• Forum - Cassures, Fragments, Réplication

[Biologie Moléculaire] ligase

Demande-toi qui catalyse la ressoudation des cassures simples brins entre les fragments d'Okazaki adjacents lors de la réplication Une ligase. Ca devrait répondre à ta question.  [...] Oui bien sur que la ligase relie des morceaux simple brin et c'est le cas des fragments d'Okazaki par formation de liaisons phosphodiester covalentes puis ligature ou connecte des brins d'ADN, et cela sans s'aider du brin parental.  [...]

[Biochimie] séquençage d'une proteine

Lors de la deuxième étape, un nouvel échantillons de peptides rentre dans le mass spectrometer et reste piégé dans le linear trap. Cette fois, ils sont fragmentés ( comme avant), mais les fragments ne sont pas analysés par le linear trap, au lieu de cela, certains sont sélectionnés (les plus fréquents - ou les plus grands pics ), tous les autres sont jettés.  [...] Les peptides finissent par se fragmenter en petits fragments. Les liaisons qui cassent sont typiquement des liaisons entre les acides aminés. Tu peux voir un schéma qui t'explique où surviennent ces cassures. Ensuite, tous les fragments générés à partir d'un peptide sont analysés (leur masse est mesurée).  [...]

[Biologie Moléculaire] Réparation du DNA; système NHEJ

En fait est ce que la cassure DSB, c'est comme un coup de ciseau sur l'adn, qui crée donc 2 fragments, ou 2 cassures SSB qui peuvent être a des endroits éloignés, mais généré 2 fragments quand même (DSB), car sinon je ne comprend pas la perte de séquence possible en raboutant les 2 bouts.  [...] Si c'est cela, quel est le mécanisme à l'origine de DSB, et qui explique le fait que la cassure double brin entraine une cassure nette, ou des fragments chevauchants.  [...]

Adn bactérienne et mutation

Non je comprends le fait que les procaryotes tout comme les eucaryotes subissent des mutations. Mais ce que je ne comprend pas c'est comment ces mutations intervient lors de la réparation de l'adn. (Lors de la réplication j'ai compris qu'il y a la méiose et le crossing-over) mais lors de la réparation je ne comprend pas pourquoi des mutations surviennent.  [...] Mais tu peux aussi avoir des cross-link et des cassures double et simple brin hors réplication (à cause d'UV ou autres radiations, ou à cause d'agents chimiques).  [...]

[Biologie Moléculaire] Réplication de l'ADN chez les eucaryotes SOS

dans mon cours il est écrit. une fois la réplication terminée sur de longs segments, une enzyme permet de remplacer les amorces ou de réparer les cassures. Cette enzyme fait partie de l'ADN polymérase I. Elle possède une activité exonucléase dans le sens 5'3'.  [...] en gros les 2 réplications eucaryote et procaryote sont très similaires que dans leurs grands principes (bidirectionnelle, antiparallèle, sens 5'3', complémentaire, nécessite des amorces) mais pas dans les détails (enzymes pas meme fonction c'est le cas pour ce que j'ai dit précedemment ou encore inexistence des fragments de Kleenow chez les procaryotes. (n'est-ce pas)).  [...]

au secours ... cycline, Rb et e2F cycle cellulaire...

Ok, alors...Le complexe cdK2/Cycline E est impliqué dans la transition G1/S et a pour cible la protéine Rb. Rb est effectivement un piegeur de E2F. si Rb est phosphorillé par cdK2/Cycline E, alors il y a relarguage de E2F qui va, comme tu l'as dit, active la réplication de l'ADN (car E2F va activer l'expression d'une polymérase).  [...] Pour la surveillance du cycle, quand il y a une erreur, il y a activation de ATR ou ATM, ceci dépend du dégâts. Par exemple, ATR réagit quand il y a des erreurs de réplication ou cassure de l'ADN à cause des UV. ATM lui réagit quand il y a des cassures de l'ADN double brin ou à causes de radiations ionisantes.  [...]

[Biologie Moléculaire] cassure double brin

La cassure du double-brin de l'ADN peut également être de cause biologique, et est même souvent nécessaire. Les topoisomérases de classes I et II peuvent scinder l'ADN sur un brin, ou sur les deux, respectivement.  [...] Et c'est justement quand la topoisomérase II est inhibée à un moment où les 2 brins sont cassés que les cassures db stables se produisent. Plus généralement elle apparaissent quand la réplication est inhibée.  [...]

Mélanomes

Les UV cassent la molecule d'ADN, en fait leur principale action est surtout de creer ce que l'on appelle des dimeres de thymines (2 thymidines sont liees covallamments), ce qui bloque la replication de l'adn. celui-ci va etre repare, mais si les erreurs ou les cassures sont trop nombreuses, alors la cellule va tenter le tout pour le tout en reparant un peu n'importe comment (c'est tres imagé evidemment).  [...] sinon kinette.. tu as oublie le dossier le plus interessant, pas directement sur le sujet, mais concernant les reparations de l'ADN et surtout les cassures double brin.  [...]

[Génétique] Réarrangements chromosomiques.

Je découvre qu'il existe des cassures doubles brins capables d'être réparées, comme les substitutions de bases connues depuis fort longtemps, engendrée par les rayonnements agressifs ou quelques substances mutagènes, genre benzopyrène et d'ailleurs, ces phnénomènes sont à la base du test de Ames.  [...] Enfin lors de la replication de la molecule, l'ouverture de la double helice provoque l'apparition de tensions dans la molecule. Ces tensions sont resolus par des ADN helicases, ainsi que par les Topoisomerase qui sont chargees de maintenir un certains degre de superenroulement de la molecule.  [...]

[Génétique] Creation de cassures double-brin durant le cycle cellulaire

Donc, toujours a la recherche d'une proteine qui provoque les DSB lors de la replication... Liee ou non a des sequences particulieres.  [...] Sinon, il y a des modifications de la chromatine qui entrainent la formation de DSB. Par exemple, l'incorporation du variant d'histone H2AX puis sa phosphorylation entraine l'apparition de cassures à ce niveau. L'initiation de cassures n'est pas nécessairement liée à une mauvaise expression des topoI ou II mais parfois à un mauvais recrutement.  [...]