• Forum - Base, Structure, Cristalline

[Divers] La Vie sous une forme différente, dans des conditions différentes?

En date du 4 décembre 2012, de ces ~500000 protéines, on ne connaît la structure cristalline que pour 86611 (0,46%) d'entre elles (voir ici ).  [...] En date du 1er février 2012, de ces 86611 protéines dont la structure cristalline est connue, on n'avait analysées les domaines et motifs que de 49219 (56,8%) d'entre elles (voir la base de données SCOP ).  [...]

[Identification] Molécule cristalline

En plus de la réponse attendue (technique de base pour identifier une structure cristalline), on peut s'aider de la RMN 1D/2D, LC-MS/MS, l'analyse élémentaire.  [...] Toujours ce problème d'identification de molécule cristalline... Quelqu'un pourrait m'aider à interpréter ce spectre IR-TF J'arrive à interpréter quelques pics (et encore, je suis pas du tout sûre de moi), mais une fois toutes les infos réunies, je sais pas comment faire.  [...]

[Biologie Moléculaire] Combien d'enzymes différentes dans le vivant ?

Il y a 4585 enzymes différentes. On connaît à la fois la séquence d'acides aminés et la structure cristalline pour 1776 d'entre elles. Pour 1052 autres, on connaît uniquement la séquence d'acides aminés. Enfin, pour le reste, soit 2809, on ne connaît ni la séquence ni la structure cristalline (mais on connaîtle minimum, c'est-à-dire le type de réaction effectivment catalysée par ces enzymes).  [...] J'observe également que la description d'une protéine ne peut pas rentrer dans les bases de données si la résolution structurelle (structure secondaire) est supérieure à 4 angströms. Je pense notamment à la base de données UniProt. Je ne sais pas la part des labos qui possède l'instrumentation nécessaire (diffraction X, RMN, etc...) pour passer cette limite de 4 angströms.  [...]

[Biochimie] Du Charbon vegetal qui absorbe du Gaz ?

Les zeolites (qui ont une structure cristalline particulierement 'vide') ont egalement cette propriete.  [...] Despite being an ancient treatment for various digestive complaints, activated charcoal did not produce reduction in both the total flatus volume nor the release of sulfur-containing gasses, and there was no reduction in abdominal symptoms (after 0.52 g activated charcoal four times a day for 1 week).   [...]

[Evolution] transformation du gneiss en granite

Ensuite ces deux types de roches peuvent être transformée en roches métamorphiques (comme le gneiss) suite à des recristallisation due à la chaleur, la pression extrême située sous terre.  [...] La composition reste globalement la même mais la structure cristalline est remaniée et le minerai gagne ou perds de sa composition en eau.  [...]

[Microbiologie] bactéries et cellulose

- L'Endo- ß 1, 4-glucanase. (EG) (EC 3.2.1.4) coupe les liens internes pour perturber la structure cristalline de la cellulose, produisant ainsi des molécules de glucane et par conséquent de nouvelles extrimités.  [...] - L'Exocellulase (CBH) ou cellobiohydrolase (EC 3.2.1.91) coupe en 2 ou 4 unités des extrémités des chaînes exposées produites par l'endocellulase, ayant pour résultat des tétrasaccharides ou des disaccharides tels que le cellobiose.   [...]

[Physiologie] Rigidité Cadavérique

L'irréversibilité découle de la diminution de la teneur en ATP, dont la vitesse de production devient inférieure à la vitesse d'hydrolyse, lorsque l'arrêt de la circulation sanguine prive le muscle de l'oxygène. le potentiel redox chute de +250 à -50millivolts.   [...] Enfin, l'hydrolyse de l'ATP libère un résidu phosphorique et le pH baisse de 7,2 à 5,5, ce qui intensifie la liaison actine-myosine et provoque le passage de la structure cristalline, plus compacte, avec une chute de la capacité de rétention de l'eau.  [...]

[Génétique] Programme génétique et cellules - Page 2

Déjà, l'hélice Z est provoquée par des régions GC-rich. C'est d'ailleurs de la sorte que l'on a obtenue pour la very first time. les gars ont synthétisé pCpGpCpG (je ne me souviens pas du nombre exact de C et G) dont ils ont éludé la structure cristalline.  [...] Je ne vais pas entrer dans les détails de structure (mes cours perso de bioch m'épatent. à une époque j'avais vraiment la patience de bosser ça...). Il est pourtant important de remarquer que d'un côté, une hélice Z ne forme pas de nucléosomes aux dernières nouvelles et que la méthylation des C a un effet stabilisateur de la conformation.  [...]

Pseudomonas Syringae

Ce type d'eau (ne contenant que des molécules d'eau et rien d'autre) n'existe probablement pas dans la nature (sauf peut-être dans les nuages) et c'est extrêmement difficile à vérifier et à reproduire en laboratoire. On a quand même essayé il y a quelques années, en utilisant par exemple de très petits volumes d'eau ultra-pure, le piégeage dans des gouttelettes d'huile ou même plus récemment la lévitation de microgouttelettes d'eau grâce à un champ électromagnétique, pour éviter les frottements avec un quelconque récipient.   [...] Les bactéries nucléatrices phytopathogènes (comme P. syringae effectivement mais aussi une dizaine d'autres espèces dont Erwinia ou encore Xanthomonas ) produisent des protéines (InaZ de P. syringae est la plus étudiée et connue) qui provoquent la formation d'un complexe membranaire imitant la structure cristalline de l'eau et catalysant la nucléation.  [...]

[Biochimie] Les yeux peuvent t'ils changer de couleur ? - Page 2

Comme tout solide translucide (= laissant passer la lumière mais filtrant une partie des longueurs d'ondes), l'iris diffuse, diffracte et reflète la lumière. Sa structure inhomogène (non cristalline) ajoute encore des nuances de couleur, à celles du ou des pigments éventuellement présent, par recomposition et recombinaison de la lumière brute renvoyée.  [...] La mélatonine est une hormone lipophile de structure indolique dérivée de la sérotonine. Cette hormone est synthétisée par la glande pinéale [20], la rétine [21], [22] et le corps ciliaire [23]. Dans la rétine, cette indolamine est principalement localisée dans les photorécepteurs, mais aussi dans certaines cellules de la couche nucléaire interne.  [...]