• Forum - Biologie, Température, ADN

[Biologie Moléculaire] extractiobn d'ADN plasmidique

J'ai eu un question dans le TP de biologie moléculaire dans ce qui conserne la méthode d'éxtraction de l'ADN plasmidique et la détermination de la température de fusion c'est que c'est quoi le rôle du sel dans la solution.  [...] 15M (ajout de 2V d'une solution SDS1%, NaOH 0.2M). Le SDS est un détergeant ionique servant à lyser les membranes et à dénaturer les protéines et les acides nucléiques (rupture des liaisons hydrogènes et des liaisons hydrophobes). NaOH, base forte, induit une augmentation du pH et dénature aussi les protéines et les acides nucléiques.   [...]

[Biologie Cellulaire] température de dénaturation de l'ADN.

En ce qui concerne la température de dénaturation de l'ADN, plus la pourcentage de G/C augmente, plus la Tm augmente.  [...] Tu vois qu'il y a plus de liaisons hydrogène entre G et C que entre A et T. Donc la liaison G-C est plus stable. Elle demande plus d'énergie, et donc plus de température pour être rompue.  [...]

[Biologie Moléculaire] Température de fusion de l'ADN (Tm)

Il suffit de voir les derniers articles sur cette question. la plupart des molécularistes mettent 55 ou 57°C en température d'hybridation même si leurs amorces devraient beaucoup plus haut.  [...] Mettre une température plus basse n'est pas très embêtant sauf pour un point, on augmente le risque de mésappariement et donc d'avoir des faux positifs.  [...]

Dénaturation de l'ADN

Les histones sont liés a l'adn il me semble par des liaisons ioniques et hydrogene, mais elle sont nombreuses (les liasons) donc les interactions diminueront mais il faudra un temperature importante pour les disociés totalement. (je ne suis plus tout a fait sur de la facon dont les histones se lient à l'adn donc j'ai peut etre faux sur ce dernier point).  [...] Pour l'ADN, on appel ca des super tour (parce qu'il y a deja des tours d'hélice dans l'ADN. on passe à un niveau au dessus). Les super tour existe dans les ADN circulaire mais aussi dans les longs ADN (tels que les ADN chromosomiques). En temps normal (cad dans des conditions de températures normale), les super tours sont négatifs.  [...]

Conservation d'échantillons biologiques à t° ambiante

A votre avis, combien de temps je peux conserver des échantillons biologiques, à température ambiante, en vue d'une extraction d'ADN.  [...] Au pire transporte tes échantillons dans un sachet étanche recouvert de glace, ce sera toujours mieux que la température ambiante. Comme l'a dit Gorben si c'estpour en extraire de l'ADN ca ne devrait pas poser de soucis, ca ne serait pas le même problème si tu voulais en extraire de l'ARN.  [...]

[Biochimie] Conservation ADN à température ambiante

J'ai fait une énorme boulette et ai laissé mon ADN à température ambiante pendant 4jours.  [...] Si la PCR n'est pas trop grande (disons. 1-1.5Kb) oui, cela est tout à fait envisageable. Au delà il y a peut être un risque que les coupures soient trop nombreuses. Cela dit je le tenterais quand même (mettons jusqu'a 2kb.   [...]

[Biochimie] spectre d'absorption et ADN

soit un ADN naturel mitochondriale de lapin [0.4M], bicaténaire, hélicoïdale, circulaire, comportant 500pb et un ARN naturel d'E.Coli [0.4M] monocaténaire, pseudo-hélicoïdale à 30% comportant 250b.  [...] Du coup si on prend par exemple un pic de 1 pour l'ADN, l'ARN devrait être à 0.5, mais avec l'effet hyperchrome, une partie se retrouve avec +40% donc 0.7. Or tu as 30% de ton ARN enroulé donc à 0.5 et 70% simple brin donc à 0.7. Ce qui donne au final. DO du pic ARN= (30%*0.5)+(70%*0.7)= 0.64.  [...]

[Biologie Moléculaire] PCR en temps réel

C'est le coté quantitatif. Autre avantage, ce signal est réversible. en chauffant, on dénature l'ADN double brin et le signal s'effondre. Par ce moyen, on peut connaitre la température de fusion des produits amplifiés.  [...] Commençons par cela. l'image du milieu présente justement l'abondance relative de l'ADN en fonction de la température de fusion. Elle a été obtenue à la FIN du run, une fois que l'amplification est terminée, lorsque l'appareil effectue une rampe de température tout en mesurant le signal.  [...]

[Biologie végétale] photosensibilité et température pour le phytochrome

[Biologie végétale] photosensibilité et température pour le phytochrome.  [...] Bonjour, je suis en L2 de Biologie et je voudrais savoir quel est le lien entre la photosensibilité et la température pour la germination d'une plante C'ets dans le cadre d'un cours de physio végétale sur le phytochrome et je ne comprends pas pourquoi la phtosensibilité est dependante de la température voila merci pour vos réponses.  [...]

[Biologie Moléculaire] Temps d'hybridation des amorces

Mais comme dis archaostol, le temps d'hybridation est température dépendant. Si tu as dénaturer un ADN double brin à 100°C (un peu près) et que tu le précipites d'un coups à 4°C, il va se réhybrider. Tellement vite qu'il va mal se réhybrider (mismatch, désapariement.  [...] ..). C'est pour cela que la température d'hybridation est généralement plus faible de 5-10°C de la température de fusion, nécessaire pour séparer les deux brins. Je rappelle également que la température de fusion est dépendante de la longueur de l'ADN, mais également de son pourcentage en GC (et d'autres paramètres plus complexes).  [...]