• Forum - Différent, Expérience, Simulation

Effet de propranolol

Pourquoi l'effet de propranolol sur le coeur in vivo est différent à celui dans une expérience de simulation.  [...]

physique, biologie, Schrödinger

J'ai bien aimé Kurakin (2004), parce qu'il est explicite sur le détails des expériences qui l'ont aidé à façonner le point de vue qu'il présente. De plus, il prend le temps de résumer en confrontant les deux points de vue (comparer par exemple la section Watchmaker patterns et celle intitulée Patterns of self-organization ).  [...] It can be envisaged that the rapid accumulation of quantitative data on diffusion coefficients, binding kinetics, residence times, recruitment probabilities and other parameters obtained for different individual molecules and their complexes will soon provide a self-consistent quantitative framework and fertile ground for large-scale computer modeling and predictive simulation of spatiotemporal dynamics of specific processes, sub-compartments and eventually the cell as a whole.  [...]

[Biochimie] Expérience sur les processus d'apparition de la vie.

Une telle simulation informatique a-t-elle été tentée Je ne veux pas parler d'auto-organisation. Cette expérience ne vise pas à mettre en évidence une auto-organisation seule.  [...] Je vois très mal quelle type expériences mettre en place. On ne sait qu'un processus réplicatif a été mis en place que lorsque l'on observe. Il me semble que l'on peut difficilement adresser des sous questions permettant de progresser par partie. Peut être une solution serait de procéder de manière réverse à partir de structures réplicatives simples. Mais même là je ne suis pas certain.  [...]

Le scénario de l'origine de la vie enfin déterminé ? - Page 8

On this slide you see a description of the experiment. So, to understand the experiment you have to imagine that it's a simulation of the Earth before life appeared on Earth. And on the primitive Earth, you had an atmosphere which is presented on the upper right of this scheme in a [].  [...] Ce qui est important de retenir ici, c'est qu'avant la publication de l'expérience qu'il a proposé à Stanley Miller, Urey était un peu seul contre tous à prétendre que l'atmosphère de la Terre primitive aurait été réductrice. En parcourant la littérature, j'ai remarqué qu'il s'opposait quasi systèmatiquement aux expériences de chimie prébiotique menées à l'époque (à partir de 1946) par le biochimiste américain Melvin Calvin.  [...]

Phasmes !!

Concernant la parthénogenèse chez les phasmes, il semble que ce mode de reproduction permette de coloniser des milieux relativement défavorables (température suboptimale), d'où avantage sélectif local. Me semble même qu'il existe un gradient latitudinal des individus parthénogenétiques chez une espèce, mais laquelle.   [...] Pour revenir au sujet. j'ai élevé des Bacculum extradentatum avec des mâles présents dans l'élevage (pour freiner la croissance de la population). Généralement j'avais toujours moins de mâles que de femelles, même en éliminant régulièrement des femelles (soit les femelles favorisent la parthénogénèse, soit les mâles sont plus fragiles, et résistaient mal aux conditions un peu.   [...]

l'Homme, un programme ?

Pour le modelisateur, il serait interessant d'essayer d'integrer les differents genes (d'une bacterie par ex) puis de voir en fonction de leur fonctionnalité et de leur possible regulation si la cellule (de synthese) se comporte comme prevu. Bon je sais qu'on est surement loin meme pour la plus simple bactérie de connaitre toutes les fonctions de son genome, mais un jour si on a cette possibilité ca pourrait nous aider dans la comprehension de l'impact de l'adn dans le fonctionnement (metabolisme, regulation, adaptation...) de la cellule.  [...] . enfin la simulation serait un etat des lieux des differentes connaissances que l'on completerai et au fil des decouvertes.  [...]

Le scénario de l'origine de la vie enfin déterminé ? - Page 12

Le réseau de réaction est également simplifié au maximum. Dans le cas d'une vérification expérimentale, ou d'une simulation plus réaliste, ces défauts devraient évidemment être corrigés. Toujours par simplification, la simulation a lieu dans un système clos, il n'y a donc ni échange de matière, ni échange d'énergie, venant de l'extérieur des deux compartiments simulés.  [...] Elles sont donc séparées physiquement l'une de l'autre, la réaction non-énantiosélective ayant lieu dans le compartiment à plus haute température, tandis que la réaction énantiosélective a lieu dans le compartiment à une température plus basse. Toutes ces nuances ayant été mentionnées, il va s'en dire, comme le précise les auteurs, que la publication tente à prouver une faisabilité thermodynamique tout au plus (ce qui n'est déjà pas si mal, à défaut de simulations plus poussées ou de vérifications expérimentales).  [...]

[Biologie Moléculaire] Enigme: repérer une suite de codons dans l'ADN

Il existe 64 codons (triplet de nucléotides) dont 3 codons stops et 1 codon start, du coup si on élimine ces deux dernier types dans le calcul qui comme tu dis. (car sans valeur pour un professionnel et ne serait donc pas décrit)..je dirais qu'on aurait alors 3 exposant 60(nombre de codons)*2(nombre d'histones différents), ainsi cela revient à faire le calcul de 3^120.  [...] L'étape suivante est effectivement une simulation des fonctions des protéines qui résulteraient des différentes combinatoires.  [...]

[identification][microscopie] Les mystères de la flaque...

En fait ce que j'aimerai faire, c'est isoler proies et prédateur, en éliminant les autres espèces, afin d'etudier la dynamique des deux populations. Mais en général, à l'origine d'une chaine il y a tjrs des bactéries dont il est difficile de se débarasser.   [...] Sinon vous savez où je peux trouver des renseignements tels que temps de division, esperance de vie, etc...de différents micro organismes. C'est pour une simulation informatique.  [...]

[Divers] Tipe

Je n'ai plus les textes officiels en tête, c'est possible que ce ne soit pas obligé de faire de manipulations pour les Tipe, mais je n'en suis pas sûre. En tout cas, dans la pratique il faut éviter de faire un Tipe sans aucune manip', surtout en bio ou géol qui sont quand même des sciences expérimentales.  [...] Pour la manipulation, une simulation informatique est considérée comme telle. Tu peux trouver différents moyens de calculer le nième terme de la suite de fibonacci (avec un tableau de valeur, par incrémentation/récurrence, etc...). Ca se fait très bien et se trouve facilement sur internet.  [...]