• Forum - Compétition, Protéine, Concentration

[Biotechnologie] chroomatographie d'affinité

1) soit avec une molécule qui a une plus grande affinité pour notre ligand greffé sur la matrice, cette molécule va donc rentrer en compétition avec la protéine à éluer et à forte concentration, notre protéine se détachera, pour ceci c'est ok.  [...] et comme les protéines sont retenue en fonction d'un caractère ionique défini, un simple ion prendra la place de ta protéine.  [...]

[Biochimie] Plusieurs questions sur les chromatographies échangeuses d'ions et d'affinité

**Quel est le rôle de l'excès de substrat(engendrer une compétition entre le substrat collé aux résines et celui ajouté,ce qui permettrait aux protéines de sortir de la colonne) et celui de l'augmentation de concentration de NaCl dans ce genre de chromatographie.  [...] Généralement elle contient un tampon (maintenir le pH constant à une valeur donnée), une concentration en sel (généralement supérieure à 50mM pour éviter les intéractions entre la phase stationnaire et les protéines). Ensuite ton tampon peut contenir d'autres molécules mais là ça dépend de ton protocole.  [...]

Réactifs de biomol

plus serieusement j'ai pas etudie la question, mais si mes souvenir sont bon augmenter la concentration en ion revient a augmenter la competition entre les charge pour la colonne.  [...] Pour etre claire si tu as une colonne d'annion qui capte les cations, si tu augmentes la concentration en cation dans ta colonne, ceux ci vont logiquement entrer en competition avec ta molecule cationnique.  [...]

Biochimie : précipitation protéines au sulfate d'ammonium, pourquoi NaOH pour réversibilité?

De ce que je comprends (même si ça a apparemment l'air plus complexe), NH4+ et SO4(2-), ioniques, vont entrer en compétition avec ma protéine pour l'eau, ma protéine déshydratée précipite donc. Mais alors pourquoi utiliser de la soude pour re-solubiliser.  [...] Hyp. 2. le pH très basique va permettre de déprotoniser les fonctions amines de ma protéines, qui sera donc chargée plus négativement et donc plus soluble dans l'eau.  [...]

[physiologie vegetale] Absorption de CO2 et les plantes

Plus la pression partielle en CO2 est faible, plus la fonction oxygénase, et donc la photorespiration, sera favorisée par rapport à la photosynthèse. Tu vas donc atteindre une concentration limite de CO2 à laquelle le bilan global du métabolisme de la plante sera nul.  [...] Pour l'O2 plus sa concentration diminue mieux ça sera pour la plante (moins de compétition CO2/O2 de la rubisco, donc carbone mieux fixé).  [...]

[Biotechnologie] Bloquer l'expression d'un gène chez la levure

Sinon y'a encore un truc qui me vient à l'esprit mais je ne suis pas certain que ce soit très rigoureux. tu n'inactive pas le gène endogène mais tu transfectes avec un plasmide surexprimant à fond le gène muté. La protéine mutée va rentrer en compétition avec la protéine sauvage et même si le gène sauvage est toujours actif tu va avoir de l'inhibition à cause de la grosse quantité de protéine mutée... Mais après ca dépend aussi du gène.  [...] Pour l'IPTG je ne suis pas certain qu'il fonctionne chez la levure... je rappelle a toute fin utile que c'est un promoteur bacterien. y'a peu de chance qu'il fonctionne dans la levure, surtout qu'il necessite la presence de la protéine LacI pour etre réprime.  [...]

immunofluorescence

la méthode de compétition. un anticorps (ou aussi un antigène) est coaté au fond du puit. mais tu rajoute ensuite 2 antigène dont un est marqué et de concentration connue et l'autre est celui recherché.  [...] En sandwich peut également être pour faire de l'immunolocation avec un anticorps fluorescent couplé a le GFP en N-terminal et DsRED en C-terminal par exemple... le tout pour étudier une protéine qui subit un clivage, exemple. la nucléoline... et ainsi suivre dans quel partie de la cellule elle est clivée (Noyau, nucleole, mitochondire ou autre.  [...]

[Biologie Moléculaire] ADN et stringence

s'appareillent, il faut donc une faible concentration de NaCl et 10% de formamide.  [...] Mais je ne comprend pas pourquoi ne pas augmenter la concentration d'NaCl pour que cela stabilise l'adn et pourquoi ne pas diminuer le pourcentage de formamide pour qu'il ne rentre pas en compétition avec les bases.  [...]

Question sur la dominance des allèles

ou alors les allèles vont être exprimés tous les deux, donnant les deux protéines (une codominance) mais chez l'individu de génotype 1//1 on verra la protéine 1 et donc le phénotype 1 tandis qu chez l'individu 1//2, le fait d'avoir la protéine 2 (en même temps que la protéine 1 ) va masquer le phénotype 1, par exemple si 1 est un pigment très clair alors que 2 est un pigment tres foncé,  [...] dans le cas de pathologie, il y a dominance si la simple présence de cette mauvaise protéine (allèle malade ) va être néfaste malgré la présence (en même temps) de la protéine native, alors que ce n'est pas le cas si la présence de la protéine native (allèle sain ) va entrer en compétition avec la protéine muté (allèle malade ) et dans ce cas la il y a codominance, voir recessivité de la maladie si la présence en petite quantité d el'allèle sain suffit a ce que ta cellule fonctionne correctement et dans ce cas il faut que les deux allèles soient mutés pour que ta cellule ne fonctionne plus correctement).  [...]

[Biochimie] Méthodes de purification du lysozyme

Les deux inconvénients majeurs sont que les conditions d'élution de ta protéines peuvent la dégrader, et surtout que ça coûte très cher comparé à la colonne échangeuse d'ions. Je n'ai malheureusement pas de chiffres à donner sur l'enrichissement et le rendement de ce genre de méthodes.  [...] Je précise juste que l'on a utilisé une méthode par compétition dans la colonne et non pas de variation de pH car le pHi du lysozyme est de 11.. Et si l'on met un pH plus élevé on aurait effectivement eu une dénaturation de la protéine.  [...]