• Forum - Domaines, ADN, Acide aminé, Protéine

[Génétique] Programme génétique et cellules

J'ai souligné une partie de ton propos qui est erronée. attention, dire que des domaines protéiques se lient à des domaines d'ADN par complémentarité signifie que tu as une liaison entre une base azotée contenue dans un nucléotide et un acide aminé provenant d'une protéine à la manière dont cela est possible entre les bases azotées au sein de l'ADN.  [...] Ce que je disais c'est que si tu prends un gène codant une protéine, tu auras dans la séquence un codon initiateur, puis les autres codons et à la fin un STOP, dans cet ordre. Le codon est ce qui définit un acide aminé et l'enchaînement que je viens d'énoncer s'appelle une CDS (CoDing Sequence).  [...]

[Biochimie] acides aminés

la titration d'un acide aminé acide montre 3 domaines. 1domaine acide, 1domaine neutre et 1 domaine basique. vrai ou faux.  [...] Dans ce cas, il s'agit de la courbe de titration d'un acide aminé à chaîne latérale ionisable soit trois fonctions ionisables en tout donc trois phases puisque trois sauts de pH.  [...]

[Biochimie] Aminoacyl-ARNt synthetase.

La spécificité d'aminoacylation pour de nombreux procaryotes et eucaryotes a été étudiée. La fixation de chaque acide aminé sur son ARNt correspondant est effectuée par une famille de vingt aaRS. En général, il existe pour chaque acide aminé et ses ARNt correspondants une aaRS homologue et particulière.  [...] Peu être que ma réponse est trop compliqué et élaboré pour toi(vu ton âge...),mais j'ai répondu correctement et t'ai dit que chaque ARNt synthetase a un domaine spécifique pour chaque acide aminé.  [...]

Etude de la glycophorine A

En effet, la GPA il y a des acides aminés à radical hydrophobes mais ils ne sont pas répartis de manière aléatoire mais plutot regroupés dans un domaine restreint.Mais quelle est la caractéristique physico-chimique de ce domaine.  [...] De meme pour la situation des acides aminés à radical hydrophile. quelles est la caractéristique des domaines de la protéine dans lesquels ils sont concentrés La partie hydrophyle de la protéine.  [...]

[Biochimie] Questions Protéines / Enzymologie

1) Un prof de TD nous a dit que TOUTES les protéines absorbaient à 280nm cependant j'ai lu que seules protéines possédant des acides aminés aromatiques ( tryptophane, tyrosine, phénylalaline ) absorbaient à 280nm, qui a raison.  [...] En général le Bromure d'Ethidium est plutôt pour l'ADN (C'est un composé aromatique qui s'intercale entre les bases). Mais si la protéine a des domaines riches en aromatiques, il peut éventuellement s'y scotcher, surtout après une dénaturation qui expose les domaines aromatiques enfouies.  [...]

Bioinformatique - Etudes d'une sequence d'ADN

Si ta sequence d'ADN est codante (ce qui est probable vu que les genomes viraux sont denses), alors tu peux traduire ta sequence en proteine et faire une recherche, comme le disait john, mais cette fois au niveau proteique, ca pourra te donner des elements de reponses plus significatif, voir eventuellement identifier des domaines fonctionnels ou des motifs proteiques.  [...] bonsoir, voilà j'ai une protéine P1 et je n'arrive pas à trouver la séquence d'ADN correspondante en utilisant BLAST. Par contre j'ai pu déterminer le blastp grâce à la séquence Fasta, quelqu'un pourrait m'aider.  [...]

[Biologie Moléculaire] albumine(blanc d'oeuf)

En soit, savoir quels acides aminés composent une proteine n'est pas tres informatif. Cherchez plutot quels domaines proteiques la compose, sont ils hydrophyles ou hydrophobes ect.  [...] Ta recherche sur les acides aminés de la protéine d'Albulmine te sera nécessaire pour pouvoir expliquer le phénomène de stabilité suite à l'émulsion des blancs d'oeufs. En effet la composition de chaque acide aminé va t'informer sur ses propriétés. hydrophile ou hydrophobe.  [...]

[Biologie Moléculaire] La molécule mystère - Page 7

Je suis une protéine de 1247 aa, à deux domaines. le N-term est constitué d'environ 630 aa présentant une bonne ressemblance avec une certaine enzyme d' E.coli. Je suis quelqu'un d'atypique.  [...] Je ne sais pas trop quoi vous donner comme indices sans trop en dire... Cette protéine est un enzyme, ses deux domaines ont une fonction distincte. Cet enzyme a pour substrat l'ADN. Le point important est le mot atypique. autant la fonction que les organismes chez lesquels on la trouve.  [...]

Problème de biologie moléculaire

C'est quand même assez étrange de donner ce genre d'exercice en 2016. Désormais quand on connait le gène en question, on commence par une analyse bioinfo pour déterminer la famille de protéines à laquelle elle appartient, si il y a des motifs d'interaction à l'ADN, ou à l'ARN.  [...] déjà voir si la séquence ressemble a quelque chose de connu (il n'y a pas 1000 façons pour une protéine de se lier à l'ADN, et ça on peut le reconnaitre), si elle a des domaines d'interaction avec des protéines connues, et pour compléter, IP, dépôt des protéines sur gel et analyse spectro de masse (en qq jours vous pouvez connaitre toutes les protéines qui interagissent avec votre cible) et/ou Chip-seq (ça reste un peu délicat et cher mais ça ratisse large et c'est très informatif).  [...]

[Biochimie] Structure des Protéines

- Est-ce que plus la chaîne latérale d'un acide aminé est volumineuse plus la surface des domaines interdits (Diagramme de Ramachandran) est grandes.  [...] -2 Protéines X et Y contiennent plusieurs domaines (Notés Xi(i de 1 à n)) et (Yj (j de 1 à m)) et ont la même fonction biologique alors. L'un des Xi a la même Topologie que l'un des Yj Au moins l'un des Xi a la même topologie que l'un des Yj, tous les domaines peuvent avoir une topologie différente ou aucune des réponses n'est exacte.  [...]