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[Biochimie] Structure des protéines : diffraction aux RX et carte de densité électronique

J'ai un question à poser dns le domaine de l'étude de la structure des protéines. j'ai moyennement saisi le principe de la cristallographie suivie de la diffraction aux Rayons X de cristaux de protéines. À l'issu de cette dernière technique, on est censé obtenir une carte de densité électronique ou l'on peut voir plusieurs tâches obtenus grâce aux RX diffractés.  [...] On obtient d'abord des clichés de diffraction pour différentes orientations du cristal dans le faisceau de rayons X. On mesure l'intensité des tâches de diffractions pour chaque image et on les combinent. Puis, à partir des intensités mesurées et des phases (expérimentales ou issues d'un modèle moléculaire proche) on peut calculer la carte 3D de densité électronique par une transformée de Fourier inverse.  [...]

[Biochimie] Phasage

Tout d'abord, commençons par le début. Une onde électromagnétique à trois caractéristiques. longueur d'onde, amplitude et phase ( décalage entre des ondes).   [...] De la on peut calculer les phases théoriques et les combinées aux amplitudes expérimentales pour calculer une carte de densité électroniques.  [...]

[Biochimie] Diffraction rayons X/ carte de densité (petite question)

[Biochimie] Diffraction rayons X/ carte de densité (petite question).  [...] Pourtant j'ai l'impression que 2A est la résolution moyenne qu'on a pr les cartes de densité. 1,2 A est quand même meilleure.  [...]

[Biologie Cellulaire] La cellule mystère.... - Page 7

Je pense comme toi, car ça ressemble fort à une crypte de Lieberkhum, caractéristique de l'intestin grêle des mammifères (les cellules de Panteh se situant à la base de la crypte, au milieu des cellules souches, et se repèrent facilement grâce à la sécrétion importante de protéines lysosomiales...).   [...] Pour répondre à piwi on peu identifier l'élément postsynaptique grâce à la densité électronique au niveau de la membrane, qui est une zone très foncée.  [...]

Principe cristallographie et diffraction rayon X ; méthode d'étude des protéines

Obtient on la position des atomes et leur nuage électronique comment interpréter la figure de diffraction sur la plaque photographique.  [...] Sous rayons X tu obtiens un spectre de diffraction qui par traitement mathématique permet de remonter à la densité électronique et donc à la structure tridimentionnelle de la protéine.  [...]

[Biologie Moléculaire] La molécule mystère - Page 34

Une de mes particularités et que j'ai été découverte par hasard par cristallographie aux rayons X (.). Ma séquence a été essentiellement déduite de ma densité électronique, fait probablement unique. Autre particularité non moins surprenante, ma séquence est absente des banques de données du génôme humain (.).  [...] Parce qu'il n'y a pas de relation linéaire entre la quantité de mRNA et la quantité de protéine exprimée. C'est pour çà que les RT-PCR ne valent pas grand chose lorsque l'on veut vérifier le niveau d'expression d'une protéine. La réponse donnée par les RT-PCR est qualitative (oui/non) pas quantitative.   [...]

[Biochimie] densité du rouge soudan

Est-ce que vous devez obligatoirement trouver la densité exacte du rouge soudan ou avez-vous le choix dans une expérience quelconque montrant qu'il n'y a pas de différence de densité entre l'huile et le rouge soudan.  [...] Certes mais mon calcul permet d'obtenir la valeur d'une densité telle qu'elle est exprimé habituellement c'est à dire en comparaison de la densité de l'eau qui est arbitrairement de 1. Pour ce calcul, les dimensions sont très importantes puisque diviser des grammes par des litres ne donnera pas la bonne valeur.  [...]

[Biologie Cellulaire] Duplication / transcription

Lors de la transcritption, l'enzyme qui se fixe sur l'ADN est L'ARNpolymérase (Elle crée de L'ARN à partir d'ADN). Cette enzyme peut-être présente n'importe quand dans la cellule.   [...] Et les arnr sont perpétuellement synthétisés dans cette partie du noyau. Sa forte opacité aux électrons en ME est expliquée par la présence d'hétérochromatine mais également la forte densité en ARN.  [...]

Lithiase : non concordance entre composition et densité UH

La mesure de la densité d'un calcul de petite taille est très difficile, et souvent, on déborde un peu sur les tissus environnants lorsque l'on place le ROI (Region of Interest) dans lequel sera calculé la densité.  [...] Ainsi, si on déborde un peu en plaçant un ROI sur, d'une part, un calcul d'oxalate, et d'autre part, la graisse environnante, cette dernière ayant une densité négative, on diminue de manière erronée la densité moyenne.  [...]

[Microbiologie] Biofermenteur

On a fait une expérience qui consiste à mettre une solution de levures avec des nutriments(sucre) dans un bioréacteur puis on a commencé l'agitation et dans un certain temps soit 10 minutes après le début d'expérience on a prélevé un échantillon du milieu puis on l'a dilué au 1/50 pour lire la densité spectroscopique à 600nm.  [...] Le CO 2 s'échappe en grande partie du fermenteur sous forme gazeuse. Et je ne vois pas pourquoi une baisse de densité ferait baisser la densité optique. Je ne vois pas non plus comment la présence de CO 2 dissous diminuerait aussi significativement la densité optique.  [...]