• Forum - Clonage, Sites, Restriction

[Biologie Moléculaire] Vecteurs de clonage

Ceux qui n'en ont pas sont à éliminer. Ensuite, il faudra que vous verifiez 1. qu'un des sites de restriction de la cassette de clonage peut être utilisé (le site de restriction ne se trouve pas dans votre séquence codante), et 2. que ce site permet un clonage en phase avec un éventuel start de transcription présent sur le vecteur (vérifier aussi si il y en a un ou pas d'ailleurs).  [...] Si les deux derniers points ne sont pas réunis, il vous faudra faire quelques adaptations durant votre clonage (créer un site de clonage, adapter des amorces PCR).  [...]

[Génétique] carte de restriction

j'ai un exercice dans lequel je dois faire la carte de restriction. or je n'arrive pas à comprendre comment faire car j'ai. région du promoteur du gène et la séquence du site de clonage multiple.  [...] Tu prends la séquence de clonage et tu cherches tous les sites dans ta séquence promoteur+ gene. Ensuite tu en déduis la taille de chaque fragment généré par restriction.  [...]

plasmide et BAMH1

je dispose d'un plasmide comportant une cassette de clonage avec les sites de restriction spécifiques à.  [...] Tu as un plasmide recombinant donc il possède le gène. Une fois qu'on l'a, on met l'enzyme Bam H I. Sur le plasmide recombinant il y a donc 3 sites de restriction Bam HI. celui du plasmide seul et les 2 du gène qui est dans le plasmide. Donc trois coupures.  [...]

[Biologie Moléculaire] Choisir le bon vecteur?

Ainsi tu te retrouves avec un ARNm possédant en 5' et en 3' des sites de restriction connus et différents, ce qui te permet de débuter ton clonage plus efficacement et de choisir un clonage orienté.  [...] Hormis certaines remarques faites ci haut,on doit prendre aussi en compte le fait que le clonage depend de l'objectif du travail.Si par exemple on veur cloner l'ORF tout entier,on fait le choix de 2 sites de restriction enzymes teste au prealable car les 2 sites,il ne faut pas que ils se retrouvent dans le gene,en plus pour l'orientation du gene et aussi en fonction de disponibilite des enzymes de restriction au laboratoire.  [...]

[Biologie Moléculaire] Clonage

L'objectif de ce clonage est de récupérer une partie d'un vecteur, pour se faire une amorce foward a été faite pour pouvoir intégrer un nouveau site de restriction, l'amorce reverse elle doit intégrer plusieurs sites, l'insert que l'on doit obtenir doit faire environ 1500-1600bp.  [...] Franchement si ça déconne arrêtez de perdre du temps et faites synthétiser la séquence. Pour 1500pb il y en a pour 500¬, c'est vraiment rien. Et en plus vous pourrez vous amuser à mettre sites de restrictions, mutations, etc, ou vous voulez et à votre convenance.  [...]

Comment orienter un fragment d'adn dans un vecteur

Imaginons que l'on amplifie un fragment d'adn génomique avec des primers savamment choisi encadrant un gène sans ses séquences régulatrices.   [...] L'utilisation de sites de restriction est le seul moyen pour faire cela. Une autre solution est de ne pas orienter le fragment, et une fois le clonage fait tester les plasmides pour trouver ceux qui auront un insert dans le bon sens. Apres tout tu as 50% de chance que ton insert soit dans la bonne orientation.  [...]

[Biologie Moléculaire] Beta galactosidase chez Saccharomyces cerevisiae

Autre question à l'épreuve des balles. t'es certain que ton gene beta gal est bien intégré et qu'il est en phase Pas une petite délétion due aux enzymes de restriction durant le clonage.  [...] Là même chose, j'ai réalisé ma construction de telle sorte à ce que mes fragments peptide promoteur, peptide signal et beta gal soient en phase, j'utilise pour celà des sites de restriction bien sûr, mais j'ai vérifier avant de faire mon clonage.  [...]

[Biologie Moléculaire] primer with (too!!!) long tail?

J'ajoute souvent des sites de restriction à mes produits de PCR pour faire du clonage dirigé, mais ça n'excéde jamais les 8pb de plus.  [...] Il faut encore que je valide par séquençage. Je dois avouer aussi que dans mon cas c'est assez simple vu que dans les 30nt que j'avais à insérer il y a un site de restriction, j'ai donc pu valider mes constructions en digérant par cette enzyme.  [...]

clonage/enzyme en dehors du site multiple de clonage

Bonjour à tous, je vous sollicite pour une petite question. Lors d'un TP, j'ai inséré un fragment d'ADN dans un plasmide et derrière, pour vérifier la ligation, j'ai digéré le plasmide avec les 2 enzymes de restriction utilisé à la base et après migration sur gel il se trouve que au lieu d'avoir 2 fragments attendus (un fragment correspondant à mon plasmide et un fragment correspondant à mon insert) je n'ai qu'une seule bande.  [...] Il se peut que ton MCS ait été enlevé au cours du clonage (c'est normalement peu probable si tu as bien designé ton clonage). Il se peut également que le plasmide de départ soit muté et ne possède pas certains sites de restriction (également assez peu probable).  [...]

[Biologie Moléculaire] Projet de clonage

dans le principe c'est bon, mais ensuite il faut que tu connaisses les cartes de restriction des vecteurs pour voir le sites disponibles et déterminer si tu peux faire un clonage orienté et cohésif de ton gene. Il faut aussi que tu sois plus précis, par exemple pour les bactéries, il faut que tu sois capable de déterminer si les bactéries ont intégré la construction, tu vois de quoi je parle.  [...] La stratégie globale est bonne mais comme on te l'a déjà dit plus haut, tu dois choisir des sites de restrictions compatibles pour que la ligation fonctionne.  [...]