• Forum - Compte rendu, Extrait, Protéines

[Biochimie] Purification de la beta-gal

(je copie colle ce que j'ai écris dans mon compte rendu et on dispose d'un extrait bactérien qui a subit lyse membranaire et dialyse donc dans l'extrait on a que des protéines).  [...] Je serai tenté de dire que dans les fractions issues de l'extrait bactérien nous n'avons pas de protéines chargées positivement et/ou neutres ainsi que dire que la béta-gal est la dernière protéine a s'être retirer de la colonne (car pas de coloration bleu dans la fraction 10 après ajout du bleu de coomassie) mais je trouve que cette conclusion est très vulgaire et je doute que ce soit cela.  [...]

[Biologie Cellulaire] Problématique de TP

Je ne vois pas bien pourquoi il devrait y avoir une problématique...un compte-rendu...c'est juste rendre compte du déroulement des opérations.  [...] Ben, c'est bien ce que j'ai écrit, non Entre compte-rendu et rendre compte, en toutes lettres. Juste que je ne voyais pas ca comme une problématique...enfin, on ne nous présentait pas la chose comme ça, à l'époque, on nous demandait juste de dire ce qu'on avait fait et pourquoi, comme tu le dis.  [...]

[Divers] Les neurones

Pour la mort des neurones, j'ai trouvé ça comme explication (extrait d'un compte-rendu de la conférence prononcée par Jean Claude Ameisen sur le suicide cellulaire, tout le texte ici ).  [...] (Il faut dire que compter les neurones des morts, c'est pas terrible vu que ce sont les premières cellules à en pâtir). Et que cette idée de mort neuronale serait véhiculé par hmm le parisien par exemple, alors il nous a dit qu'on peut lui apporter quand il veut un article scientifique prouvant le contraire.  [...]

[Biologie Moléculaire] Extraction d'ARN pour puce

j'essaye d'extraire des ARN bactériens à partir d'un nombre restreint de cellules dans une solution qui contient pas mal de proteines. déjà c'est pas très simple d'avoir une quantité suffisante pour puce (10µg), et en plus je viens de les vérifier sur une puce agilent et je me rend compte que la plupart de mes arn extrait sont des 5s.  [...] donc je vais essayé une extraction en congelant mes culots (sans rien) se qui me fait un peu peur, j'ai deja essayé le RNA latter, mais ca m'a bien compliqué les choses parceque il precipite les proteines.  [...]

activité spécifique d'une enzyme et dilution

En TP de biochimie nous avons étudié l'activité de la péroxydase de navet en fonction de différents paramètres. En faisant le compte rendu, il apparaît que l'activité spécifique de la péroxydase augmente au fur et à mesure que l'on dilue l'extrait brut...et je ne vois pas comment cela est possible.  [...] Car normalement, même en diluant ton extrait brut, l'activité spécifique des différentes dilutions resteraient les même car l'unité est des UIE/mg. Par contre, quand tu purifie la peroxydase, tu augmente la proportion de celle-ci et tu diminue la proportion des autres protéines contaminantes.  [...]

[Biotechnologie] Global Analysis of Protein Activities using proteome chips

Les protéines interagissent avec tout (ADN, ARN, autres protéines, lipides, sucres, vitamine, hormones...). Ils auraient aussi pu choisir un autre comosants. Mais le fait de le réaliser avec des lipides est comme même plus difficile (cela reste de l'huile comme même.).  [...] Donc je reprends. l'étude du protéome, c'est étudier la composition en protéines d'un extrait cellulaire (l'idéal étant d'une cellule unique) avec suffisamment de précision pour différencier les changements post-transcriptionnel des protéines.  [...]

[Biochimie] Extraction d'un extrain protéique embryonnaire

2. Ma deuxième question concerne la conservation des protéines, je ne sais pas si je dois les garder dans un tampon (buffer) ou si mon extrait de protéine resterait stable à 4°C dans l'eau. Je ne sais pas non plus si le plus simple est de hyophiliser l'extrait et de le garder en poudre.  [...] Est-ce que en poudre on ne dénature pas complètement les protéines Ce n'est pas pour faire un Western ou autre, je veux juste isoler les proténes, qu'elles soit fonctionnels ou non, simplement avoir un extrait de protéines embryonnaires.  [...]

artemisia annua et extraction de composés

J'étudie l'activité antioxydante de l'Artemisia et je veux aussi utiliser le phenol qui y est contenu, mais je veux faire tout ça avec un seul extrait d'où ma question sur la méthode d'extraction à utiliser. Je penche plus vers l'extraction à reflux pour avoir plus de rendu mais je ne suis pas sûr à 100%. J'ai peur de dégradé les composés.  [...] De ce que j'ai comprit utiliser des extraits d'artemansia augmenterait les taux de ROS sanguin ( reactive oxygen species ) ( donc l'inverse d'un agent anti-oxydant ).  [...]

[Biologie Moléculaire] Régulation de NFAT5

Donc l'idée est de faire une immunoprécipitation des protéines ubiquitinilées. Puis un western anti ubiquitine permet de voir l'ensemble des protéines précipitées. Ensuite, sur le même extrait on fait un western anti NFAT5 afin de savoir si il fait partie des protéines précipitées.  [...] La panneau input correspond à l'extrait protéique qui ne c'est pas fixé sur les billes (non immunoprécipité). C'est un contrôle qui permet de s'assurer que les protéines sont quand même présentes dans l'extrait au départ. Si on ne le fait pas on est jamais certain que NFAT5 est présent dans l'extrait initial et du coup un résultat négatif pourrait simplement correspondre à une absence de protéine.  [...]

[Biologie Moléculaire] Nettoyage d'ARNs & Transfert de protéines

Concernant la qualité des ARNs, ça ne change rien que tu récupère ou pas les protéines. Les protéines, quand à elles, sont censées être correctement extraites (d'après la biblio), mais j'attends de faire une migration pour m'en assurer.  [...] Je me doute que la qualité de l'ARN ne change pas que tu récupère ou non les protéines avec le Rneasy kit Qiagen puisque'à la base c'est un kit optimiser pour extraire l'ARN. Je parlais d'autres kits. Moi je n'extrait pas mon ARN le jour du prélèvement, je le congèle après l'avoir mis dans du RNA later c'est pour cela que je ne peux pas récupérer les protéines par la suite. Ce n'est pas compatible.  [...]