• Forum - Boucle, Forme, Séquence

Réparation de l'ADN

Lors de la réplication, lorsque lune séquence d'ADN est répétée ou forme des palindrome, elle peut se replier sur elle même et formé une boucle (épingle à cheveux).  [...] Si la boucle se forme ou niveau du brin néoformé, cela va entraîner une addition (la boucle fait que la séquence déjà répliquée n'est pas associé à son brin complémentaire et la polymérase la réplique à nouveau), si elle se forme sur le brin matrice, cela va entraîner une délétion. (fait un dessin pour mieux comprendre).  [...]

Fabrication banque ADNc

Ce qui me gène c'est la formation d'une boucle en épingle à cheveux. Cela doit se former si il y a une séquence palindromique à l'extrémité 5' de notre ADNc, non.  [...] N y a t il pas un risque qu'une telle boucle se forme au milieu de notre séquence codante Ou au contraire ne se forme t elle pas.  [...]

[Biologie Moléculaire] Mutation en reverse complement et heteroplasmie chloropolastique

De plus, on se trouve à un endroit où l'ADN forme sans doute une boucle, puisque les parties soulignées sont complémentaires l'une de l'autre.  [...] Cela ressemble à un phénomène de transposition. La séquence est peut-être instable et alterne entre une forme style hairpin et une forme double brin classique. On remarque que l'inversion de la séquence s'est précisément produite au niveau de la région la plus instable du hairpin, là où on a la boucle.  [...]

[Biochimie] exon et intron

Les introns et les exons sont définis par des séquences acceptrices ou donneuses d'épissage. la séquence donneuse se replie sur la séquence acceptrice, cela forme une boucle qui est clivée par le complexe d'épissage, pour faire simple. Il s'agit donc qu'une mutation génère un site donneur ou accepteur, ou qu'au contraire elle en inactive un des deux pour qu'on ait une transformation intron.. exon.  [...] D'ailleurs, dans le cas de l'épissage alternatif, une partie de la séquence peut être traduite ou non. mais que donne la traduction des parties traduites ou non selon le site accepteur d'épissage choisi Car ces parties font finalement seulement certaines fois partie de l'intron, mais sont quand même traduites d'autres fois. Or les introns ne sont-ils pas non codants.  [...]

opéron tryptophane

L'opéron est constitué d'un gène régulateur, d'un promoteur, d'un opérateur, d'une séquence leader atténuateur et de gènes de structure. Il y a sythèse des ARNm des gènes de structure puis traduction en protéine quand il n'y a pas ou peu de trytophane dans le mileu car il y a formation d'une boucle (par les séquences palindromiques) qui n'empêche pas la pogression de la polymérase.  [...] Quand il y a du tryptophane, la boucle se forme juste avant une séquence de poly U et empêche la progression de la polymérase, il n'y a pas transcription des gènes de structure.  [...]

Comment reconnaître une boucle de terminaison de transcription ?

J'ai chercher sur internet mais je ne trouve pas comment reconnaître une boucle de terminaison de la transcription dans une séquence d'une banque génomique, comment la différencier de tout les autres codons.  [...] C'est bien la bonne séquence que tu as entouré, reconnaissable à sa séquence répétée-inversée suivi d'une série de T. c'est parce que la séquence est répétée-inversée qu'elle permet la formation d'une boucle, et la série de T déstabilise les interactions DNA.RNA à la suite de la pause de la polymérase.  [...]

[Biologie Cellulaire] questions annales

Attention UTR signifie untranslated region, ce qui veut dire que c'est une séquence nucléotidique qui ne sera pas traduite en protéine.  [...] C'est quelque chose de difficile a repérer dans une séquence à l'oeil, mais il existe des programmes qui permettent de prédire les structure II des acides nucléiques.  [...]

Les codons stops

Je me demande s'il vous plait, quels sont les codons ou les séquences qui peuvent arrêter la transcription de l'ADN lorsque l'ARN polymérase transcrit le gène ADN. est-ce que c'est les codons comme TAG.  [...] Il y a la terminaison directe dit aussi rho-indépendante. Elle a lieu après deux séquences riches en CG en miroir qui vont former une structure tige-boucle juste avant une séquence poly-U au niveau de laquelle l'ARN polymérase bactérienne va se bloquer et se détacher de l'ADN.  [...]

[Génétique] Démonstration du role d'un miRNA in-vivo

Je connais très peu les miRNAs. Par contre j'ai une petite idée (à défaut de référence), je pense qu'il est possible d'agir comme pour l'invalidation d'un gène par KO. Le principe est le même, la forme expérimentale est évidemment un peu différente. Etant donné qu'un miRNA est constitué de deux séquences complémentaires, avec entre elles un espace (boucle), il s'agirait juste de faire de la mutagenèse dirigée.  [...] tu mute une des deux séquences complémentaires pour qu'elle ne puisse plus s'hybrider à la deuxième. Ainsi le miRNA ne peut plus former un hairpin après transcription. Il n'est donc plus reconnu, ni maturé par les systèmes protéique dédiés. il est invalidé.  [...]

short hairpin RNA

Je suis pas un specialiste des shRNAs mais apres une recherche rapide sur le net il semble que le mecanisme d'action soit identique aux siRNA. La difference est dans la structure secondaire de l arn. Le shRNA est un arn simple brin qui forme une tige boucle(comme tu peux voir ici.  [...] qui est une structure tres bien exporte du noyau (reconnu par une exportine). Une fois dans le cytoplasme la tige boucle est reconnue et clivée par une RNAse (dicer) qui enleve la boucle et la tu te retrouve avec un arn double brin (un siRNA en gros) avec une sequence complementaire a sa cible.  [...]