• Forum - Banque, Fragment, ADN

OGM (l'identification du/des gènes intéressant(s))

On étudie alors leur génome par exemple en faisant une banque d'ADN de chaque souche. En comparant les deux banques on trouvera au moins un fragment d'ADN qui sera différent entre les deux. il y a de bonnes chances que ce fragment soit le gène recherché.  [...] Si on veut la séquence du gène, on le récupère alors en utilisant la même enzyme de restriction qui a permis de constituer les banques d'ADN et on le séquence.  [...]

L'expérience mystère..

Je commence. Grâce à un Southern, on a pu isoler un fragment d'ADN de 50 Kilobases issu d'une banque génomique d'une espèce très rare de papillon d'Amazonie. Ce fragment coderait un gène capital pour la survie de cette espèce, mais ceci reste à confirmer.  [...] PS. Dans le cas de cette détermination structurale d'un gène, le Blast peut en effet nous permettre de savoir si notre fragment contient le gène entier ou s'il manque des régions en 5' et 3' du fragment. Je reconnais.  [...]

[bio mol] Séquencage. RFLP

A propos du 1/, je crois que tu te trompes... la méthode de Sanger consiste à séquencer un fragment d'ADN, pas à le cloner. Et elle ne comporte pas à ma connaissance d'étape de ligation.  [...] Quand le séquencage est en shotgun (séquencage de génomes), une banque d'ADN (ADNc) issue de la digestion statistique de ce fragment est clonée dans un plasmide, un BAC ou un YAC. Des molécules de plasmides (BAC,...) intègrent.  [...]

Marche sur le chromosome

De nouvelles sondes complémentaires à des séquences du même fragment mais adjacentes au point de départ (clone BAC) sont synthétisées et ensuite utilisées pour identifier de nouveaux fragments de restriction chevauchant le point de départ initial. Le procédé est répété, en s'éloignant progressivement du point de départ.  [...] La premiere étape consiste a fabriquer une banque de fragment d'ADN genomique sur lequel va etre fixé un adaptateur. Ensuite il suffit de faire une PCR en utilisant une amorce spécifique du fragment d'ADN que tu connai et une amorce spécifique de l'adapatateur.  [...]

[Biotechnologie] Problèmes sur les notions/calculs de plasmide

Un chercheur dispose d'un vecteur de clonage, le plasmide pLLAGRE, dont il cherhe à déterminer la carte. Pour ce faire, il réalise des digestions à l'aide des enzymes de restriction Hind3 et BsP1 et obtient les fragments suivants.  [...] La première partie du devoir vise à vous faire trouver la taille du plasmide. D'où proviennent les fragments générés par la digestion enzymatique Pensez vous que le plasmide puisse faire 5807 pb alors que la digestion par BspI génère un fragment de cette parmis d'autres.  [...]

[Biotechnologie] Concrètement c'est quoi une banque d'ADN

Une banque d'ADN est exactement ce que tu dis, un enorme mélange de fragments d'ADN aléatoire représentant un génome d'un organisme donné. En general on suppose qu'il y a tous les genes de l'organismes concerné quand la taille cumulée des fragments de la banques est egal a au moins 5 fois la taille du génome.  [...] A noter qu'il existe des banques d'ADN, mais que celles ci tentent de plus en plus a disparaitre au profit des banques d'ADNc, pour lequel l'ADNc est un plus petit fragment et DONC pas besoin de le coupé en petit bout pour le conserver.  [...]

Banque d'ADN

Pour effectuer une banque d'ADNg d'un organisme, si j'ai bien compris, il suffit de mettre l'ADNg en présence d'une enzyme de restriction et de vecteurs. Nous nous retrouvons alors avec un ensemble de plasmides contenant chacun un fragment d'ADN.  [...] Maintenant, pour savoir si le gène X est présent dans cette banque et j'utilise une sonde ADN complémentaire au gène. Or, elle ne s'hybridera pas dans cette banque car le gène n'est présent que sous la forme de fragments.  [...]

[Biochimie] Question sur la biotechnologie

Mais... si ces milliers de clones dérivent tous du même gène, on aura juste ce fragment de gène en milliers d'exemplaires, non pas tous les gènes. A moins d'avoir des milliers de clones différents, et ceux en plusieurs exemplaires pour pouvoir réaliser la méthode de séquençage de Sanger (nécessité de pleins de clones identiques) pour pouvoir reconstituer les séquences au nucléotide près. Est-ce exact.  [...] Dans une banque tu as de nombreux clones différents. Ceux identiques sont ceux qui forment une colonie (=un clone) sur ta boîte (car il faut des millions de bactéries pour former quelque chose de visible à l'oeil nu). Sur une boîte de Petri tu peux avoir des centaines de colonies qui correspondent à un fragment d'ADN unique au sein de la banque.  [...]

[Biologie Moléculaire] Construction d'une banque d'ADNc

Une banque d'ADNc correspond aux clonages de tous les ADNc obtenus dans un vecteur. Cette banque est alors utilisée dans un crible afin d'identifier le clone possédant le(s) gene(s) recherché(s). Une fois les clones identifiés, il s'agit de preparer les plasmides et de les sequencer afin de caracteriser le fragment cloné.  [...] Beh, tu introduis dans des bactéries pour obtenir une quantité de plasmides élevée et puis tu extraies cet ADN. Mais le truc est que ta banque n'est pas les cellules, ta banque est toutes les copies des fragments d'intérêt que tu souhaites (représenté chacun une 10aine de fois, je crois, pour être certain que tout le génome est couvert).  [...]

[Génétique] marche sur chromosome

On utilise donc des banques d'ADN. La banque d'ADN, c'est de l'ADN double brin digéré en fragments irréguliers par une enzyme de restriction. Mais les fragments sont mélangés, ils ne sont plus dans l'ordre initial.  [...] Pour poursuivre avec le parallèle des bandes de papier, mettons que tu ais un segment avec du jaune et du rouge (n°1), un avec du rouge, du jaune au milieu et du gris (n°2), un autre avec du gris et du vert (n°3), un avec du vert et du noir (n°4) et un dernier avec seulement du noir (n°5).   [...]