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[Biochimie] Calculs de ratios de bases dans l'ADN

[Biochimie] Calculs de ratios de bases dans l'ADN.  [...] Tu aurais pu proposer un titre plus explicite que calcul tout de même.  [...]

prédire digestion ADN DNAse1?

Je suis en essai d'un protocole de marquage de sonde. Pour ce faire, je dois digérer mon ADN Bac avec de la DNase 1. La seule information que j'ai c'est qu'il est suggéré d'utiliser 6ul de DNase 1 pour 1ug de BAC DNA de 100kb pendant 2 heures à 15 degrés C pour obtenir des fragments entre 300 et 700 bp).  [...] Par contre, mon BAC DNA est de 160kb de long, j'ai décidé d'utiliser 0,6ug de BAC DNA pour 6 ul de DNase 1. Après digestion, je ne vois pas de bandes sur mon gel électrophorèse et ma concentration au spectrophotomètre est beaucoup trop basse pour continuer l'expérience.  [...]

[Biochimie] NanoDrop

Tu peux lire la DO ADN/ARN auquel cas il mesurera automatiquement 230/260/280 et te donnera les ratios et la concentration.  [...] Tu peux lire la DO proteine pareil, il va mesurer 260/280 et 230 ou 330 je sais plus, il a meme des proteines preintegree comme la BSA pour la quantif, sinon tu rentre toi meme ton coef et il te donne la concentration.  [...]

[Biologie Moléculaire] Ligation

Je ne pense pas qu'il y ait problème au niveau du mix réactionnel (j'ai fait tout les calculs) mais plutôt au niveau des extrémités soit du vecteur soit des insert. Je suis entrain de tout reprendre et je ferai en sorte de lancer les ligations le plus rapidement possible.  [...] J'abonde dans le sens de Frankeeuuhh. Aussi bien pour les ratios que pour les quantités d'ADN Et également pour les bactéries.  [...]

[Biologie Moléculaire] Problème de séquençage

Je n'ai pas lu toutes les réponses...ceci m'est déjà arrivé plusieurs fois et typiquement, cela est du à un mauvais ration quantité d'ADN matrice/quantité d'amorce.  [...] Dans la notice du Big Dye, les ratios idéales sont précisés. Pour info, mes séquences fonctionnent bien en utilisant 3microL de BigDye, 2microL de Tampon, environ 1,5MicroG d'ADN pl et 4pMoles d'amorces.  [...]

[Génétique] Extraction, purification et analyse d'ARN (Nanodrop et bioanalyser)

La technique utilise l'absorbance de l'ARN, l'ADN et autre molécules à certaines longueurs d'onde ciblées... Que puis-je dire là-dessus Que pouvez-vous dire sur les ratios 260/280 et 260/230 Mon analyse me renseigne sur la concentration (en ARN), l'absorbance à 280 et 260 et les deux ratios.  [...] LEs ratios permettent uniquement de s'assurer de la pureté d'un acide nucléique. En effet l'absorbance a 230 concerne divers composés organiques (phénol par exemple) et celle a 280 les protéines. Un ratio de l'ordre de 2 permet de voir que ton extrait est assez propre et ne contient presque que de l'acide nucléique.  [...]

[biologie moléculaire] qualité d'ARN

Mes ratios 260/280 sont tous autour de de 2,1 par contre j'aurais du noter le ratio 230.J'ai fait agir une DNase donc ça me paraissait pas utile.C'est bien lié à une conta d'ADN non.  [...] Merci pour les infos sur les ratios et contaminations. Cependant j'ai extrait l'ARN avec midi kit qiagen et je ne connait pas exactement la composition des tampons (je ne crois pas qu'il y ait du phénol).  [...]

[Microbiologie] ligation clonage

En principe dans la formule de simple ligation (que tu peux trouver via google très facilement), tu tiens compte de la taille de l'insert, du plasmide et de leur quantité respectivement pour avoir le meilleur ratio insert/plasmide.  [...] merci pour votre coopération, juste j'aimerais bien savoir quand est ce que je peux utiliser les ratios 1.1, 1.5, et 1.3 (insert/vecteur) comment je peux savoir si les bouts sont cohésifs ou pas sachant que j'ai utilisé ECOR I pour traiter mon plasmide et l'ADN.  [...]

Calcul de ratios en real time RTqPCR: Combinaison de gènes de référence.

Pour le calcul du Ratio de mon gène A par rapport au gène de ménage sur un échantillon, et normalisé par rapport à mon calibrateur.  [...] Je n'ai jamais utilisé plusieurs gènes de ménage donc je ne peux pas trop répondre a chaud pour le calcul, (peut être que Flyingbike saura), mais j'ai une question,  [...]

[Biochimie] Améliorer la quantité, qualité et pureté d'une extraction d'ARN

J'ai obtenue une concentration pour la méthode de précipitation de 1240 ng/µL avec les ratios de 260/280 est de 1,66 et 260/230 la valeur est de 1,59 permettant de dire qu'il y a une très grande contamination en matière organique. Pour l'échantillon de colonne est de 440 ng/µL Pour l'échantillon de colonne, la valeur du ratio 260/280 est de 2,08 permettant de conclure qu'il n'y a pas de contamination protéique.  [...] De façon générale, le matériel en colonne est plus propre notamment parce qu'on évite plus facilement les contaminations par carry over, par contre je suis étonné que vos ratios 18/28S ne soient pas meilleurs.  [...]