• Forum - Digestion, Protéines, Peptides

[Biologie Cellulaire] culture cellulaire

La trypsine c'est une endoprotéase c'est à dire que c'est une enzyme qui rompt les liaisons peptidiques au centre da la chaine(par rapport à une lyse terminale). La trypsine rompt la l iaison lysine arginine uniquement. c'est à dire que ça casse les chaines protéiques uniquement à ce niveau là.  [...] Bah pour l'organisme ça sert à la digestion déjà Faut couper les protéines en acides aminés ou en peptides pour que ces molécules soient absorbées au niveau de la paroi intestinale.  [...]

[Divers] aide révision questions diverses

Ensuite est ce que la digestion détruit l'antigénicité des protéines ca voudrait dire que ces protéines sont susceptibles de déclencher une réponse immunitaire…. Mais toutes les protéines n'ont pas des antigènes … Si.  [...] Toutes les protéines sont susceptibles d'être des antigènes. La digestion hydrolyse les liaisons peptidiques, pour au final ne laisser que des acides aminés et des petits peptides, qui ont peu de chances de déclencher une réponse immunitaire.  [...]

[Biologie Cellulaire] erythrocyte et molécules du CMH

Il faut tout d'abord préciser que le système CMH est un système dynamique. Il nécessite une digestion des protéines présentes à tout moment dans la cellule et la présentation des peptides issus de cette dégradation par le CMH I.  [...] Les marqueurs A/B/O ainsi que d'autres sont effectivement synthétisés au stade réticulocyte. La persistance de ces protéines tout au long de la vie de l'hématie s'explique, en tout cas pour certaines, par la présence d'acides sialiques en position terminale (il s'agit de glycoprotéines membranaires).  [...]

[physiologie] alimentation et protéine

Dans la question posée il faut inclure le fait qu'un certain nombre nombre des acides aminés (briques élémentaires des protéines) sont indispensables et que la richesse des protéines est très variable selon la provenance.  [...] Les recettes de nos grand-mères - avec aromates, épices à foison et mode de cuisson doux (mijotage) - préservent certainement mieux l'intégrité biochimique de ces acides aminés que par exemple les réchauffages brutaux à feu vif ou au four à micro-ondes. Après digestion, ces acides aminés sont en principe destinés à être précurseurs d'autres peptides, protéines ou médiateurs divers.  [...]

digestion enzmatique suivie de HPLC phase inverse

voila je voudrais savoir qd on fait une digestion enzymatique d'une protéines par la trypsine par exemple est ce que après on fait une électrophorèse des différents peptides est ce qu'on extrait la bande correspondant à un peptide donné du gel et ensuite on procède à son analyse par HPLC si oui comment se fait cette extraction.  [...] et une dernière question est ce que l'analyse en HPLC se fait peptides par peptides extrait du gel ou bien c'est tout le mélange issu de la digestion enzymatique qui passe à l'analyse en HPLC.  [...]

[Biochimie] Etude des protéines par spectrométrie de masse

Bonjour à tous, j'ai un problème de compréhension avec la spectrométrie de masse, j'ai compris qu'il y a plusieurs types de source d'ionisation et plusieurs types d'analyseur qui peuvent être couplés entre eux de multiple manières. Mais je ne comprend pas quel est l'intérêt d'utiliser plutôt l'une ou l'autre (particulièrement ESI ou MALDI) de ces sources d'ionisation sachant qu'au final on aura un spectre m/z. Quelqu'un pour m'éclairer.   [...] De plus, la source ESI est facilement couplée à une chromatographie liquide qui va entrainer la séparation des peptides avant l'entrée dans le spectro. Il est bien sur possible de le faire avec un appareil MALDI-TOF mais ca prendra beaucoup plus de temps puisqu'il faudra faire des gels à 2 dimensions par exemple pour séparer au maximum nos protéines puis faire l'extraction de chaque spot, reduction alkylation et digestion qu'on dépose sur la plaque MALDI (aujourd'hui la robotisation fait qu'il est possible de coupler une chromatographie liquide au MALDI).  [...]

[Biochimie] acide aminée absorbtion

les acides aminés ne sont pas forcement absorbés tous en même temps car les protéines doivent être protéolysée pour libérer les acides aminés qu'elles contiennent donc le temps peut être variable.  [...] On ne parle plus vraiment de protéine au niveau intestinal mais de peptides (protéine fragmenté pour faciliter la digestion).  [...]

[Biochimie] séquençage d'une proteine

voila dans l'article les auteurs ont procéder à une digestion enzymatique d'une protéine par la trypsine et par la Asp N. Ensuite ils ont fait une analyse des peptides par HPLC couplé à un spectromètre de masse en tandem. Ce que j'ai pas compris c'est comment en premier temps on identifie les acides aminé sur le profil d'élution de HPLC et comment on determine l'ordre de chaque acide aminé cad comment savoir que c'est une tyrosine et non une lysine ou cysteine et comment on détermine qu'il ya une tyrosine ensuite une methionine ensuite une leucine dans notre peptide.  [...] qd on fait une digestion enzymatique d'une protéines par la trypsine par exemple est ce que après on fait une électrophorèse des différents peptides est ce qu'on extrait la bande correspondant à un peptide donné du gel et ensuite on procède à la HPLC si oui comment se fait cette extraction.  [...]

[Biologie Moléculaire] Les biomolécules Première st2s

les protéines, peptides et holoproteines sont constitués d'acides aminés liés les uns aux autres la liaison entre deux de ces acides aminés est une liaison peptidique.  [...] pour les protéines et peptides, tu représentes les acides aminés sous forme de ronds qui sont reliés par des traits représentant les liaisons peptidique. Par contre, je suis étonnée qu'on te demande de schématiser ou de connaître les liaisons dans une hétéroprotéine (une hétéroprotéine est une protéine qui est liée à de petites chaînes glucidiques par exemple).  [...]

[Biologie Cellulaire] Protéine ou Chaine Polypeptidique?

il est pratique de différencier des peptides (en quelque sorte, de petites protéines mais sans structure tertiaire) et les vraies protéines, celles avec un nombre d'acides aminés très grand, avec des repliements spatiaux, avec des centres actifs, etc.  [...] Non, ce n'est pas de chipotage, mais juste de la classification formelle nécessaire. Et justement, cette classification ne se ferait pas sur l'absence/présence d'une fonctionnalité parce qu'il y en a et chez les peptides, et chez les protéines.  [...]