• Forum - Charges, Groupe, Phosphate

ADN multianionique

Bonjour, dans mon cours de bio on a écrit que l'ADN est multi anionique. C'est à cause des charges négatives portées par le groupe phosphate.  [...]

[Biologie Cellulaire] Arn

Les nucleotides sont normalement chargés négativement à cause de la présence d'un groupement phosphate, si non, s'il étaient chargés positivement, leur déplacement se ferai vers le pôle négative.  [...] je ne veux pas dire de bêtise mais il me semble que l'anode attire les anions et qu'elle est donc chargé positivement. Et inversement pour la cathode. Les ARN chargés négativement (groupement phosphate) migrent donc tout naturellement vers l'anode.  [...]

débrifing sur l'ADN.

la molécule d'ADN est hydrophyle car elle possède des charge négatif, donc elle est charger négativement. c'est vrai ces charges la déstabilise un peu.les charges négatif sont du au groupement phosphate présent sur les nucléotide. (lorsqu'on dit groupement phosphate ce sont des groupement acide phosphatidique HPO4 (2-)).  [...] Le nucléosome est stable car il est constitué d'histones basiques dont la charge positive permet une interaction forte avec les groupement phosphates de l'ADN double brin, c'est cela J'avais lu quelque part que les liaisons hydrogènes intervenaient, est ce possible.  [...]

[Biologie Moléculaire] Différence d'action entre l'ADN-COT1 et l'ADN de sperme de saumon

Le sperme de saumon est utilisé pour saturer les sites libres de la membrane. plus précisément, les acides nucléiques intéragissent fortement entre eux via les bases complémentaires, mais peuvent aussi intéragir via des liaisons électrostatiques (dûe aux charges de la liaison phosphate, ou au cycle des bases) avec les groupements chargés des membranes.  [...] Merci pour cette réponse que j'avais lue sur le forum, mais qui ne m'éclaire par réellement sur l'utilisation que je fais du sperme de saumon. Je ne fais pas de western ou southern blot, je n'utilise donc pas de membrane. Les sondes que je fabrique sont utilisées pour faire de l'hybridation in situ sur des chromosomes en métaphase ou des noyaux en interphase.   [...]

[Biologie Moléculaire] Sperme de saumon

Pour les saumons, ne t'en fait pas pour leur reproduction, mais il me semble me souvenir que on utilise leur sperme car ce n'est pas cher et en très grande quantité.   [...] Effectivement le sperme de saumon est utilisé pour saturer les sites libres de la membrane. plus précisément, les acides nucléiques intéragissent fortement entre eux via les bases complémentaires, mais peuvent aussi intéragir via des liaisons électrostatiques (dûe aux charges de la liaison phosphate, ou au cycle des bases) avec les groupements chargés des membranes.  [...]

Probléme extraction ADN

Un petit truc que j'ai l'impression d'avoir oublié, le Mg2+ il stabilise la structure en double hélice en se liant aux oxygénes chargés négativement des groupements phosphate de l'ADN, c'est ça Mais en plus de ça il active les DNases aussi car souvent on met de l'EDTA pour capter ces ions afin de ne pas avoir perte de matos lorsqu'il ya lyse cellulaire, c'est ça.  [...] d'abord à partir de quoi extrais tu ton ADN Est ce que tu l'extrait du mmtype de cellule Sinon apres l'extraction et avant de faire la PCR il vau mieu verifier sur gel ou par spectrophotometrie la concentration et l'integrité de ton ADN. Sinon j'ai testé different protocle d'extraction et le rendemen est en générél kifkif.   [...]

[Biologie Moléculaire] Les ions bivalents

Les ions Mg++ ont plusieurs rôles. l'un étant de stabiliser les acides nucléiques qui sont très négatifs. En effet les nombreuses charges négatives (une par groupement phosphate il me semble) se repoussent et déstabilisent l'ADN et l'ARN. Du coup le Mg++ étant positif, il y a un effet compensatoire.  [...] lun des deux ions métalliques est en interaction avec l'oxygène du groupement oh 3 libre de la chaine du polynucléotide ce qui diminue laffinité de l'oxygène pr sn hydrogène cette interaction favorise l'attaque nucléophile du 3'o sur latome de phosphore de lalpha phosphate du nucléotide entrant le second ion métallique facilite le départ du produit de réaction le groupement phosphate du nucléotide entrant.  [...]

[Biochimie] [biochimie] ATP,ADP

Acid groups, such as the ones on a phosphate molecule, are most stable if the electrons in them can be spread around the molecule. This principle is called resonance stabilization, and you'll encounter it in organic chemistry. When two acids are bonded together, their electrons can't be shared as equally and the negative charges on them repel each other.  [...] Cette liaison est dite fortement energetique car les produits d'hydrolyse sont plus stables que les reactants. Les groupes acides (telles que ceux present sur le phosphate) sont plus stables si les electrons peuvent etre repartis autour de la molecule. Ce principe ets appele stabilisation par resonance, et vous le srencontrerez en chimie organique.  [...]

Glycolyse

Tu sais apparement le rôle que tient Mg2+ dans les réactions de la glycolyse. Dès qu'un groupement phosphate est ajouté ou enlevé à partir d'un ATP et qu'il y a nécessité de masquer des charges, un Mg2+ est nécessaire.  [...] D'après un schéma que j'ai sous les yeux la seule étape que je n'ai pas cité qui nécessite un Mg2+ est celle du passage du Glycéraldehyde-3-phosphate au 1,3-biphosphoglycérate via la glycéraldehyde phosphate dehydrogénase... Mais je n'ai pas trop d'info la dessus alors je laisse quelqu'un de plus spécialisé que moi s'avancer.  [...]

[Biologie Moléculaire] exonucléase

Une exonucléase 3' va-t-elle couper le nucléotide G avant ou après le phosphate Et quelles sont les charges qui apparaissent.  [...] Comment que ce soit, si ton G est en 3' et qu'il est le seul à ne pas être hybridé dans ta séquence de 4 bases, alors l'exonucléase 3'-. 5' ne coupera que le G et laissera un A-3'OH, donc l'exonucléase enlève le phosphate avec la guanosine, sinon on aurait un A-3'P.  [...]