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[Biochimie] Electrophorese bidimensionnelle: oublie d'equilibration

Est ce que c'est grave quand on oublie d'equilibrer les gels (strips). Les elements utilses pour faire le gradien de pH sont les immobulines.   [...] j'ai jamais utilisé la technique, mais d'après mes souvenirs de cours, l'équilibration sert notamment à donner une charge globale négative à toutes les protéines en incubant ton gel dans une solution contenant du SDS. Ca va permettre de séparer les protéines uniquement en fonction de leur taille.  [...]

[Biochimie] point isoelectrique et PKA

Le PI est une valeur globale (a l'échelle de la protéine par exemple) correspondant au pH de la solution dans laquelle la protéine à une charge globale nulle.  [...] merci d'avoir répondu. juste une dernière pr écision, on calcule le point isoélectrique d'une proteine grace aux PKA de ses acides aminés, c'est bien ça.  [...]

chromatographie échangeuse d'ions

les billes sont chargées donc la proteine s'accroche aux billes si elle meme est chargée. Donc a t on avis que se passe t il si la charge global de la proteine est nul (cad sans charge).  [...] le prtage selon la charge se fait en augmentant d'une façon graduelle le pH,et quand le pH de la solution d'elution est égale au pHi de la molécule alors la charge globale est neutre,donc la protéine se détache de la résine.  [...]

[Biochimie] point isoelectrique et pka

si pk acide est égal au phi de la protéine alors quelle est la charge de la protéine dans la solution.  [...] En tous cas, si la solution est au même pH que le pHi de la protéine, alors la protéine n'est pas chargée (le pHi ou pI d'une molécule est le pH pour lequel sa charge globale est nulle ou on peut dire électriquement neutre).  [...]

Interaction ADN-HISTONE

Un premier cours indique que les histones sont des protéines composées de 20% d'AA basiques (Arginine et Lysine notamment) et que ces protéines ont par conséquent, une charge globale positive. L'ADN comporte une charge globale négative. Par conséquent, les histones et l'ADN sont liés par des liaisons ioniques.  [...] Un second cours affirme le contraire. Il part du principe que l'extrémité N-term des histones est particulièrement riche en AA basiques et donc en AA positifs qui interagissent directement avec l'ADN (charge globale négative) par des liaisons ioniques.  [...]

protéine: hydrophile ou hydrophobe

La charge globale de la proteine depend de la somme des charges des differents AA. Si ta proteine est -1 a pH 7, cela signifira que la somme de ses charges est -1. Certaines proteines sont entierements hydrophyles et d'autre entierements hydrophobes. La majorité possedent des regions hydrophyles et/ou hydrophobes.  [...] La charge globale ne te renseigne que trés peu sur ca. Il n'y a d'ailleurs à ma connaissance aucun moyen si ce n'est l'experimentation pour savoir si telle ou telle ou proteine est hydrophobe, hydrophyle, etc.  [...]

[Identification] Electrophorese et isoelectrophorese

La migration se fait sur un gradient d'ampholines (molécules amphotères) qui créent un gradient de pH. Les protéines migrent jusqu'a rejoindre lur point isoélectrique ou pHi pour lequel leur charge globale nette est nulle.  [...] Donc si j'ai bien compris l'électrofocalisation, l'isoélectrofocalisation et l'isoélectrophorese sont des synonymes et c'est une électrophorese qui se fait dans un gradient de pH. Es ce exact.   [...]

[Biochimie] Différence entre Point isoéléctrique d'une protéine et son pka...

En cours nous avons dit que le point isoéléctrique d'une protéine correspondait au pH auquel cette protéine possédait autant de charge positive que négative et donc que sa charge globale était neutre.  [...] Mon soucis. quelle est la différence entre le pi et le pka sachant que le pka était la valeur du pH où la protéine possède autant de forme acide que de forme basique.  [...]

[Physiologie] Pourquoi plus de pompe Na+/K+ = potentiel membranaire nul ?

Mais je ne comprends pas ce 0mV. Si la pompe ne fonctionne pas on va gagner des charges + du sodium qui ne pourra plus sortir de la cellule par la pompe (donc dépolariser) mais aussi perdre des charges + du potassium qui ne pourra plus revenir dans la cellule (donc hyperpolariser), au final cela revient au même et on devrait rester à -60mV non.  [...] il faut aussi prendre en compte les anions qui rentrent en compte dans la charge globale de part et d'autre de la membrane, et les protéines chargées qui seraient a proximité de la membrane.  [...]

difference entre le ph optimum et le ph isoelectrique

En effet si vous diminuez le pH du milieu pour le faire descendre sous le pI (point isoélectrique) la charge globale de la protéine sera positive et si vous vous situez au dessus la charge globale sera négative.  [...] Notez bien que c'est la charge globale qui évolue, se placer sous le pI ne veut pas dire que la protéine est démunie de charge négatives.  [...]