• Forum - Avantage, Séquence, Acides aminés, Protéine

Allèle et maladie

Oui, c'est ça, mais quand vous y réfléchissez, c'est évident. tous les gènes, allèles actuels résultes de diverses mutations, mais heureusement que les protéines qu'ils codent fonctionnent correctement. Certaines mutations changent le code en acides aminés de la protéine, sans que cette modification n'affecte la conformation, la fonction de la protéine.  [...] Selon vous, qu'est-ce que la sélection naturelle, si ce n'est justement que certains allèles constituent un avantage et d'autres non Modifier la séquence en acides aminés d'une protéine peut n'avoir aucun effet sur son activité, mais peut aussi l'inhiber, l'augmenter, voire lui conférer une autre fonction.  [...]

[Biologie Moléculaire] feuillet beta

je dispose d'un peptide sous forme d'une série d'acides aminés, on me demande de prédire l'éventuelle formation de feuillet B, comment procéder est-ce que le fait qu'il y est une succession d'aa chargés et hydrophobes au début suffit a prouver que c'est les 2 faces du feuillet.  [...] Je commencerais par essayer d'identifier les différents brins beta et les turns à partir de la séquence primaire. En effet tu as certains acides aminés qu'on retrouve d'avantage dans telle ou telle structure. Par exemple les régions glycine/sérine sont souvent non structurées (du fait de l'absence de chaine latérale pour l'une et du groupement hydoxyle de l'autre qui interagit très favorablement avec le solvant).  [...]

[Biochimie] Acides amines / proteines

En gros, une chaîne d'acides aminés composée des deux formes (D et L) ne peut pas former une hélice alpha, qui est une des conformations protéiques bioactives les plus courantes dans le vivant. Donc, il y a clairement un avantage a n'avoir que des acides aminés d'un même type.  [...] Tout d'abord, d'un point de vue historique, cette découverte que la plupart des acides aminés contenus dans les protéines sont de la même forme (à part la glycine qui est achirale) est relativement récente. Ce n'est qu'à partir du début des années 1930, grâce aux travaux de Dorothy Jordan Lloyd (1889-1946), qu'on commence à trouver dans la littérature scientifique des phrases du style.  [...]

La Vie préfère la droite

Par contre, une protéine semble plus efficace si elle est constituée uniquement d'acides aminés d'une même orientation. il a probablement fallu faire un choix entre les deux formes à l'époque des premières cellules vivantes, et le moindre déséquilibre aléatoire entre les deux formes a pu faire pencher la balance en faveur des lévogyres même sans avantage chimique évident.  [...] Que la convention des acides aminés diffèrent de celle des sucres n'est pas un problème. les deux mondes sont relativement séparés. par exemple, les cellules animales sont incapables de faire des acides aminés autrement qu'à partir d'acides aminés préexistants (transamination, transcarboxylations.  [...]

[Physiologie] Pourquoi le cerveau a-t-il besoin particulièrement de glucose ?

Sur base de cette information, on pourrait aussi se demander pourquoi le cerveau n'utilise pas certains acides aminés comme source énergétique. il ne les utilise pas pour plusieurs raisons. D'une part, les acides aminés ne sont pas stockés, et forment des réserves sous forme de protéines qui ne sont puisées qu'en cas de déprivation nutritionnelle (jeune allongé, dénutrition, trouble métabolique), et le corps évite donc la protéolyse car elle s'accompagne d'une fonte musculaire (ce qui n'est pas un avantage du point de vue de favoriser la survie de l'individu).  [...] Ensuite, les acides aminés utilisés pour le métabolisme énergétique doivent se défaire de leur groupement amine (c'est leur squelette carboné qui est intéressant), et libèrent donc de l'ammoniac, qui est un neurotoxique. le cerveau n'a donc plutôt pas intérêt à utiliser ces substrats énergétiques pour son propre métabolisme.  [...]

acides aminés gauchers??

1)est-il vrai que toutes les protéines connues du monde animal et vegetal sont exclusivement composées d'acides aminés gauchers.  [...] - des acides aminés de série D sont présents dans les protéines de la paroi de bactéries, et dans les peptides antibiotiques de champignons. mais ils sont soit ajoutés après la traduction, par une enzyme, soit ils sont intégrés dans des peptides (des petites chaines d'acides aminés, de 100 aa et moins) qui sont le fait d'usine enzymatiques les construisant acide aminé par acide aminé et non de la traduction d'un gène (c'est d'ailleurs impressionant.  [...]

acides aminés, classification par radical R?

en fait j'ai trouvé que les acides aminés étaient classés selon plusieurs paramètres, y compris selon la chaîne latérale R, sauf que j'ai trouvé quelques difficultés avec cette classification, car on y trouve les aliphatiques, les cycliques, les aromatiques, et parfois je ne distingue pas les uns des autres, donc pourriez vous m'en donner d'avantage d'informations (avec les caractéristiques de chacun d'eux).  [...] Donc les acides aminés possèdent les propriétés chimiques de leur radical, particulièrement lorsqu'ils formes les protéines puisque les groupements COOH et NH2 sont mobilisés presques entièrement dans les liaisons peptidiques. Ces propriétés pouvant être influencées par l'environnement puisque les charges vont varier selon le pH par exemple.  [...]

[Biologie Moléculaire] kinase

C'est aussi un avantage de la mass spectrometry, c'est que tu n'as pas besoin de reellement purifier la proteine. Si tu l'enrichis (comme avec une IP), tu facilites l'analyse. mais theoriquement, meme une proteine noye parmi des centaines, milliers etc... d'autres, tu doit pouvoir savoir si elle est presente.  [...] Sinon l'approche spectro de masse peut être interressante si tu es pote avec le chargé de la plateforme ou si tu t'ouvres vers une collaboration...l'avantage c'est que tu pourras avoir la séquence qui est phosphorylée sur ta protéine. Ce qui peut donner à un petit papier une autre gueule.o).  [...]

[Biologie Moléculaire] [biologie moleculaire] Le code génétique

Prenons un protéine moyenne de 50kD cela fait 500 acides aminés environ, soit...ifiniment de possibilités de combinaisons (j'ai pas de calculatrice sous la main), penses-tu qu'il y en ai besoin de plus.  [...] Ensuite tu oublies un peu vite que l'on ne connait pas la fonction de 10% des proteines presentent dans une cellules... Lorsque le premier genome eucaryote a ete entierement sequences, les chercheurs se sont appercu que par les technique de biologie moleculaire et de genetique et de biochimie, ils n'avaient identifies que 30% des genes (ce qui signifie qu'aucune fonction n'a pu etre attribuee à 70% des genes en laboratoire.  [...]

séquençage des protéines

j'aimerai savoir dans le détail pourquoi la méthode de Sanger, qui concerne le séquençage des acides aminés, ne peut pas être utilisée de manière récurrente. merci pour la réponse.  [...] Bon, en fait la méthode d'Edman, (qui est détaillée sur ce lien), a l'avantage d'être très efficace sur des peptides, mais sur une chaine polypeptidique d'une protéine, plus la séquence est longue, plus vite tu atteints le phénomène de bruit de fond qui rend la lecture des résultats nulle sur le chromatogramme.  [...]