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Bioinformatique - Etudes d'une sequence d'ADN

Quels sont les indices les plus important qu'il est a calculer sur une sequence d'ADN afin de la comparer a d'autre sequence d'ADN.  [...] Blast, c''est le plus facile et le plus lisible c'est blast, ORF contre ORF, mais fait aussi un Blast ADN vs ADN, car si il y a une erreur de séquence provoquant un stop ou un décalage de cadre (dans la tienne, ou dans la banque) tu peux perdre de l'info, il y a beaucoup d'erreurs dans les banques, par ex fais un Blast en utilisant le polylinker d'un pUC quelconque, tu verras.  [...]

diagnostic prénatal technique

Je pensais que c'etait peut etre grace aux banques soustractives mais a ce moment la le temoin et le prélévement a diagnostiqué n'aurons pas le meme adn et donc il y aura beaucoup de divergence entre les deux donc comment trouver 'the ' sequence qui rend la personne malade.  [...] les séquences pathogènes connues ont été déterminées empiriquement et sont recensées dans des banques de données. On peut séquencer une protéine mais je ne suis pas sûr que ça se fasse beaucoup en diagnostique. De plus, passer d'une séquence de 20 lettres à 4 lettres implique plusieurs possibilités (cf code génétique).  [...]

Banque d'ADN ?

D'abord les banques d'ADN Génomique et ensuite les banques d'ADN complémentaire.  [...] Mais quelle est a diffèrence entre les 2 Il me semble que l'une d'entre elle représente la casi-totalité du génome d'une éspèce et l'autre un peu moins, ou du moins, seulement celui d'un tissu en particulier.. je me trompe.   [...]

[Biologie Moléculaire] Criblage d'une banque d'ADNc

AVec les banques des séquences complètes des génomes, on peut aussi utiliser le BLAST pour trouver des gènes homologues, variants du même gènes ( splicés )...etc.  [...] Merci de t'inquiéter pour mes connaissances. Il faut lire ce que j'écris. Quand j'utilise les mots maintenant et il y a 10 ans, ce n'est pas pour rien. J'aurai aimé t'y voir il y a pas plus de 10 ans, à faire des blast pour trouver des gènes ou des familles de gènes sur... des banques d'ADNc ayant été séquencées.  [...]

[Biologie Moléculaire] Principe de la LM-PCR

Tu fait la meme chose avec un autre fluorophore pour l'ADN total non coimmunoprécipté lors de la ChIP et t'hybride le tout sur une puce possédant une banques de séquences intergénique et le tour est jouer.  [...] Globalement, ca permet de faire une PCR quand tu ne connais pas ta sequence, puisque tu as fixe un adaptateur lors de la premiere etape. Les applications sont donc multiples.  [...]

[Biologie Moléculaire] enzyme de restriction

La première, la séquence que vous attendez n'est pas la vraie séquence génétique. Les banques de données ne sont pas exempts d'erreurs.  [...] Effectivement, j'ai regardé un possible site cryptique, mais la séquence concernée est l'exon 20 du gène CFTR, et qui est très étudiée, et je n'ai rien trouvé dans la littérature à ce sujet.  [...]

[Génétique] Déterminer l'ORF d'un gène?

ta séquence est connus elle est répertoriée dans les banques donne nous plus de détails conernant ta séquence qu'on puisse essayé de mieux t'aider.  [...] Fait comme même attention par rapport à ton choix tout dépend ce que tu as fait avec ta séquence si c'est un clonage si c'est le résultats d'un séquençage... tu peux avoir des surprises donc toujours rester vigilant avec la bioinformatique.  [...]

[Journal club] Immortalisation et Transformation d'une cellule humaine à partir d'éléments génétiques définis.

A leur époque ce n'était pas possible car des banques de séquences du génome humain complètes n'existaient pas, mais actuellement le mieux serait de séquencer un côté de l'insertion en faisant une marche sur le chromosome et cribler les banques de séquences avec la séquence d'un des deux côtés flanquant l'insert.  [...] Je trouve qu'il manque non seulement le site d'intregation du retrovirus (meme sans la sequence, y'a des moyens de connaitre le site d'integration), mais egalement le controle avec le retrovirus seul integre au meme endroit du genome.  [...]

[Biologie Moléculaire] Promoteur banque BAC

Pour cela comment cela fonctionne et comment puis je être sur que les clones contiennent ma séquence promotrice complète.  [...] Je n'ai toujours vu cette méthode qu'en théorie, je ne la connais pas en pratique. Par exemple, je ne crois pas qu'il y ait besoin de lyser les bactéries sur la réplique. Il doit y avoir suffisamment d'ADN provenant de bactéries lysées spontanément au sein de chaque colonie répliquées sur la nitrocellulose pour être détecté par les sondes.  [...]

[Biotechnologie] Concrètement c'est quoi une banque d'ADN

banque d'ADN, quand je vois ça j'imagine un grand institut avec des jolies baies vitrées et plein des scientifiques en blouses blanches qui viennent retirer des séquences d'ADN de leurs banque.  [...] Par exemple, une boite de pétrie, dans laquelle il y a des souches bactériennes ayant incorporées des séquences d'intérêts, peut elle être qualifié de banque d'ADN.  [...]