• Forum - Comparaison, Séquences, ADN

[Génétique] Terme scientifique pour comparaison des séquences d'ADN

J'entends par là que l'alignement est un procédé qui permet la comparaison. Or je cherche le terme scientifique qu'on utilise pour parler de comparaison de séquences d'ADN.  [...] http.//bioweb.pasteur.fr/ qui montre qu'il n'y a pas de terme pour parler de comparaison de séquences d'ADN, on parle directement d'alignements.  [...]

[Biologie Moléculaire] Séquençage et métabarcoding

- Quels logiciels peuvent permettre à la fois le stockage des séquences ADN, la création de bases de données interne, la comparaison des séquences ADN avec des bases de données publiques, les alignements de séquences (à part Geneious).  [...] C'est aussi pour ca que je compare mes séquences avec des bases de données (pour les identifier) et que je souhaite avoir ma propre base de données. Quels logiciels peuvent permettre à la fois le stockage des séquences ADN, la création de bases de données interne, la comparaison des séquences ADN avec des bases de données publiques, les alignements de séquences (à part Geneious).  [...]

Allèle

Comparaison de séquences d'ADN du gène codant pour la PAH. (...) = séquence identique.  [...] Donc si tu regardes les séquences de ce gène chez les 4 individus (3 malades, 1 sain), combien de versions, d'exemplaires du gène vois tu.  [...]

Combien de possibilités d'ADN pour chaque individu?

Et pour jouer aux experts, sache que les séquences utilisées pour identifier les individus (dans les crimes sordides, ou les vols de scooter...) ne sont pas dans les gènes, mais en dehors. De mémoire (ça date de ma L1), on peut comparer les répétitions des mini-satellites de l'ADN.  [...] En fait, ces séquences sont justement en dehors des gènes pour ne pas compromettre les gens soumis à ce test. Un test ADN ne permet pas de savoir si la personne a un cancer, est myope, ou blond. Les tests ADN se basent donc sur la comparaison de séquences non codantes, mais ne permettent pas de retrouver un individu en partant de 0.  [...]

Comment etre biologiste en évolution ?

Si tu fais une session évolution et développement tu peux avoir des gens de la paléonto(ceux qui bossent dans le sous sol de la fac Gabriel.), de la botanique, de la zoologie, de la génétique du développement et des gens qui développent des algorythmes de comparaison de séquences d'ADN (donc très info/maths).  [...] C'est fini l'époque ou les sciences étaient cloisonnées, maintenant pour faire de la biologique tu dois avoir des connaissances aussi bien en chimie, physique, qu'en maths (surtout les stats en bio).   [...]

diagnostic prénatal technique

Mais effectivement si on cherche dans les séquences hautement conservée qui sont donc communes a tout les être humain oui la il y a possibilité de comparer, je n'y avais pas penser.  [...] Pour les maladies orphelines, la puce à ADN sera d'abord utilisé (beaucoup moins cher que le séquençage haut débit, plus rapide aussi, surtout en terme d'analyse). Comme comparaison, une puce à ADN permet en deux jours d'avoir le niveau d'expression de 30000 gènes.  [...]

[Génétique] Comparaison de séquences

J'ai un TP à faire en SVT à l'aide d'Anagène. Je dois faire des comparaisons de différentes séquences. Je dois révéler la notion de famille multigéniques.  [...] Pourquoi la comparaison des séquences de nucléotides d'espèces différentes est plus précise que la comparaison des séquences d'acides aminés.  [...]

[Biologie Moléculaire] question concernant la comparaison des ADN entre les organismes

lorsque l'on compare les ADN d'organismes apparentés comme l'homme et la souris, les séquences conservées correspondent aux exons et aux régions régulatrices fonctionnellement importantes, et les séquences non conservées correspondent génèralement à l'ADN non codant, est ce que c'est vrai ou non.  [...] Pour la simple et bonne raison que les séquences non codantes sont soumises a une sélection beaucoup moins forte que les séquence codantes.  [...]

Petites questions de biologie !

Mais une mutation dans un intron peut avoir des conséquences gravissimes si elle se produit au niveau des sites d'épissage dans les régions 5' et 3' de l'intron... et donc ne pas être silencieuse. Si les sites sont endomagés, il peut ne pas y avoir d'épissage et on peut éventuellement (c'est un exemple) incorporer un intron dans lequel se trouve un STOP.  [...] In silico. là c'est un peu différent. On l'utilise pour montrer qu'on se sert de l'outil informatique pour réaliser quelque chose ( in silico se rapportant au silicium des microprocesseurs des puces informatiques). Ainsi, on peut dire que l'on procède, in silico, à la comparaison d'une séquence d'ADN inconnu avec des milliers d'autre.  [...]

Pourquoi pas de matrice de substitution pour l’alignement (BLAST) des séquences nucléotidiques

La comparaison de séquences de protéines ou de nucléotides permet d'évaluer le degré de parenté entre ces séquences. C'est essentiellement ce que font les outils BLAST.  [...] Lorsqu'on réalise un BLAST de séquence protéique, ON dispose de différentes options de matrices de substitution (PAM, BLOSSUM …) pour calculer le score des alignements. Dans le cas des BLASTs de séquences nucléotidiques, ces matrices de substitution n'existent pas, On ne peut que donner des valeurs numériques aux matches, mismatches et gaps observés à la suite de l'alignement.  [...]