• Forum - Complémentarité, Séquence, Plasmide

[Génétique] Question qui me tracasse beaucoup ( information génétique )

Parce que imaginons qu'on coupe une séquence ( TAAGCG ) du plasmide on prendra une séquence de l'ADN étranger mais qui a les même bases azotées pour qu'elle soit complémentaire avec l'autre brin du plasmide parce que si on prendre d'autres bases, il n'y aura pas complémentarité ( G avec C, T avec A ).  [...] Il faudra bien choisir les enzymes de restrictions selon le plasmide mais également leurs séquences (par rapport à notre gène) car on va l'insérer grâce à la complémentarité des bases.  [...]

PCR problème de poids moléculaire

Alors voilà j'ai reçu un plasmide d'un collaborateur contenant une séquence qui m'intéresse. Je dois récupérer cette séquence pour la sous-cloner dans un autre vecteur. J'ai donc designé 2 primers contenant le début ou la fin de ma séquence + un site de restriction enzymatique.  [...] alors ce ne sont pas des problèmes de migration ou d'agarose j'ai vérifié... J'ai pensé à la complémentarité mais quand je séquence le plasmide de départ avec les primers utilisés pour ma PCR je retrouve la séquence attendue, ce qui veut dire qu'ils s'hybrident au bon endroit.  [...]

[Biotechnologie] Principe de la PCR

montrer la meilleure complémentarité possible avec les deux extrémités de la séquence d'intérêt que l'on souhaite amplifier. L'une des amorces.  [...] Le choix de la durée des cycles de température et du nombre de cycles dépend de la taille de la séquence d'intérêt ainsi que de la taille et de la complémentarité des amorces. Il convient de réduire les durées au minimum non seulement pour un gain de temps mais aussi pour prévenir le risque d'amplification non spécifique.  [...]

[Biologie Moléculaire] Sperme de saumon

Ca dépend de ta séquence et de ta sonde, si il n'y a pas une extreme complémentarité... mais bon, je pense qu'il y a sur le forum des personnes plus aptes à répondre.  [...] Effectivement le sperme de saumon est utilisé pour saturer les sites libres de la membrane. plus précisément, les acides nucléiques intéragissent fortement entre eux via les bases complémentaires, mais peuvent aussi intéragir via des liaisons électrostatiques (dûe aux charges de la liaison phosphate, ou au cycle des bases) avec les groupements chargés des membranes.  [...]

[Biologie Moléculaire] Liaison spécifique d'un protéine à l'ADN

La reconnaissance doit très probablement se faire par complémentarité de séquence. Du moins (d'après mes connaissances) c'est le cas pour la grande majorité des protéines reconnaissants les sites de régulation au niveau du promoteur.  [...] Sachant que la TATAbox a une importante composition en A/T, la TBP devrait avoir un site complémentaire à cette séquence. Cependant, la séquence concensus de la TATAbox peut légèrement varier. Donc il pourrait y avoir quelques problèmes si la reconnaissance ne se faisait qu'en fonction de la complémentarité selon moi.  [...]

[Biologie Moléculaire] le mystère des séquences non codantes

Il ne faut pas interpréter les choses ainsi. une séquence codante code pour une protéine et est donc utile pour la cellule alors qu'une séquence non-codante ne code rien et est inutile. Loin de là. Une séquence codante donne une protéine alors que l'autre permet à ta cellule de contrôler quand, comment et dans quelle circonstances une séquence codante doit être transcrite et/ou traduite.  [...] La séquence Shin-Dalgarno par exemple, est une séquence consensus (très généralement entendons le bien) dont l'enchaînement des bases est complémentaire à l'enchainement des bases d'un ARNr présent dans les ribosomes. Cette petite complémentarité va amener le ribosome à se lier à cette séquence.  [...]

[Génétique] ADN polymerase

Selon le cours, la plupart des polymérases utilisées en PCR ajoutent une base A en 3' du fragment à amplifier.   [...] Ensuite, les fragments PCR ainsi formés sont utilisés pour une intégration dans un plasmide ouvert qui porte une base U 3' sortants. Est-ce qu'une ligation est possible et spécifique losque la complémentarité entre l'insert et le plasmide vient seulement d'une seule base.  [...]

[Biologie Moléculaire] séquence de nucléotides

Si la question concerne uniquement la séquence nucléotidique, la séquence fille est forcément différente de la séquence mère puisque l'assemblage se fait par complémentarité (sauf rares exceptions). Exemple.  [...] merci c'est logique mais est ce que en raiseau du principe de complémentarité seulement que les deux séquences sont différentes.  [...]

[Divers] Epissage

Je suis pas très bien informé dans le domaine mais je pense que à partir du moment où l'on connait la séquence nucléotidique d'un gène et la séquence en acides aminés de sa protéine,ça ne pose pas de problème. En effet à partir du moment où tu connais la séquence d'un gène tu peux en déduire la séquence de l'ARN messager immature correspondant (par complémentarité).  [...] Or, si tu connais le polypeptide correspondant à ce gène (supposons une protéine entière pour se faciliter la vie), tu remarques que si tu essayes de retrouver la séquence de l'ARN messager mature à partir de sa séquence en acides aminés, tu trouveras un ARN mature différent (plus court) que l'ARN messager immature dont on avait parlé plus haut.  [...]

Une technique de séquençage simple

La notation 5' - 3' correspond à la polarité d'une séquence d'ADN (ou d'ARN). Ces chiffres proviennent de la nomenclature des carbones du ribose ( image ). On parle dans le cas du ribose de carbone 3 ' et non de carbone 3, celui-ci étant utilisé dans la nomenclature des bases azotées (A,T,C,G,U).  [...] Dans le cas de l'ADN, des brins étant appariés de manière complémentaire et anti-parallèle ont une polarité inversée ( image ).  [...]