• Forum - Domaines, Liaison, ADN

technique du double hybride

Le principe repose sur l'utilisation d'un facteur de transcription avec deux domaines, un domaine de liaison à l'ADN et un domaine de transactivation.  [...] Si il y a interaction, il y aura reconstitution du facteur de transcription actif du fait de la proximité des domaines de liaison à l'ADN et du domaine de transactivation. Du coup le gène rapporteur sera activé.  [...]

Fonction "DNA binding"

L'homéodomaine correspond à une partie d'une protéine qui se fixe à l'ADN. Ainsi, l'homéobox d'un gène correspondra à ce domaine de fixation à l'ADN.  [...] D'accord, merci Mais du coup, il existe un homéodomaine pour toutes les protéines ou seulement pour celles qui agissent sur l'ADN.  [...]

[Génétique] Programme génétique et cellules

La question de savoir pourquoi l'ADN a cette forme en double hélice est un peu... spéciale Càd qu'il y a des contraintes stériques, des interactions chimiques, etc. Il ne faut pas perdre de vue le fait que les protéines ayant des domaines de liaison à l'ADN reconnaissent une forme.  [...] Je cite. Il ne faut pas perdre de vue le fait que les protéines ayant des domaines de liaison à l'ADN reconnaissent une forme. Donc, c'est une forme qui a été favorable et qui s'est maintenue.  [...]

[Biologie Moléculaire] Facteurs de transcriptions chez vegetaux

Dans mon cours il est dit que le domaine de liaison à l'ADN des facteurs de transcriptions caractérise la famille de ces facteurs de transcription.basic helix-loop-helix (bHLH), basic leucine ziper (bZIP), helix-turn-helix et les doigts de zinc.  [...] Leucine zipper, doigt de zinc et compagnie c'est des types de domaines de liaison à l'ADN qu'on trouve dans les facteurs de transcription, pas les familles.  [...]

cortisone

Ce complexe va reconnaitre les séquences GRE (Glucocorticoïde Response Element). Ha oui, j'ai oublié de te dire qu'en fait le récepteur est composé de plusieurs domaines distincts (5 il me semble mais je ne suis pas sûr) dont un domaine de liaison à l'ADN et un domaine de transactivation de la transcription.  [...] ah... ben voila une reponse interessante... la cortisone active des genes qui codent pour quoi pleins de chose ou certaines reponses ciblées.   [...]

[Biologie Moléculaire] P53 et réparation de l'ADN

Une des activités favorites des biologistes moléculaires est d'aligner et de comparer entre elles des séquences d'ADN apparentées pour en identifier les régions les plus conservées. On suppose alors que ces régions correspondent à des domaines fonctionnels.  [...] Mis bout à bout, ces différents domaines correspondent au portrait classique d'un facteur de transcription oligomérique. Mais ce découpage topographique révèle que chaque domaine peut aussi servir de site d'accrochage pour des protéines cellulaires telles que mdm-2 (dans le domaine de transactivation) ou p53BP2 (p53-binding protein 2, dans le domaine de liaison à l'ADN).  [...]

Origine de la vie : analyse critique de documentaires

Déjà certains l'auront remarqué, les microbes du film sortent directement de la cheminée du fumeur noir. En réalité la vie n'est pas apparue comme ça, mais surtout les bactéries des fumeurs qu'on connaît croissent sur le pourtour des cheminées, l'eau étant à peine mais suffisamment plus froide pour autoriser la stabilité essentielle d'une grande partie des liaisons faibles qui maintiennent des macro-structures comme la précieuse membrane plasmique, ou encore les structures secondaires et tertiaires des protéines.  [...] La raison plus chimique tient à la multiplicité des liaisons chimiques pouvant être excitées par la lumière. Dans les longueurs d'onde des domaines visibles et avoisinnant, cela peut occasionner des changements de conformation comme chez la rhodopsine (pigment rétinien impliqué dans la vision du rouge), à des lyses occasionnelles (comme le brin d'ADN ou des protéines sous UV).  [...]

monde ARN avant ADN

, 1993). Cette idée se basait sur la présence de certaines enzymes clefs du métabolisme de l'ADN dans les trois domaines du vivant, en particulier les ADN topoisomérases de type II et les ADN polymérases de la famille B. Or, nos travaux de phylogénie plus récents, basés sur les données accumulées grâce au séquençage des génomes, ont montré que cette répartition ubiquitaire était en fait due à des transferts de gènes entre domaines (Filée et al.  [...] , 2002, Gadelle et al., 2003). Il ne reste donc plus que très peu de protéines du métabolisme de l'ADN dont on peut inférer la présence dans l'ancêtre commun de chacun des trois domaines (donc sans doute chez LUCA). En particulier, les protéines de réplication de l'ADN ne sont pas ubiquitaires, puisque l'on distingue deux systèmes non homologues, celui des bactéries et celui des archéobactéries/eucaryotes.  [...]

Schéma de la liaison noradrénaline à son recepteur

Il s'agit d'une vue du dessus du recepteur à la noradrénaline, qui est un GPCR (G protein coupled receptor) Il est composé de 7 segements transmembranaire (la chaine polypeptidique traverse donc 7 fois la membrane) et décrit une courone à l'interieur de laquelle vient s'insérer l'adrénaline et on te décrit les résidus qui sont impliqués dans cette intéraction.   [...] Seule petite erreur (à mon sens), je doute que l'adrenline intéragisse avec les tm (segment transmembranaire) car par défénition ils sont dans la membrane mais plutôt avec la partie émergente du tm que je dirais plutôt comme faisant partie de la boucle extracellulaire.   [...]

[Immunologie] réarrangement des génes

Les chaînes légères et lourdes ont un domaine V (variable) et un domaine C (constant). Les domaines V sont codés par combinaison aléatoire de plusieurs segments géniques. Les domaines C sont codés par un ou quelques segments. Les domaines V des chaînes légères (Lambda ou Kappa) sont issus de la combinaison d'un segment V (variable) d'ADN et d'un segment J (joining), on a donc un réarrangement V-J.  [...] Pour les domaines V des chaînes lourdes on a en plus des segments V et J un segment D (diversity) d'ADN, on a d'abord un premier réarrangement V-D puis un second VD-J. Le segment C s'ajoute toujours en dernier.  [...]