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[Biochimie] le pH d'un peptide!!!

salut j'ai vraiment une question qui me fait tordre je veut savoire comment calculer le pH d'un peptide à partire des pKa de ces acides aminés s'ils vous plait aider moi.  [...] oui je cherche la charge mais j'ai besoin du pHi de peptide à partir de pKa de ces acides aminés je connais se dernier ph=pKa+Cbase/Cacide il ne m'aide pas.  [...]

Besoin d'un peu d'aide : enzymes et acides aminés

Bonjour, il suffit de connaitre la structure primaire de la protéine, seuls certains acides aminés sont susceptibles de modifier la charge de la protéine. Il suffit de regarder selon leur pI quelle charge ils auront au pH considéré. Si le pI est proche du pH, il convient souvent de calculer plus pr écisément la proportion d'acide aminés qui seront protonnés ou non à ce pH.  [...] Forcément si les charges des acides aminés sont impliquées dans la forme de la protéine, si on fait varier le pH, on fait également varier les charges des acides aminés et donc on peut modifier la forme de la protéine. Souvent dans le cas des enzymes, le repliement fait apparaitre une poche (appelé site actif ).  [...]

[Biologie Moléculaire] Qcm

Les 4 acides aminés présents dans un mélange (Gln, Arg, Gly, Asp) sont séparés par chromatographie échangeuse de cations. Pour cela, le mélange est déposé puis l'élution est réalisée. Quelles doivent être les conditions de chargement de la colonne pour garantir que les 4 acides aminés soient chargés (à l'étape du dépot).  [...] Par exemple, si on considere l'aspartate qui est un acide aminé acide, est ce que cela signifie qu'il sera souvent débarrassé de son proton sur la fonction carboxylique de son radical.  [...]

[Biochimie] Profil d'hydropathie

Bonjour. Je voudrais savoir comme on peut deduire, a partir d'une profil d'hydropathie, quels sont les acides amines basiques (chargé +) et acides (chargé -).  [...] Un profil d'hydropathie ne permet pas de savoir quel acide aminé (AA) est basique ou acide. Il est utilisé pour déterminer les régions hydrophobes (notamment celles qui peuvent être potentiellement transmembranaires) de ta protéine à partir de sa séquence en AA que tu connais.  [...]

[Biochimie] Protéine hydrophile ou hydrophobe ?

Je cherche à déterminer si ma protéine est hydrophile ou hydrophobe à partir de sa séquence en acides aminés et de sa charge globale.  [...] Les acides aminés polaires ou chargés vont donc être mis à l'extérieur de la protéine si les conditions aux pourtours de la protéine sont hydrophiles. Même constat pour les acides aminés hydrophobes (ex des protéines membranaires. les acides aminés hydrophobes encapsulent les polaires/chargés à l'intérieur de l'enzyme, car la membrane est ultra hydrophobe).  [...]

[Biologie Moléculaire] Page sds

Je profite de ce topic autour du page-sds pour vous demander un éclairage de ma lanterne s'il vous plaît. Nous avons évoqué cette technique de séparation des protéines selon leur masse dans le cadre de mon master 2, mais les protéines étant de composition en acides aminés différente, avec ce que ces derniers peuvent avoir de fonctions acides ou basiques différentes, je n'arrive pas à comprendre comme la charge globale d'une protéine dénaturée au page sds peut être la même entre deux protéines différentes.  [...] 4g de SDS pour 1g de protéine), la charge globale d'une protéine dépends alors uniquement de sa longueur en acides aminés, et du coups, de son poids moléculaire.  [...]

protéine: hydrophile ou hydrophobe

Quelque trucs pour t'aider. Tu regardes l'ionisation en fonction de ta solution ( tiens compte du potentiel hydrogène de ta solution ) des atomes qui constituent les acides aminés de ta protéine.  [...] -. a pH neutre, les acides aminés verront leurs groupements amines chargés positivement ( NH3+ car ils ont capté un H+ ) ET leurs groupements carboxylique chargés négativement ( COO- car perte d'un H+ ) Ainsi la charge moins + la charge plus fait bien 0 et ta protéine est neutre tout comme la solution.  [...]

[Biologie Moléculaire] Charge des acides aminés

Bonjour, je suis en Paces et en biochimie on nous apprend que les acides aminés basiques sont chargé + et les acides aminés acides sont chargés - et j'aimerais comprendre pourquoi, pour moi c'est l'inverses les acides étant capables de céder un ou plusieurs proton H+ Ils devraient être chargés positivement. Merci beaucoup.  [...] Les acides aminés chargés + ont pour la plupart un groupe aminé -NH2 supplémentaire. Cette fonction est basique et capte les protons sous forme NH3+.  [...]

[Biochimie] Acides aminés au site catalytique d'un enzyme

J'aurais une petite question concernant les enzymes se retrouvant au site catalytique d'une enzyme qui est spécifique aux substrats basiques.   [...] Les acides aminés se retrouvant au site catalytique de l'enzyme seraient donc, de façon théorique, des acides aminés acides, qui portent une charge négative à pH 7, par exemple l'aspartate.  [...]

[Biochimie] Différence entre Point isoéléctrique d'une protéine et son pka...

Par exemple sur un acide aminé il y a une fonction acide COOH dont le pk sera environ de 2 et une fonction amine dont le pK sera d'environ 10. Comme l'acide aminé possède au moins 2 fonctions, acide et basique, tu as 2 Pk alors que le pi de l'AA sera de 6 environ pour la glycine.  [...] c a dire le nombre de molécules chargé positivement est égale au nombre de molécules qui ont une charge négativement on parle de zwitterion mai lion chargé a la fois positivement et négativement n'existe pas ds le cas des acides aminés.  [...]