5°C par nucléotide LNA.  [...] Les petites tailles des microARN les rendent difficiles à analyser à l'aide des méthodes traditionnelles de qPCR. L'utilisation de l'ADN ou des technologies à base d'ARN pour l'analyse des microARN peut introduire une incertitude élevée et une faible robustesse car la température de fusion (Tm) du duplex oligonucléotide/microRNA varie considérablement en fonction de la teneur en GC.  [...]

relation du pourcentage G+C avec la Tm

Il indique simplement la relation entre l'absorbance relative d'un faisceau monochromatique de 260 nm et la température de fusion Tm. En fait, la température de fusion est la température à laquelle les deux brins de ton duplex d'ADN se séparent, et les acides nucléiques ont un pic d'absorbance pour la lumière UV à 260 nm.  [...] A la valeur de Tm, tu as en fait autant d'ADN en duplex que dissocié (ratio 1.1). En fait, la valeur de Tm est un indice de stabilité thermique qui va varier en fonction de la composition de ta séquence, mais aussi du nombre de bases. En fait, à mesure que tes duplex ADN vont se dissocier en brins individuels, l'absorbance optique de ton milieu va augmenter.  [...]