• Forum - Coupure, Enzymes, Restriction

[Biologie Moléculaire] Prédiction de coupure d'un génome par des enzymes de restriction

Je me tourne vers la communauté pour savoir si l'un d'entre vous connait un site permettant de prédire le nombre de coupures d'un génome entier de bactéries (4Mb) par des enzymes de resctrictions.  [...] Un peu moins flexible quand au choix des génomes ou séquence et dans le choix des enzymes mais remplit bien son rôle, il m'a donné un début de réponse.  [...]

Enzyme de restriction

Bonsoir, lorsqu'on fait une carte de restriction, l'ADN (en rond) c'est bien celui de l'enzyme.  [...] Je crois qu'il y a confusion. Comment vois-tu une enzyme de restriction Quelle action de l'enzyme de restriction regardes-t-on lorsqu'on effectue la carte de restriction d'un plasmide Pour information, ce qui est représenté sur une carte de restriction ce sont les sites de coupure par des enzymes de restriction, et non pas les enzymes de restriction elles-mêmes.  [...]

Besoin que l'on eclaire ma lanterne en Génetique

La RAPD est une technique de PCR permettant d'obtenir une empreinte spécifique à partir d'un génome donné. On utilise pour cela des amorces ayant une faible spécificité (elle s'accrochent à de multiples endroits de l'ADN). Comme tous les génomes sont différents, les sites de fixation des amorces seront variables d'un individu à l'autre.   [...] Je connais moins bien l'AFLP, mais il me semble que c'est la technique utilisée pour les empreintes ADN humaines (par exemple en criminologie). Elle se base sur la restriction du génome, c'est à dire coupure par des enzymes de restriction. On utilise des enzymes ayant un site de restriction assez rare.  [...]

La PCR fragments d’adn

Par ailleurs si votre groupe ne prévoit pas de parler du destin de l'ADN non codant amplifié à l'issue de la PCR il serait bien d'en parler (voir enzymes de restriction, électrophorèse sur gel d'agarose et southern blot). Car une PCR seule ne mène à aucune identification.  [...] Vous avez bien compris la chronologie des événements. PCR puis électrophorèse. Mais vous ne mentionnez pas les enzymes de restriction alors que c'est le plus important, c'est cette coupure par les enzymes de restriction de l'ADN non codant précédemment amplifié en PCR qui va permettre de donner des profils différents, qui seront ensuite révélés sur le gel après électrophorèse.  [...]

[Biologie Moléculaire] enzyme de restriction pourquoi elle ne clive pas tout les ADNs ?

j'ai une question pourquoi les enzymes de restrictions ne clive pas tout les ADNs par exemple HindIII ne clive pas l'ADN d'une cellule du foie humaine alors que pour l'ADN de phage lambda elle le clive en libérant plusieurs fragments comment ce la ce fait il.  [...] Tu sais que les enzymes de restriction ne clivent que si elles reconnaissent un site spécifique. S'il n'y a pas coupure, cela peut être à cause de deux raisons.  [...]

extraire de l'ADN

Pour le reste, certaine enzyme de restriction sont effectivement incapable de couper l'ADN si celle-ci es méthylée au niveau du site de coupure (à l'inverse il existe des enzyme qui cliveny spécifiquement ces sites).  [...] La méthylation (dans le cadre de la protection contre des enzymes de restriction) est effectué par des méthyltransférases qui vont reconnaître un site de coupure d'une enzyme de restriction et vont ajouter un groupement méthyle au niveau de ce site (souvent au niveau d'une cytosine).  [...]

[Biochimie] Commentaires et analyses d'une photo d'électrophorèse sur gel d'agarose après PCR

Je suis en L3 chimie et n'ai encore jamais fait de biochimie dans ma vie. Avant ce module était optionnel mais depuis cette année il est obligatoire pour tous.   [...] Le but du TP est. caractérisations de différents génotypes de tabac et recherche du génotype d'une espèce inconnue par étude du gène d'une enzyme chloroplastique, l'ATPase, par coupure par des enzymes de restriction.  [...]

[Biologie Moléculaire] Réparation mutation, structure Holliday

Lors de l'analyse des allèles dans une famille dans laquelle on cherche la présence d'un fragment connu, On peut utiliser 2 techniques. RFLP ou Carte de restriction, bien que je les connaisse en gros, je ne comprends pas bien pourquoi ce serait plus rapide (ou simple) avec les enzymes de restriction.  [...] La plupart des cartes de restrictions sont de petite taille (haute résolution), même si l'on peut construire des cartes de grande taille à l'aide d'enzymes de restriction dont les sites de coupure sont rares.  [...]

[Biologie Moléculaire] logiciel clonage

Sinon sur le site NEB par exemple tu as une page avec à peu près toutes les enzymes de la création. http.//www.neb.com/nebecomm/products/category1.asp#2. Tu cliques sur le nom et tu as le site de restriction. Ça prend 10 secondes.  [...] En effet, certains appellent cela le clamp et il permet d' internaliser le site de restriction. En effet, les enzymes de restrictions sont des endonucléases si bien que leur site de coupure doit être à l'intérieur d'une séquence ADN, et non en bordure.  [...]

[Génétique] Intégration ADNc

Les enzymes de restriction coupent des sites spécifiques, en laissant des sites coupés spécifiques de chaque enzyme. Si les sites sont semblables, il peut donc y avoir jonction. C'est comme cela qu'on insère un gène.  [...] Même si tu peux aussi couper ton plasmide avec une ou 2 autres enzymes qui génèrent des extremités cohésives compatibles avec celles de ton insert. C'est-à-dire que tu peux avoir un site de restriction reconnu par une enzyme différente mais une fois la coupure faite, l'extremité genérée est compatible avec celle de ton enzyme.  [...]