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[Biochimie] ARN interférent

On peut dire que le siRNA est lui-même un ARN interférent, cela signifie small interfering RNA. Il peut être introduit artificiellement dans la cellule, c'est ce qui est fait en laboraroire pour inhiber l'expression d'un gène, mais certains organismes ont des siRNAs endogènes.  [...] La réponse interféron induit la dégradation de l'ensemble des ARNm de la cellule. Donc la spécificité est nulle. Voilà pourquoi on utilise les siRNA et shRNA sur ces cellules qui eux permettent de cibler spécifiquement la dégradation d'un ARNm particulier.  [...]

[Journal club] Extinction de l'expression de gènes par les siRNA : la découverte

En revanche, l'introduction d'ARN double brin de 38 à 1662 nucléotides dans des cellules de mammifères en culture déclenche une dégradation non spécifique de tous les ARNm cellulaires (Ui-Tei et al., FEBS Lett., 2000) aboutissant à la mort de la cellule.  [...] En normalisant l'activité GL2 en présence des dsRNA GL2, GL3 ou RL par rapport à son activité en présence du dsRNA hGFP, ils observent une spécificité de l'extinction, mais imprécise puisque dsRNA GL3 éteint GL2 avec la même efficacité que dsRNA GL2. Dans ce cas, la spécificité doit être vue comme une dégradation plus intense pour l'ARNm ciblé que pour l'ensemble des ARNm de la cellule.  [...]

[Biochimie] Translocation élongation chaine polypeptidique

5' de dégrader l'ARNm. Toutefois il y a un cycle de fixation/libération de l'ARNm par ces protéines. Ainsi, lorsque la PABP la plus en 3' libère transitoirement l'ARNm, une exonucléase a le temps de dégrader l'ARNm jusqu'à ce qu'elle rencontre une autre PABP.  [...] Et ainsi de suite jusqu'à la dégradation de l'ARNm. Donc la longueur de la queue polyA est un des déterminants de la demi-vie d'un ARNm au sein d'une cellule.  [...]

[Biologie Cellulaire] ARNm

ça dépend. Tous les ARNm n'ont pas la même durée de vie. Certains paramètres conditionnent leur durée de vie (queue polyA, certains systèmes de dégradation permettant une régulation post traductionnelle, etc...). Un ARNm est réutilisé bien sur, sinon ça ne serait pas très rentable pour la cellule.  [...] Je ne saurais pas te dire quelle est la proportions d'ARNm dans ce cas, mais je peux te donner un exemple. celui des ARNm de protéines impliquées dans le développement embryonnaire. ils sont stockés dans l'ovocyte I, stagnent, et leur traduction s'amorce après fécondation, lors de la reprise de l'activité métabolique de la cellule.  [...]

ARN message et messager

Car l'ADN risque moins de s'abimer du coup. Cette information va être transmise à de nombreuses cellules, il faut la préserver. D'ou tout un système complexe dans le quel intervient l'ARN.  [...] 3ème partie. Importance de l'ARNm. sa régulation (et la tu fais régulation de la traduction, dégradation de l'ARN, localisation des ARN dans la cellule, etc...), importance de sa régulation (pathologies, cancers...).  [...]

[Biologie Moléculaire] miRNA (ou microARN)

De ce que j'en sais, c'est un mécanisme découvert par hasard chez le ver Caenorhabditis elegans. Il consiste à la dégradation des ARN messagers (ARNm) d'une cellule eucaryote pas un systeme protéique appelé RISC (RNA-induced silencing complex). Ce système est activé par la présence de petits ARN double brin.  [...] Le rapport entre ARNi (par l'intermédiaire des siRNA) et miRNA, c'est le mécanisme d'action. clivage par l'enzyme DICER, insertion dans un complexe RISC et activation de celui ci, reconnaissance des ARNm complémentaires et dégradation.  [...]

[Biologie Cellulaire] Dégradation des ARNm par la voie du NMD

Car si la dégradation de l'ARNm par la voie du NMD est liée à la persistance de protéine EJC, la présence d'un codon stop situé, par exemple, un peu n'importe où avant les 50 nucléotides en amont de la dernière jonction exon/exon conduit à la persistance, au moins au niveau de cette dernière jonction, de protéine EJC et par conséquent à la dégradation de l'ARNm.  [...] En fait, il va y avoir dégradation de l'ARNm si le ribosome (pourquoi tu ne parles que de la petite sous-unité ) ne parvient pas à enlever tous les EJC (mon prof appelait ça les protéines de marque, je sais pas si tu as eu ce nom aussi en cours) qui sont aux jonctions otenues après épissage.  [...]

ARN traduction protéique

La dégradation d'un ARNm comporte plusieurs étapes régulées. Les ARNm sont dégradés petit à petit. Des exonucléases raccourcissent la queue polyA jusqu'à ce qu'il ne reste plus que 10 A. A ce moment là, il y a une étape de décapitation pour enlever la coiffe en 5'.  [...] Les ARNm qui ont une durée de vie courte ont une région riche en A et en U dans la région 3'. Des protéines spécifiques peuvent s'y fixer pour réguler la vitesse de dégradation de l'ARNm. Cette vitesse de dégradation changera donc pour chaque l'ARNm différent selon l'importance de ses régions riches en A,U et la présence de protéines régulatrices.  [...]

[Biologie Moléculaire] Protection de l'ARNm au début de synthése et fin de transcription

En fait c'est un mécanisme d'inactivation de l'expression d'un gène au niveau transcriptionnel. Un ARNm néosynthétiser est hybridé à un ARNi de courte séquence, il en résulte un ARN double brin ce qui est une 'anomalie' pour la cellule, l'association à un complexe RISC va alors permettre la dégradation de l'ARNdb par une activité Rnase.  [...] attention, chez les plantes, par exemple, les miRNAs menent a la degradation dans 50 pour cent des cas et a l'inhibition traductionnelle dans les autres, donc on ne peut plus dire miRNA = traduction.  [...]

ARN double-brins

Le principe est d'exprimer un petit ARN complementaire a une portion d'un ARNm. Apres ce petit ARN va s'apparier avec la region de l'ARNm concernee. La il y a deux cas de figures. Le complexe d'ARN double brin est pris en charge par un complexe enzymatique qui va provoquer la degradation complete de l'ARNm.  [...] Dans les cellules de mammiferes, le silencing dans les cellules quiescentes durent au mieux 48 a 72 h. Il diminue ensuite et se perd ne resistant pas probablement a la dilution du aux divisions cellulaires, a la degradation etc... Chez C.elegans, comme tu le disais il s'amplifie et c'est probablement la raison pour laquelle le silencing perdure et peut meme se transmettre a la generation suivante (resistant aux dilutions et a la degradation).  [...]