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[Biologie Moléculaire] Contrôle de la glycolyse

Et perso je pense que lorsque l'ATP en grande concentration se fixe sur un site qui n'est pas le site actif ( sinon la réaction continuerait ), cela modifit la conformation de l'enzyme et par la même diminue son affinité envers ses substrats. D'où la retro-inhibition de la glycolyse ( inhiber par son propre produit ).  [...] J'avais compris la différence de Km entre site modulateur/site actif, les différents types de régulations, mais j'avais oublié de considérer l'ATP comme un cosubstrat, désolé.  [...]

[Biochimie] ATP synthase,unités : unités F1 ?

Concernant le fonctionnement de l'unité F1. au niveau du site actif des sous-unités Béta, comment est-il possible qu'il n'y ai pas d'investissement d'énergie quand on passe de l'état L à l'état T Je comprend pas comment ça se fait qu'on passe d'un ADP + Pi faiblement lié ( état L) à de l'ATP fortement lié sans investissement d'énergie.  [...] Ne pourrait-ont pas dire qu'il faut de l'énergie pour synthétisé à partir d'ADP + Pi de l'ATP ( celui qui est liés au site actif etat T pas sous sa forme libre). Cette énergie étant issue à la base des électrons qui crées un gradient de H+ grâce aux complexes membranaires.  [...]

test d'hydrolyse d'ATP

A priori c'est l'ATP puisque les enzymes sont faites pour utiliser l'ATP et non le désoxyATP. De plus si tu retires un OH sur le ribose, tu risques de diminuer la stabilité de l'ATP au sein du site actif je pense. Mais ça peut dépendre des enzymes. Peut-être que pour certaines enzymes ce sera le désoxyATP qui sera le meilleur substrat.  [...] c'est juste que j'ai cherché à commander de l'ATP pour tester un activité ATPase et que il y a tellement de types differents, avec des puretés +- hautes que je ne savais pas lequel choisir. Il y a quelqu'un qui m'a dit d'utiliser du dATP... alors je voulais un autre avis.  [...]

[Biologie Moléculaire] Principe Bioluminescence

L'ATP ne se complexe pas a la luciferine. C'est l'ATP et la luciferine qui se lient au niveau du site actif de la luciferase.  [...] 3- la luciferine adénylate ne complexe pas a ma connaissance le Mg2+ (qui d'ailleurs a du quitter le site actif sous forme de complexe avec PPi).  [...]

[Biochimie] Enzyme

Elle peut en tout cas changer de structure par (dé-)phosphorylation, liaisons à un ligand, etc... toutes ces modifications vont lui permettre, dans certains cas, de se lier convenablement à son substrat, par exemple en ouvrant son site actif.  [...] les deux domaines se rapprochent l'un de l'autre par un mouvement d'environ 12°, ce qui augmente l'hydrophobicité du site actif et prévient l'hydrolyse de l'ATP.  [...]

reactions chimiques dans les molecules des cellules vivantes?

Les transports actifs nécessitent de dépenser de l'énergie sous forme d'hydrolyse de l'ATP. À ne pas confondre avec les endocytoses qui sont des changements de conformation de la membrane (invagination, etc). De manière général les transporteurs transmembranaires sont protéiques et parfois appelés transporteurs ABC pour ATP Binding Cassette.  [...] S'il s'agit d'un transport actif, le changement de conformation induit par le substrat/ligand dévoile un site secondaire de liaison pour l'ATP, qui va se lier de façon covalente avec le transporteur, puis s'hydrolyser (libération d'un phosphate). L'hydrolyse va induire un état excité de la structure portéique, avec un nouveau changement de conformation qui relâche le substrat dans le compartiment destinataire.  [...]

site catalytique = site actif ???

Je pense que dans la majorité des cas et pour simplification on peut confondre les deux. Cependant pour l'exactitude il me semble que le terme site actif est plus large que le site catalytique.  [...] Malheureusement en général ce sont des configurations spatiales dues à la structure tertiare sinon quaternaire qui forment un site actif et pas une séquence primaire, donc on te trouvera difficilement une telle séquence.  [...]

enzyme

J'aimerais savoir si un enzyme allostérique contient plusieurs sites actifs ou s'il en contient seulement un. Est-ce la même chose pour l'enzyme normal (michaélien).  [...] je croit que toutes les enzymes n'ont qu'un seul et unique site actif... aprés avoir chercher la définition d'une enzyme allostérique je ne pense pas qu'elle echappe a la régles. Pour moi toutes les enzymes n'on qu'un seul et unique site actif. aprés je peux me tromper.  [...]

[Biologie Moléculaire] à propos du site actif des enzymes

Dans mon cours. '' au sein du site actif, la catalyse est due à l'augmentation de la concentration locale de molécules de réactants''.  [...] Est-ce que ça veut dire qu'il y'a plusieurs molécules de substrats qui se fixent au site actif de l'enzyme.  [...]

plusieurs questions avant mon DS

L'enzyme possède cette double spécificité car elle possède un repliement dans l'espace en 3D particulier, et notamment au niveau du site qui va lier le substrat qu'on nomme le site actif.  [...] 5/ Le site actif va reconnaitre de facon physique le substrat en agissant sur lui. Tu comprends donc facilement que ce site actif va a la fois determiner quel substrat peut etre reconnu et par la meme quelle reaction sera declenchée. Donc specificite de substrat et d'action.  [...]