• Forum - Beta, Structures, Protéines

[Biologie Moléculaire] Ribose ou.. Beta-D-ribofuranose

Non non pas la structure des protéines justement. Je sais qu'il y a 4 niveaux de structure et pour la 2ème on a des structures 2ndaires Alpha (hélices) ou Beta (feuillet).  [...] Par ailleurs, d'accord avec Aquilegia. on n'utilise les notations alpha et béta que pour les protéines (correct, au niveau des structures IIaires).  [...]

[Biochimie] action du mercaptoethanol sur un peptide

En effet le Béta mercaptoethanol est un destrcteur des structures quaternaires et tertiaires des peptides et protéines.  [...] Je pense que c'est parce qu'il s'agit d'un peptide qui est court et dans lequel on retrouve un acide aminé rare. la sélénocystéine. Cette hélice implique en effet un petit nombre d'acide aminée et se retrouve généralement, dans les protéines qui possèdent un acide aminé rare.  [...]

Structure quaternaire

Bonjour, une simple question. la structure quaternaire est l'organisation de sous-unités. Mais par sous-unités, si j'ai bien compris en cherchant sur internet, on entend peptide intégré dans la proteine par intéraction non-covalente, et donc en quelques sortes indépendante.  [...] Une structure quaternaire correspond à l'assemblage de plusieurs protéines (appelées alors sous-unités (SU)), c'est-à-dire de chaînes poypeptidiques issues chacune d'un événement de traduction d'un ARN messager par un ribosome.  [...]

Régulation par induction chez les bactéries...

On nous a expliqué que l'opéron lactose est constitué du gène I, du P, du O et enfin des gènes de structures codants les protéines ( enzyme que sont la galactoside perméase, la bêta galactosidase, et la galactoside trans-acétylase ).  [...] Maintenant on nous a dit que le lactose pouvait changer la structure tridimentionnelle du répresseur et ainsi il ne se fixe plus sur sur le gène O et il y a synthèse des enzymes.  [...]

[Evolution] Origine de la vie sur Terre

Si je ne me trompe pas, il me semble que les acides aminés extra-terrestres des comètes sont aussi bien dextrogyres ( à droite ) que lévogyres ( à gauche ). Toutefois, ceci n'infirme pas du tout l'hypothèse émise. le problème est en effet de se demander comment les premières molécules organiques complexes ont pu apparaitre sur Terre.   [...] Le problème c'est que des protéines composée d'acides aminé L et D sont incapables de former des structures régulière type feuillet beta et hélice alpha si importante pour leurs stabilité et leurs activités catalytique. Par contre on pourrait imaginer qu'a l'origine, deux formes de vies primitives coexistaient.  [...]

le prion PrPsc

nous avons vu un cours aujourd'hui trés interessant mais néanmmoins incomplet en ce qui concerne le prion, autrement dit la protéine PrPsc, analogue de structure primaire de la protéine PrPc. On ne connait pas exactement le rôle de cette dernière mais saurait on de quelle manière la protéine PrPsc entraine une vacuolisation au niveau de l'encéphale De quelle manière entraine t elle l'apoptose des neurones à ce niveau et la pullulation des astrocytes De plus, lors d'une inoculation par voie digestive comment cette protéine, malgré sa résistance exceptionnelle aux PK peut elle traverser la muqueuse intestinale et attérir dans le SNC et enfin, quel traitement permettrait de reconfigurer des feuillets plissés béta en hélice alpha.  [...] En ce qui concerne le traitement comme tu le sais les Feuillets Beta sont stabilisés par liaisons faibles et il est possible en modulant ces liasons comme par exemple par l'action de detergeant doux ( comme le triton X 100, le sds, le dos ) de lineariser donc de faire revenir a des structures plus primaires les proteines.  [...]

Le scénario de l'origine de la vie enfin déterminé ? - Page 13

Les classements structurels des protéines, comme SCOP extended, indiquent que plus de 90 % des 4851 familles de protéines connues contiennent soit des hélices alpha ( ±-helices ), soit des feuillets bêta ( ²-sheets ), soit les deux à la fois. Par conséquent, il ne paraît pas exagéré de dire que ce sont les deux structures tridimensionnelles les plus courantes dans les protéines modernes.  [...] Il faut aussi éviter l'ecueil de l'interprétation téléologique. l'hélice alpha est stable si et seulement si les acides aminés sont de tel type, donc l'homochiralité est nécessaire à la formation des protéines et donc à la vie. Alors que rien ne dit qu'il n'y a pas une structure stable des polypeptides autre que l'hélice alpha et qui ne nécessite pas l'homochiralité.  [...]

[Biochimie] structure secondaire des proteines

Il y a ensuite les structures secondaires, qui sont locales, (souvent les protéines en présentent plusieurs). Ce sont les hélices alpha, feuillets béta ou alors ce qu'on appelle random coil lorsqu'il n'y a pas vraiment de structure. Ces structures secondaires peuvent ensemble former la structure tertiaire qui constitue une protéine lui permettant notamment sa fonction et sa spécificité pour une autre protéine ou un autre molécule biologique (ADN par exemple pour les facteurs de transcription).  [...] Cela pour être éloigné de l'eau présent dans le milieu. Ces régions peuvent former par exemple des structures secondaires en hélice alpha pour les protéines transmembranaires.  [...]

[Biochimie] Conformation préférentielle des acides aminés ??

Pour cela ils ont tout d'abord analyser des structures 3D de protéines déterminer par cristallographie des rayons X. Ces structures sont stockées sur une banque de données la PDB (Protein Data Bank). Ils ont observés (analyse statistique) que certaines séquences en acides aminés allaient données préferentiellement des Helices alpha, des brins/feuillets béta ou des coudes.  [...] Donc ensuite ils ont construit un algorithme où tu rentres la séquences de ta protéine et le logiciel va prédire les éléments de structures secondaires de ta protéine.  [...]

[Biochimie] Hélice Alpha

- La structure secondaire, qui représente l'organisation de cette chaine d'acides aminés, en hélice alpha ou en feuillet bêta par exemple.  [...] La structure tertiaire, qui représente l'organisation tridimensionnelle de la protéine, peut donc être organisée en plusieurs domaine, et se retrouver avec des hélices alpha, des domaines beta ou même des structures désorganisées (sans aucune forme précise), et tout cela en même temps.  [...]