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carte de plasmide

connaitriez vous des sites qui permettent d'avoir les cartes de plasmide, afin de connaitre les enzymes de restriction ainsi que la taille des plasmides...pour ceux qui n'ont pas DNA strider.  [...] Je l'utilise depuis plusieurs années, et il est vraiment facile de prise en main (comme d'autres choses). Bref, on peut designer des plasmides, faire des cartes de restriction avec une enzyme ou un lot d'enzymes, définition d'amorces PCR, etc.  [...]

Carte de restriction

je voudrais avoir une aide sur l'établissement des cartes de restriction quand il y a 3 enzymes de restriction(HindII, KpnI, NdeI)et 3 doubles digestions.  [...] Donc en fait, ce que j'ai fais j'ai mis le fragment de 1304 à gauche et je me suis intéresse au denier couple de digestion, là où il y a le plus de fragment. On voit que 5172 et 1304 ne sont pas digéré mais que 4032 et 3944 et 2587 le sont. Donc ca revient a mettre les fragment de cette manière 1304-1283-2749-1195-5172.   [...]

[Biochimie] Preparation et analyse de plasmides

* Les enzymes que tu cites, HindIII et EcoRI, sont appelées enzymes de restriction. Elles vont reconnaître des endroits particuliers au sein de l'ADN. des sites de restriction (des séquences palindromes, il y a une discussion dessus, si je ne m'abuse, donc regarde ).  [...] est ce que les enzymes de restriction vont decouper les plasmides de HRPN, PGAG, etc... de la meme facon Mais je ne pense pas en fait avec ce que vous m'avez expliqué avant, ca depend de la carte de restriction.Elles sont trouvables sur internet ces fameuses cartes Il parait qu'on connait parfaitement E.coli aujourd'hui.  [...]

[Biologie Moléculaire] Réparation mutation, structure Holliday

La cartographie à l'aide d'enzymes de restriction est basée sur des sites de restriction sans variation, tandis que la cartographie à l'aide des RFLP est basée sur la variation des sites de restriction entre des chromosomes homologues.  [...] La plupart des cartes de restrictions sont de petite taille (haute résolution), même si l'on peut construire des cartes de grande taille à l'aide d'enzymes de restriction dont les sites de coupure sont rares.  [...]

[Biologie Moléculaire] Projet de clonage

pour commencer tu dois digérer ton vecteur pCDNA et le gene GFP avec une ou deux enzymes de restrictions identiques pour que les extrêmités soient cohésives. Tu connais les cartes de resctriction de tes vecteurs.  [...] - Enfin on te demande de vérifier ta construction PCDNA3-GFP une fois que tu l'auras obtenue, c'est-à-dire que tu dois trouver une ou plusieurs enzymes de restriction qui te donneront un résultat différent en fonction de si tu as ton insert ou non. Par ex le choix d'une enzyme pour laquelle tu as 1 site dans ton vecteur PCDNA et un site supplémentaire dans ton insert est idéal car tu auras 1 bande = ton vecteur linéarisé si ton vecteur ne contient pas l'insert, et 2 bandes avec des poids moléculaires bien précis si tu as bien ton insert.  [...]

Carte de restriction d'un plasmide

Des digestions avec une ou 2 enzymes sont réalisées, les produits de la digestion sont soumis à une électrophorèse. On dtermine pour chaque puits le nombre et la taille des fragments de restriction par comparaison avec la migration de fragments d'ADN de taille connue. Les résultats sont dans le tableau suivant.  [...] Bonjour à tous j'ai également un problème au sujet d'un exercice sur les cartes de restriction j'ai mis le fichier en question, il s'agit de la fin de l'exercice 1 de ce TD ou il faut donner la carte de restriction du plasmide pk rec.  [...]

[Biologie Moléculaire] Carte de restriction

On a digéré un phage lambda avec différentes enzymes de restriction, on a fait une électrophorèse.  [...] Si vous voulez vous y retrouver faites une représentation distance de migration = f(log PM). Vous aurez alors une droite et vous pourrez trouver la taille de vos fragments beaucoup plus facilement.   [...]

microbiologie - CARTE DE RESTRICTION

digestion de restriction. certaines protéines sont capables de couper l'ADN à des endroits bien précis (par exemple. gaa. ttc). Ce sont les enzymes de restriction. Dès que l'enzyme trouve son site, elle coupe l'ADN comme tu couperais un bout de ficelle avec un ciseau.  [...] Une carte de restriction c'est une séquence où tu peux visualiser tout les sites de coupures des enzymes de restriction. Ça peut être une carte d'un plasmide où d'un génome. C'est utile pour savoir la taille de tes fragments obtenue après digestion avec une enzyme de restriction spécifique.  [...]

[Génétique] Principe de la technique RFLP

Bon tout d'abord un fragment de restriction est un morceau de DNA qui a été coupé par un enzyme de restriction (enzyme coupant le DNA).  [...] Si une mutation intervient à cet endroit précis de reconnaissance de l'enzyme (par exemple un GTTC au lieu de GATC), il n'y aura plus de coupure, le gène B par exemple ne donnera que 4 fragment dont un sera beaucoup plus long. C'est ce qu'on appelle un RFLP ( restriction fragment lenght polymorphisme ou en français polymorphisme de longueur des fragments de restriction).  [...]

Comment calculer la taille des fragments sur une carte de restriction?

Si c'est le cas je vais faire un autre exo mais dans le sens inverse c'est a dire faire la carte de restriction a partir du profil de restriction et je le mettrai dans mon autre post merci beaucoup.  [...] Avant de faire la carte de restriction avec de nouvelles valeurs je voudrais d'abord utiliser ce que je viens d'obtenir pour refaire la carte de restriction mais je ne comprend pas comment on peut faire. J'essaye sur brouillon mais ça m'a l'air hyper compliqué.  [...]