• Forum - Compétition, Expression, Plasmide, Protéine, Inverse

[Biologie Moléculaire] Phosphorylation sur tyrosine => dégradation par protéasome???

Et est ce que ce n'est pas tout simplement un effet de compétition d'expression (ou de transfection) entre les deux plasmides Moi je commencerai par regarder ça avant de me lancer dans des explications physiologiques complexes.  [...] Alors en fait cette protéine est bien ubiquitinylé (.) par des complexes qui reconnaissent des sérines phosphorylées sur cette protéine. Pour ce qui est du MG-132 je n'ai pas encore fait le test. sinon pour ce qui est de la compétition d'expression j'ai fait un contrôle de transfection en cotransfectant le plasmide de la protéine X avec le vecteur d'expression vide de la protéine Y et de plus lorsque je cotransfecte le plasmide de ma prot X avec le plasmide de la kinase Y inactive j'ai l'effet inverse c'est à dire une accumulation d'X.  [...]

[Biotechnologie] Bloquer l'expression d'un gène chez la levure

Sinon y'a encore un truc qui me vient à l'esprit mais je ne suis pas certain que ce soit très rigoureux. tu n'inactive pas le gène endogène mais tu transfectes avec un plasmide surexprimant à fond le gène muté. La protéine mutée va rentrer en compétition avec la protéine sauvage et même si le gène sauvage est toujours actif tu va avoir de l'inhibition à cause de la grosse quantité de protéine mutée... Mais après ca dépend aussi du gène.  [...] j'ai pas une explication et meme pas une idée pour induire l'expression de ma proteine et la produie vers l'exterieu de la levure.  [...]

dimérisation des facteurs de transcription

Par exemple la protéine CREB (cAMP Response Element Binding), elle existe sous forme dimérique et monomérique. On va avoir une compétition entre les 2 car ces 2 facteurs se fixent sur la même séquence. Mais la forme monomère n'active pas la transcription et est plus affine pour la séquence à l'inverse de la forme dimérique qui elle va activer la transcription mais beaucoup moins affine pour la séquence.  [...] Autre exemple avec les récepteurs nucléaires qui sont dimérisés sous forme inactifs dans le cytoplasme. Dés qu'un ligand se fixe sur ces récepteurs ont a une oligomérisation permettant ainsi d'activer le facteur de transcription qui va rejoindre le noyau et aller se fixer sur son élément de réponse.  [...]

[Biochimie] Plusieurs questions sur les chromatographies échangeuses d'ions et d'affinité

En milieu aqueux (eau), les molécules de NaCl vont être dissociées et données des ions Na+ et Cl-. Donc dans le cas par exemple d'une chromatographie d'échange les ions Cl- vont rentrer en compétition avec la protéine chargée -.  [...] Donc en augmentant progressivement la force ionique (augmentation quantité d'ions Cl-. compétition pour la phase stationnaire chargée +), tu vas élué progressivement les protéines.  [...]

Biochimie : précipitation protéines au sulfate d'ammonium, pourquoi NaOH pour réversibilité?

De ce que je comprends (même si ça a apparemment l'air plus complexe), NH4+ et SO4(2-), ioniques, vont entrer en compétition avec ma protéine pour l'eau, ma protéine déshydratée précipite donc. Mais alors pourquoi utiliser de la soude pour re-solubiliser.  [...] Hyp. 2. le pH très basique va permettre de déprotoniser les fonctions amines de ma protéines, qui sera donc chargée plus négativement et donc plus soluble dans l'eau.  [...]

action antagoniste, théorie récepteur activé

On me demande dans un exercice quelle est l'action d'un antagoniste compétitif et un antagoniste inverse chez un patient malade (c'est-à-dire un patient exprimant une activité permanente du récepteur).  [...] Ben, si c'est un antagoniste compétitif, il entre aussi en compétition avec l'agoniste inverse... et à ce jeu, c'est celui qui a la plus forte affinité pour le récepteur qui gagne.  [...]

[Biotechnologie] chroomatographie d'affinité

1) soit avec une molécule qui a une plus grande affinité pour notre ligand greffé sur la matrice, cette molécule va donc rentrer en compétition avec la protéine à éluer et à forte concentration, notre protéine se détachera, pour ceci c'est ok.  [...] et comme les protéines sont retenue en fonction d'un caractère ionique défini, un simple ion prendra la place de ta protéine.  [...]

[Biotechnologie] Résultats d'un criblage biologique...

C'est peut être là le problème. Je ne pense pas qu'il soit si simple que cela en microscopie électronique de voir une interaction protéine-protéine. Peu de labo sont équipés de tels microscopes, alors que des lecteurs de plaques en fluorescence ou des detecteurs de radioactivité sont nettement plus fréquents, et moins chers.  [...] Pour revenir sur les methodes, c'est en général des tests de compétition. on fixe la protéine d'intéret sur une microplaque et on regarde la capacité des molécules à empêcher la liaison entre la proteine et un ligand de la proteine qui est marqué soit par un élément radioactif, soit avec une sonde fluorescente.  [...]

enzymes

Pour faire bref, je dirai que leur spécificité et leur affinité leur viennent par une pression de sélection, plus on a besoin d'améliorer l'activité de cette enzyme, plus elle risque d'être spécifique et rapide. Si elle rempli suffisamment sa fonction, sa spécificité a peu de changer de s'améliorer.   [...] Sans compétition, il y a peu de chance pour qu'elle évolue vers plus d'efficacité. A l'inverse, en cas de pression de sélection, elle risque d'améliorer ses propriétés de reconnaissance ou sa vitesse.  [...]

[Génétique] Les modification du génomes et du système immunitaire entraîner par le dopage

Par contre j'imagine que des produits stimulants sont susceptibles de modifier indirectement l'expression de certains gènes ( typiquement l'inhibition de la synthèse de certains neuromédiateurs suite à l'absorbtion récurrente de molécule qui rentrent en compétition avec ces derniers ).  [...] Mais à ma connaissance, ces modifications induites de l'expression des gènes sont enregistrées au niveau épigénétique.  [...]