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[Bio-Informatique] BLASTp: Se fier à SwissProt ou NR ?

En fait à partir d'une séquence protéique, où nous demande d'interroger la base de donnée Swissprot ainsi que NR pour valider l'hypothèse quand à la fonction de la séquence prédite avec InterProScan.  [...] Selon InterProscan, ma séquence semble coder pour une partie d'une Methylmalonyl-CoA Mutase. Le problème c'est que quand j'interroge la base de donnée SwissProt, les 4 séquences homologues de plus faible E-value (pour un query cover de 100%) codent pour Isobutyryl-CoA Mutase, et on trouve la Methylmalonyl CoA Mutase seulement en 5ème E-Value la + faible (beaucoup + élevée que pour l'isobutyryl).  [...]

qPCR résultats hors gamme standard!!!

Pour tester cette hypothèse. si tu as une chance que la séquence de l'ADNc soit différente de celle de l'ADN génomique (intron), séquence le produit PCR.  [...] Si les 2 séquences sont identiques, fait une PCRq avec un couple d'amorces placé dans un intron pour contrôler le niveau de contamination par de l'ADN génomique.  [...]

OGM et pollution génétique de l'eau

Quelles peuvent être les conséquences de la présence de séquences d'ADN génétiquement modifié en quantité importante dans la nature et acheminées par l'eau Il suffit de se rappeler qu'un virus est une parcelle d'ADN enrobée d'une capsule (protéine) (4) et l'on peut deviner que la culture intensive d'OGM est un terrain de risques très importants d'élaboration de nouveaux virus que l'homme n'a jamais eu à affronter jusqu'alors.  [...] Hypothèse, test de l'hypothèse, conclusion. C'est comme ça qu'on raisonne en science, et pas avec des scénarios à n'en plus finir, le tout bien entendu monté en épingle sans qu'il n'y ait la moindre base factuelle au tout.  [...]

code génétique

- On peut émettre l'hypothèse que ta séquence est extraite d'un des rares organisme au code génétique alternatif. C'est le cas de certaines mitochondries je crois et de la levure boulangère. Il me semble qu'il y a un codon STOP qui est modifié mais j'ai pas de souvenir d'un START différent.  [...] - Je réitère l'hypothèse d'une portion de transcrit non-traduite, en 5' de l'ARNm. Y'a pas un START potentiel plus loin dans la séquence Je pense que tu pourrais le préciser dans ta réponse. dire qu'en absence de START, il est possible que ce messager ne soit pas traduit.  [...]

[Biologie Moléculaire] Disponibilité ARNt procaryotes

J'ai muté la séquence codante d'un gène bactérien mais de façon silencieuse afin d'en conserver la séquence en acides aminés. Je teste maintenant l'activité de la protéine codée par le gène sauvage ou le gène muté en la surexprimant par le promoteur inductible PBAD.  [...] En fait, on voudrait justement éviter de passer par un Western et on a besoin de muter le gène pour sa séquence en nucléotides mais sans modifier la séquence en AA. on a réussi et observé quelque chose qui va dans le sens de notre hypothèse, en l'occurrence une activité plus faible.  [...]

[Biologie Cellulaire] Mitochondrie : adressage de protèines

JE n'ai aps travaillé ce sujet depuis des années, mais il me semble que l'hypothèse dominante était un transfert passif, une fois la séquence d'adressage ancrée.  [...] 1° les préséquences qui ont une extrémité N term clivable, sont composées de 20 à 60 acides aminés en général, 10 à 80 pour les extrèmes.Il n'y a pas de séquence très spécifique mais elles ont des caractères électrochimiques particulières (surtout chargée+) et l'hydroxylation des acides aminés est courante (présence de OH).  [...]

Créationnisme

Comment peut-on qualifier de scientifique une théorie qui pose une hypothèse non réfutable à la base de son raisonnement Or l'hypothèse fondamentale de toute forme de créationnisme est un fait non réfutable... La démarche (assez perverse) qu'il y a derrière c'est je vous affirme qu'une force intelligente supérieure agit à l'origine, c'est à vous de me prouver le contraire, démarche absolument contraire à l'essence de ce qu'est un questionnement scientifique.  [...] En fait, les IDistes se trompent de problème. il faut constater des faits, voir s'ils entrent en accord avec la théorie et ne faire de nouvelle hypothèse que s'il cela est nécessaire. Les IDistes postulent l'existence de quelque force qui orienterait l'évolution sans et cherchent à le prouver sans se demander si ce phénomène ne pourrait être expliqué autrement, par des mécanismes connus.  [...]

[statistiques] Tester la normalité d'un échantillon

L'idée de base des permutations est la suivante. s'il n'y a pas de différence entre les conditions (hypothèse nulle) alors une étiquette condition est arbitraire.  [...] On peut aussi imaginer que regarder ces signaux comme temporels ne permet pas de les discriminer assez bien, il faudrait peut être passer dans un espace de fréquences ou un autre espace. Bref, on peut imaginer tout un tas de choses.   [...]

[Evolution] Pourquoi a-t-on 5 doigts aux mains ? - Page 3

tu te base sur quoi la personne possède (physiologiquement) les mêmes capacités de procréations, la seul autre chose qui entre en jeu ducoup, c'est la capacité a trouver un partenaire, et c'est ici que dans le règne animal ca peut poser problème mais pas chez nous,  [...] oui, si 100 pourcent des solutions ont un pourcentage faible au final il arrivera forcement quelque chose qui avait un pourcentage faible d'arriver, mais dans ton cas elle est obligé d'aboutir a un résultat (au moins un brin d'herbe) or la c'est plutot 98% de chance que la vie ne se crée pas, 1,9% qu'elle se créé mais qu'elle reste très basique (unicellulaire ou autres organismes dîts inférieurs ) et seulement0,01 % de vie intelligente, et pourtant.   [...]

[Génétique] On n'hérite pas que de l'ADN

L'environnement influence ces signaux épigénétiques qui peuvent ainsi subir de petits changements. Ces épimutations sont plus fréquentes que les mutations classiques de l'ADN. Alors que l'on pensait qu'elles étaient systématiquement effacées lors de la formation des ovules et des spermatozoïdes, elles ne seraient pas gommées.   [...] Si l'hypothèse de l'hérédité épigénétique se confirme, elle ouvrirait de nouvelles perspectives. Cela impliquerait que certaines maladies ne sont pas dues à une variation de la séquence d'ADN mais peut-être à des épimutations.  [...]