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[Biochimie] Enzyme

b. Daniel Koshland (1958) a proposé le modèle de l'ajustement induit. le substrat induit un changement conformationnel du site actif de l'enzyme. Les orbitales des groupements catalytiques et du groupement réactionnel du substrat sont alignées de manière optimale pour l'acte catalytique.  [...] Pour un mécanisme ordonné à deux substrats, la fixation du premier est supposée induire un changement de conformation qui révèle le site de fixation du second substrat.  [...]

[Biochimie] enzymologie

Ceux-ci agissent bien sur le Km, mais en baissant le Km ils augmentent l'affinité de l'enzyme pour le substrat et donc augmente Vi (comme tu l'as dis) donc pour moi il n'y a rien d'incohérent.  [...] La fixation de l'inhibiteur provoque un changement de conformation de l'enzyme et la rend inactive ou modifie le site de fixation du substrat ce qui empêche la réaction.  [...]

[Biochimie] Regulation de la glycolyse

on parle de Km élevé = petite affinite de l'enzyme pour le substrat mais bon concretement je comprends pas du tout cette regulation.  [...] Les inhibiteurs allostériques se fixent sur des sites dits allostériques, indépendants du site actif. Leur fixation entraîne un changement de conformation de l'enzyme qui de fait modifie son affinité vis-à-vis du substrat.  [...]

[Biochimie] La nature chimique d'une enzyme ?

Oui et non. Dans le sens où, oui, il y aura des changements dus au fait que le site actif de l'enzyme sera impliqué dans la réaction et il y a des interactions chimiques et non parce que l'enzyme ne subit pas de transformation proprement dite (= celle que subit le substrat pour devenir produit = changement de la nature et propriétés radical).  [...] Le doute peut venir justement du mot transformée. Le truc est qu'il vaut mieux dire que l'espèce qui catalyse est régénérée ce qui implique des changements réversibles. Dans ce sens, les enzymes se modifient transitoirement au cours de la réaction.  [...]

[Biochimie] Inhibiteur allostérique

Plutôt que de se lier sur le site actif de l'enzyme où se déroule la réaction, comme c'est le cas d'un inhibiteur compétitif, l'inhibiteur allostérique se lie sur un autre site de l'enzyme (dite alors enzyme allostérique) et changer sa configuration / conformation, de façon telle qu'elle ne possède plus la même affinité pour son substrat.  [...] Oui c'est bien ça, c'est un inhibiteur non compétitif justement car il ne se lie pas sur le site actif de l'enzyme (le site actif = le site sur lequel se fixe le substrat).  [...]

[Biochimie] Une mutation ponctuelle peut elle modifier la fonction d un polypeptide?

Dans d'autres cas, si la mutation est localisée hors d'un site critique, ou bien si la substitution n'induit pas un changement radical de sa structure, la protéine peut très bien être tout à fait fonctionnelle.  [...] Ca impliquerait, soit que ton acide aminé soit au centre de tes deux sites enymatiques, et que ce simple changement d'un aa puisse modifier son substrat / sa fonction.  [...]

Kinase et Glycine lid

3ème question. la je comprends pas bien ce que c'est que ces substrats cibles... ils se fixent ailleurs que sur le site catalytique la kinase aurait une fonction différente de celle d'ajouter des groupes phosphate et l'ATP.  [...] Oui le substrat se fixe toujours au site catalytique. L'ATP est un cosubstrat. Le substrat et l'ATP interagissent au niveau du site catalytique. Par un rapprochement stérique, stabilisation du complexe ES, et mécanisme catalytique, le substrat est alors phosphorylé.  [...]

[Biochimie] Réaction enzymatique

bonjour, eske kelkun pourais me donner la définition d'un reaction enzymatique, je ne suis pas sur de la mienne. Merci.   [...] la réaction durant laquelle l'enzyme transforme le substrat en produit grâce à l'action du site de reconnaissance et le site catalytique. La vitesse se mesure en nombre de molécules de substrat transformées par molécule d'enzyme et par unité de temps.  [...]

plusieurs questions avant mon DS

L'enzyme possède cette double spécificité car elle possède un repliement dans l'espace en 3D particulier, et notamment au niveau du site qui va lier le substrat qu'on nomme le site actif.  [...] 5/ Le site actif va reconnaitre de facon physique le substrat en agissant sur lui. Tu comprends donc facilement que ce site actif va a la fois determiner quel substrat peut etre reconnu et par la meme quelle reaction sera declenchée. Donc specificite de substrat et d'action.  [...]

[Biochimie] enzymologie

je pense que cela doit etre possible, mais je n'ai pas d'exemple précis en tête... je serais tenté de dire que le deuxieme substrat serait un cofacteur, qui servirait en particulier à l'échange d'une entité chimique (atp= un groupement phosphate, nadh+, nad+, etc...).  [...] Ca je sais bien, mais les cofacteurs peuvent se lier sur un site tellement proche qu'un échange est possible avec le substrat. Après je ne saispas pour la question que tu as posé... mais le cofacteur peut ne pas se retrouver dans son état initial. Il se retrouvera dans son état initial par la suite.  [...]