• Forum - Baisse, Activité, Enzyme

enzymologie/courbe??

ton interprétation a l'air tout à fait bonne. à partir d'une certaine température, les liaisons faibles intervenant dans la structure tertiaire ou la structure quaternaire sont rompues en permanence, ce qui a pour effet de dénaturer ton enzyme et son activité baisse jusqu'à devenir nulle.  [...] - Si tu met l'enzyme dans le milieu réactionnel et que tu fais varier la t° en regardant l'activité enzymatique, la t° optimale sera par exemple 30°.  [...]

[Biochimie] Dégradation tag et protéase

Le but de cette partie du projet, c'est d'avoir une activité protéase sur demande dans un organisme. Je pensais faire une protéine de fusion avec une partie de la protéase fusionnée au phytochrome, et l'autre partie fusionnée à PIF3, une protéine qui se fixe au phytochrome une fois activé par la lumière rouge.  [...] Eventuellement, tu peux tagger une enzyme du metabolisme dont un kit existe pour mesurer son activitee. En condition ou le substrat est saturant, si tu peux suivre une baisse de l'activite specifique de ton enzyme qui correspondra a une baisse de sa concentration.  [...]

spécificité de substrat glucose-oxydase

Je sais que l'enzyme à une spécificité de substrat pour le D-glucose mais comment expliquer la baisse de l'activité pour les autres.  [...] Le D-glucose est le substrat optimal donc si tu utilises autre chose, ça marchera peut-être mais ton site actif ne sera pas utilisé au maximum de ses capacités. sur le plan structural, du D-glucose n'est pas du L-glucose...et si tu utilises un substrat plus ou moins encombrant en terme de masse, ça ne sera pas parfaitement adapté à ton site actif, d'où ta perte d'activité.  [...]

[Biochimie] Activité alcool déshydrogénase

lors de ma manipulation, j'ai mit dans un tube du tampon glycine, de l'alcool déshydrogénase, de l'éthanol et de l'acide sulfurique.Le tout a incubé pendant 2H à 30°C puis j'ai ajouté le cofacteur NAD+. Par mesure par spectrophotométrie j'ai pu déterminer que j'avais une baisse de l'activité de l'enzyme (par rapport à une expérience précédente sans H2SO4). Moins de NADH a été formé.  [...] Je sais que la présence de groupement thiol -SH au sein de la protéine est importante pour son activité, donc est-ce que malgré que l'on soit dans du tampon, H2SO4 agirait sur ces groupements En établissant des liaisons hydrogène ou en établissant des ponts disulfures par exemple.  [...]

[Biochimie] Immunoblotting, anticorps

Ainsi, ils font plusieurs expérience sur l'activité enzymatique, pour arriver aux conclusions qu'il n'y a pas de ponts disulfides et que finalement si on les mute en alanine il n'y a pas de baisse de l'activité enzymatique et si on ajoute des agents chimiques modifiant les thiols, alors une seule cystéine provoque une baisse de l'activité (donc supposition que cette cystéine est proche du site de liaison au substrat, et qu'il y a encombrement stérique quand agent chimique NEM est lié à cette cystéine).  [...] parce que dans l article ils trouvent finalement qu une des cysteines se trouve proche du site actif (par déduction car quand un groupe se lie au thiol il y a baisse de l activité enzymatique sûrement par obstruction stérique...).  [...]

[Biochimie] PFK-2 et FBPase-2 (enzyme bifonctionelle glycolyse) incompréhension

A partir de là si je comprends bien le manque de sucre dans le sang entraine la production de glucagon hormone hyperglycémiante qui va induire la baisse de glycolyse et l'augmentation de la néoglucogenèse donc la PKA va phosphorylé la FBPase ou fructose 2,6 biphosphatase qui est une enzyme du catabolisme donc quand elle est phosphorylé elle s'active mais du coup mon problème c'est que je comprends pas pour l'activité PFK-2 vue qu'elle est pas phosphoylé pour passer a l'état inactivé elle est toujours active ou du moment que la FBPase 2 est phosphorylé donc active elle inactive automatiquement l'activité PFK-2 merci pour votre aide.  [...] La PFK-2 est une enzyme bifonctionnelle. elle a une activité kinase (PFK-2) et une activité phosphatase (FBPase-2) qui permet de passer du F-6-P au F-2,6-bisP ou inversement. Ce qui déterminer son activité c'est la phosphorylation de la sérine 32. Lorsqu'elle est phosphorylée, c'est la FBPase-2 et lorsqu'elle est déphosphorylée, c'est la PFK-2.  [...]

Question simple sur les enzymes.

La baisse de l'énergie d'activation se fait lors de la formation du complexe enzyme/substrat, l'enzyme change très légèrement sa conformation spatiale, ce qui stabilise le complexe d'un point de vue énergétique. c'est le phénomène d'adaptation induite.  [...] cette protéine permet juste de rapprocher les substrats entre eux et d'abaisser le niveau d'énergie nécessaire pour que la réaction d'hydrolyse se fasse plus vite (réaction qui sans enzyme se ferait quand même mais plus lentement car nécessitant plus d'énergie).  [...]

[Biochimie] enzyme "détruite" à haute température?

Les Taq pol ne sont pas dénaturées à 95°C mais elles ne sont pas actives (de toute façon l'ADN est dénaturée à une telle température), mais leur température d'activité optimale est de 72°C à la pression de surface.  [...] On dérive hors-sujet... Rapidement pour que ce soit clair, la première étape de dénaturation de la PCR est bien plus longue (2-5 minutes à 95°C) que ce qui est nécessaire pour dénaturer l'ADN, 15-20 secondes à 95°C que l'on retrouve dans tous les cycles. La première étape est nécessaire pour activer les Hot Start qui ont l'avantage de ne pas être actives tant que cette étape n'est pas effectuée, elles ne dégradent donc pas les primers avec leur activité correctrice le temps de lancer la PCR.  [...]

[Biochimie] Problème de compréhension de la catalyse enzymatique

- L'énergie d'activation est abaissée, mais sous quel forme l'énergie est-t-elle fournie pour passer cette barrière énergétique Dans une réaction ordinaire c'est l'énergie cinétique non et dans une réaction catalysée par une enzyme (vu que les réactifs sont piégés en quelques sortes dans le site actif, je ne vois pas trop comment des collisions sont possible) quel est la source d'énergie permettant de passer cette barrière (car malgré l'abaissement, il y a quand même un obstacle énergétique).  [...] - J'ai lu que l'abaissement d'énergie d'activation était due aux tensions induites par le léger changement conformationnel au moment de la liaison substrat-enzyme qui rapprochait le substrat de son état de transition, donc le fait que l'énergie d'activation baisse serait du au fait que c'est l'enzyme qui a fournit cette différence d'énergie de part ses changements structuraux.  [...]

Comment agit un conservateur?

Il me semble que le conservateur acidifie le milieu, inactivant ainsi les enzymes des micro-organismes et donc leur développement.  [...] Il est probable aussi que l'activité de l'acide benzoïque soit due à l'acidification occasionnée. Cette acidification se traduit par une baisse du pH, ce qui inactive les enzymes ayant un pH optimum sortant de la nouvelle gamme induite par l'acide. L'acide benzoïque a peut être d'autre effets, mais je ne vois pas lesquels.  [...]