• Forum - Chaleur, Protéine, Structure

[Biochimie] DTT et WesternBlot

Par exemple, la chaleur seule en présence de SDS induit une perte de la conformation 3D de la protéine sauf aux endroits où on a des ponts disulfures qui eux maintiennent la structure 3D par liaison covalente, impossible à rompre avec chaleur + SDS. Si on a des ponts disulfures au niveau de l'interface de trimérisation, il est probable que chaleur + SDS ne suffise pas à dissocier le trimère.  [...] Le résultat peut être le maintien de la présence de la bande à 300 kDa ou pas. Si elle est toujours présente, cela veut dire soit que la formation de son trimère n'est pas dépendante d'un maintien de la structure 3D de l'interface de trimérisation par des ponts disulfures, soit que la bande à 300 kDa est une protéine ou un complexe qui n'a rien à voir avec sa protéine d'intérêt (bande non spécifique).  [...]

Comment les protéases ne se détruisent pas...

C'est pour cela qu'en labo, si on veut inactiver des protéines/enzyme... on va les chauffer, afin qu'elles changent de structure, ce changement de structure entraine la perte de fonction, mais aussi change le site présent sur la surface externe (et ce qu'on fait en apportant de l'énergie sous forme de chaleur, dans le corps il y a des enzyme qui vont catalyser ce genre de réaction sans avoir a monter a 100°).  [...] Mais je pense que ecolami ne parlait pas spécifiquement de la digestion qui est un cas particulier en soi, mais de l'action des protéases dans nos cellules et que donc si on a une protéase active dans nos cellule (selon lui) rien ne la retient de dégrader toutes les protéines de la cellule (sans meme parler de destruction de tissu ou digestion globale, mais sur le fonctionnement cellulaire).  [...]

[Biochimie] Fromage fondu

Les fromages sont formés par la juxtaposition de granules de caillé composé essentiellement de protéines et de matière grasse sous forme de globules lipidiques. Sous l'action de la chaleur (température supérieure à 60°C) et du broyage le fromage perd sa structure.  [...] Lorsque les différentes réactions sont à l'équilibre l'ensemble est soumis à un refroidissement qui a pour but de figer les structures. Il y a fabrication d'un réseau tridimensionnel retenant l'eau et la matière grasse émulsifiée. Le réseau est renforcé par des interactions intermoléculaires (ionique, pont hydrogène, force de Van der Waals), par des ponts polyphosphates et aussi par le fait que des ponts calcium pourront se recréer avec la protéine déplissée.  [...]

[Biologie Moléculaire] Isochores G, isochores R

En interphase, l'organisation du génome est relié à la structure des chromosomes dont les différentes régions organisées en bandes peuvent être visualisées au microscope après coloration par le colorant de Giemsa précédée d'une dénaturation de la préparation chromosomique par la chaleur en tampon salin (bandes R et T), ou une enzyme protéolytique comme la trypsine (bandes G et C).  [...] Ces propriétés dont les mécanismes moléculaires sont encore discutés traduisent une organisation fondamentale du génome en deux compartiment majeurs appelés isochores, apparue au cours de l'évolution chez les vertébrés à sang chaud. Le génome est donc organisé en une mosaïque de segments homogène de plusieurs centaines de milliers de nucléotides.   [...]

petite question sur la dénaturation d'une protéine

La dénaturation est liée à la structure de la protéine, à la présence de fonctions ionisables ou non. A mon avis si on retire l'agent cahotropique et qu'il n'a pas modifié ces liaisons, certaines pourront reprendre leur état fonctionnel. En plus, est ce qu'il n'existe pas des protéines chaperonnes, pas systématiquement mais qui aident au bon repliement de la protéine Si quelqu'un à des infos, ça m'interrese aussi.  [...] Tout dépend de la protéine, si on parle structure tertiaire ou quaternaire et si des protéines chaperons sont obligatoires ou non pour le repliement.  [...]

[Biochimie] séparation de protéines

alors voilà mon problème. nous avons un mélange de protéine (on sait pas trop leurs poids) que nous voulons séparer et caractériser par la suite. Actuellement je fais des SDS-PAGE (15%), mes échantillons sont des fraction issus d'une chromato échangeuse d'ion.  [...] quel agent utiliser (autre que le béta-mercapto) pour être sur d'avoir une structure linéaire et qu'il n'y est aucun problème polymérisation des protéine lors de la migration.  [...]

[Biochimie] ENZYMES question

La régénération protéique est donc plutôt marginale. D'autre part, en excluant la dégradation par les protéases, la renaturation spontanée d'une protéine n'est pas triviale. De nombreuses protéines nécessitent un repliement assisté par des chaperones qui conditionnent une conformation particulière en consommant de l'énergie, pour que la protéine soit fonctionnelle.  [...] Pour la plupart des gènes exprimés, on assiste à une synthèse permanente d'ARNm suivie de la synthèse de la protéine, puis de sa dégradation plus ou moins rapide selon sa demi-vie. Ainsi il y a un remplacement permanent d'une protéine. Donc je dirais que lorsqu'une protéine est dégradée accidentellement (par la chaleur puisque tu y tiens beaucoup ), il faut attendre le temps que l'ARNm (s'il a tenu le choc) soit traduit en cette protéine, ce qui peut être très variable suivant les protéines considérées.  [...]

[Biochimie] La pression

Qui plus est, il faudra ajouter une structure de régulation de la chaleur interne en circuit indépendant, en plus d'une structure suffisamment isolante car dans un milieu comme l'atmosphère omniprésente de Vénus, il n'y aura aucun moyen d'évacuer la chaleur accumulée (au revoir la clim...).  [...] Petit rappel. pour faire du froid, votre cher frigo fonctionne exactement à l'inverse d'une pompe à chaleur (pour les adeptes des éco-technologies). on pompe les rayonnement de chaleur à l'intérieur du frigo grâce à un liquide caloporteur (azote, fréon.  [...]

Dénaturation de prions

Donc on a vu que l'anomalie d'un prions entrainer un changement conformationelle de la protéine normale. Mais nous avons aussi vu que des facteur tel que la chaleur ou d'autres facteurs pouvaient dénaturer la protéine. Un exemple de prion qui est dangereux pour la santé c'est celui de crotzfeld-jacob (désolé, je ne connais pas le nom du prion ).  [...] Sinon pour les prions PrpSc, il me semble que la structure en feuillet beta de la protéine est beaucoup plus stable thermiquement, et que donc pour cette raison il faut des temperatures beaucoup plus fortes pour la dénaturer.  [...]

Difference entre cuisson direct et indirect!!!

Théoriquement non. La chaleur peut dénaturer ta protéine, voire peut-être même la détruire de manière irréversible mais il ne peut pas s'agir de délétions ponctuelles d'acides aminés, par exemple.  [...] Tu vas tout simplement réaliser la combustion de ta protéine. Tu perdras toute la structure et tes carbones formeront des oxydes de carbone (CO,CO2).  [...]