• Forum - Décalage, Séquence, ADN

Bioinformatique - Etudes d'une sequence d'ADN

Quels sont les indices les plus important qu'il est a calculer sur une sequence d'ADN afin de la comparer a d'autre sequence d'ADN.  [...] Blast, c''est le plus facile et le plus lisible c'est blast, ORF contre ORF, mais fait aussi un Blast ADN vs ADN, car si il y a une erreur de séquence provoquant un stop ou un décalage de cadre (dans la tienne, ou dans la banque) tu peux perdre de l'info, il y a beaucoup d'erreurs dans les banques, par ex fais un Blast en utilisant le polylinker d'un pUC quelconque, tu verras.  [...]

[Génétique] mutation non ponctuelle

En relisant mes cours je me suis rendue compte que je n'avais pas bien compris ce qu'était la duplication. Enfin si, j'ai tout de même compris que c'était la copie supplémentaire d'un gène. Seulement, je voudrais savoir les conséquences que ça a. Est-ce-que l'ajout d'un gène entraine une délétion du gène à qui il prend la place ou bien y a-t-il décalage dans la séquence de l'ADN.  [...] d'accord...ca explique tout. la molécule d'ADN s'agrandit, ce qui n'implique pas de changement direct sur la molécule, si j'ai bien compris.  [...]

anticorps

Lorsqu'une cellule B porteuse d'anticorps est activée par reconnaissance de l'antigène, elle va se mettre à produire des anticorps secrétés et déclencher une nouvelle mutation de ses régions hypervariables à partir des anticorps utiles, resélection et nouvelle banque d'anticorps.   [...] En fait comme l'explique mantos, il y a en fait des fragments de gènes qui vont se recombiner par excision des séquences d'ADN entre les fragments sélectionnés. Au niveau de la zone de ligature des fragments, il y a un mécanisme qui permet qu'elle ne soit pas réalisée excactement de la même façon, avec même un possible décalage du cadre de lecture (pour un chromosome, sacahnt qu'on a deux chaines et trois fragments à assembler ça fait relativement peu d'anticorps fonctionnels par décalage du cadre de lecture, en fait la cellule dispose d'une deuxième chance avec le chromosome homolgue si ça échoue), c'est l'explication de l'existence des régions hypervariables.  [...]

[Génétique] Mutagénèse in vivo (élément P) petite question bête

l'élement manquant est peut-être que l'élément P n'est pas autonome et qu'il doit se trouver une séquence d'un gène pour être exprimé.  [...] Mais alors, comment son insertion ne modifie-t-elle pas sa propre séquence, induisant un décalage de lecture et donc un marqueur (ici yeux rouges) érronné.  [...]

DM 1ère S biologie

Phase codante, car on peut lire une séquence nucléique selon 3 phases, puisqu'il s'agit de triplets (en décalant chaque fois d'une base le début de la lecture). Mais une seule de ces phases, commençant au codon initiateur, code pour la protéine.  [...] une erreur qui provoque un décalage du cadre de lecture et donc qui te donne la mauvaise séquence... tu fais du frameshift sans le savoir.  [...]

L'X fragile

Concernant l'X fragile, d'après ce dont j'ai compris c'est une répétition anormale de la séquence CCG (plus de 200fois) et cette répétition touche l'hétérochromatine c'est a dire les séquences de l'ADN qui sont réprimés, alors pourquoi y a t-il l'apparition d'une maladie.  [...] Salut, mon professeur m'a dit que cette répitition de cette même séquence tend à fragiliser le gêne qui est donc susceptible à être rompu. Je ne sais pas si ça vous éclairera... Maintenant je ne sais pas pourquoi cette répétion en elle méme favorise la cassure.  [...]

mutation génétique

il peut arriver énormément de choses à la protéine. La transcription/traduction se déroulera normalement, et par exemple, si tu avais AAA CCC GGG AAA TTT (...) comme séquence sauvage, et qu'après mutation tu obtiens AAA CC GGG AAA TTT (...), tu auras donc comme codons. AAA CCG GGA AAT TT (...).  [...] une délétion hors phase a des conséquences dramatiques sur la séquence, d'autant plus qu'elle se produit en début de séquence codante. Dans le cas d'un décalage de cadre, en général on tombe très très rapidement sur un codon stop, donc en plus d'avoir une protéine qui n'a rien à voir, elle a des chances d'être raccourcie.  [...]

Mutagène

J'aimerais que quelqu'un m'explique le mode d'action d'une substance mutagène sur l'Homme, c'est à dire de son caractère mutagène. Ou alors, si vous aviez un site internet à me conseiller, parce que je ne trouve rien nul part... Merci.   [...] Un mutagène provoque une modification du patrimoine génétique d'un organisme, généralement en provoquant un mésapariement des bases de l'adn, ou en s'intercalant dans l'adn provoquant un décalage du cadre de lecture (bromure d'ethidium).  [...]

[Biochimie] comparer 2 séquences nucléotidique

Ensuite tu as ta premiere séquence nucléotide qui est fonctionnelle et la deuxieme qui ne l'ai pas regarde bien tes lettres en fonction de la premiere tu verras qu'il y a des variantes.  [...] tu peux être beaucoup plus précise, en fait la différence entre ces deux séquences est qu'il manque quelques bases ce qui créé un décalage de la séquence. Trouves les bases qui ont été supprimées.  [...]

[Biologie Moléculaire] Mutation

A ma connaissance, il peut y avoir une région régulatrice dans le premier intron, en 5'UTR, donc si cette séquence est mutée, ça peut entrainer des effets sur la régulation de l'expression du gène. De plus, si une mutation affecte un site accepteur ou donneur, ça peut empêcher l'épissage d'avoir lieu.  [...] De fait, si la fraction intronique non épissée est traduite, ça peut conduire à un décalage du cadre de lecture pour les exons suivants (si la taille de l'intron est différente de 3n) ou à l'ajout d'une séquence dans la protéine.  [...]