• Forum - Dégradation, ARNm, Cellule

[Journal club] Extinction de l'expression de gènes par les siRNA : la découverte

En revanche, l'introduction d'ARN double brin de 38 à 1662 nucléotides dans des cellules de mammifères en culture déclenche une dégradation non spécifique de tous les ARNm cellulaires (Ui-Tei et al., FEBS Lett., 2000) aboutissant à la mort de la cellule.  [...] En normalisant l'activité GL2 en présence des dsRNA GL2, GL3 ou RL par rapport à son activité en présence du dsRNA hGFP, ils observent une spécificité de l'extinction, mais imprécise puisque dsRNA GL3 éteint GL2 avec la même efficacité que dsRNA GL2. Dans ce cas, la spécificité doit être vue comme une dégradation plus intense pour l'ARNm ciblé que pour l'ensemble des ARNm de la cellule.  [...]

[Biochimie] Translocation élongation chaine polypeptidique

5' de dégrader l'ARNm. Toutefois il y a un cycle de fixation/libération de l'ARNm par ces protéines. Ainsi, lorsque la PABP la plus en 3' libère transitoirement l'ARNm, une exonucléase a le temps de dégrader l'ARNm jusqu'à ce qu'elle rencontre une autre PABP.  [...] Et ainsi de suite jusqu'à la dégradation de l'ARNm. Donc la longueur de la queue polyA est un des déterminants de la demi-vie d'un ARNm au sein d'une cellule.  [...]

ARN message et messager

Car l'ADN risque moins de s'abimer du coup. Cette information va être transmise à de nombreuses cellules, il faut la préserver. D'ou tout un système complexe dans le quel intervient l'ARN.  [...] 3ème partie. Importance de l'ARNm. sa régulation (et la tu fais régulation de la traduction, dégradation de l'ARN, localisation des ARN dans la cellule, etc...), importance de sa régulation (pathologies, cancers...).  [...]

[Biologie Moléculaire] miRNA (ou microARN)

De ce que j'en sais, c'est un mécanisme découvert par hasard chez le ver Caenorhabditis elegans. Il consiste à la dégradation des ARN messagers (ARNm) d'une cellule eucaryote pas un systeme protéique appelé RISC (RNA-induced silencing complex). Ce système est activé par la présence de petits ARN double brin.  [...] Par contre d'après les publi que j'ai lues (citées dans un post un peu plus haut), l'enzyme DICER n'est pas le seul point commun. il y a aussi le complexe RISC. Les miRNA de 21 nt s'insèrent dans le miRISC, ce qui provoque la dégradation des ARNm de la même manière qu'avec les siRNA.  [...]

[Biologie Cellulaire] Dégradation des ARNm par la voie du NMD

Car si la dégradation de l'ARNm par la voie du NMD est liée à la persistance de protéine EJC, la présence d'un codon stop situé, par exemple, un peu n'importe où avant les 50 nucléotides en amont de la dernière jonction exon/exon conduit à la persistance, au moins au niveau de cette dernière jonction, de protéine EJC et par conséquent à la dégradation de l'ARNm.  [...] En fait, il va y avoir dégradation de l'ARNm si le ribosome (pourquoi tu ne parles que de la petite sous-unité ) ne parvient pas à enlever tous les EJC (mon prof appelait ça les protéines de marque, je sais pas si tu as eu ce nom aussi en cours) qui sont aux jonctions otenues après épissage.  [...]

ARN double-brins

Le principe est d'exprimer un petit ARN complementaire a une portion d'un ARNm. Apres ce petit ARN va s'apparier avec la region de l'ARNm concernee. La il y a deux cas de figures. Le complexe d'ARN double brin est pris en charge par un complexe enzymatique qui va provoquer la degradation complete de l'ARNm.  [...] Dans les cellules de mammiferes, le silencing dans les cellules quiescentes durent au mieux 48 a 72 h. Il diminue ensuite et se perd ne resistant pas probablement a la dilution du aux divisions cellulaires, a la degradation etc... Chez C.elegans, comme tu le disais il s'amplifie et c'est probablement la raison pour laquelle le silencing perdure et peut meme se transmettre a la generation suivante (resistant aux dilutions et a la degradation).  [...]

ARN traduction protéique

La dégradation d'un ARNm comporte plusieurs étapes régulées. Les ARNm sont dégradés petit à petit. Des exonucléases raccourcissent la queue polyA jusqu'à ce qu'il ne reste plus que 10 A. A ce moment là, il y a une étape de décapitation pour enlever la coiffe en 5'.  [...] Et inversement lorsque le fer est abondant, IRE-BP est inactive, ne se fixe pas aux séquences IRE qui se trouvent donc exposer à la dégradation, il y a moins de transferrine produite donc moins de fer transporté dans la cellule.  [...]

[Biologie Moléculaire] miRNA (ou microARN) - Page 3

Ceci génère une molécule SIMPLE brin chargée sur le complexe RISC (RNA Induced Silencing Complex) qui va l'adresser sur son ARNm cible. Dès lors, soit le miARN s'apparie parfaitement et cela entraîne dégradation de l'ARNm, soit l'appariement est imparfait et cela entraîne inhibition de la traduction.  [...] 3- l'aspect cellulaire du processus. Les deux mécanismes impliquent un ciblage d'un ARNm dans des structures cytoplasmiques impliquées dans la dégradation et le stockage d'ARN.  [...]

[Biologie Moléculaire] extraction faible qté ARN

La DO de mes ARN me donne une forte absorbance à 230 et légère à 270. est-ce le signe d'une forte une dégradation des ARN à 230 et d'une contamination au phénol à 270.  [...] Selon moi, c'est complètement normal de voir un smear de fond, quoique quand même beaucoup plus faible que les 28S/18S (d'ARNr et non d'ARNt d'ailleurs). Tu observes ainsi tous les ARNm de la cellule à des tailles différentes. Ce qui n'est pas normal, c'est d'observer une apparence de smear qui débute à la bande des ARNr... donc une dégradation de ceux-ci.  [...]

[Biologie Moléculaire] miRNA (ou microARN) - Page 2

Le but de l'hétérochromatinisation est d'éteindre l'expression des gènes en empêchant la transcription. c'est une stratégie complémentaire à celle de la dégradation des ARNm ou du blocage de leur traduction.  [...] Le fait qu'on pensait que les siRNA étaient impliqués dans le dégradation d'ARNm viendrait d'une mauvaise identification, d'où confusion. Ce ne serait pas étonnant vu la nouveauté du domaine et du peu de connaissances dont on dispose.  [...]