• Forum - ARN, Protéines, Histoire

[Phylogénie] Pourquoi comparer des séquences protéiques et non nucléotidiques ?

deux protéines peuvent avoir une meme fonction et une même origine, mais la séquence codante a pu dévier, sans modifier la séquence protéique.  [...] Je dirais que le choix entre étudier ADN/ARN ou les protéines dépend de la longueur de l'histoire évolutive que tu veux reconstituer. Si tu t'intéresses à une histoire courte (par exemple l'évolution de souches de VIH dans une petite population humaine, voire chez une même patient, il vaut mieux regarder l'ARN, mais si tu veux construire une phylogénie des virus de l'herpes, il est peut-être préférable de regarder les protéines (mais même dans ce cas je n'en suis pas convaincu).  [...]

[Biologie Cellulaire] Ciblage des protéines

J'espère que vous pourrez me répondre car ça me bouffe un peu cette histoire ^^ (puis j'ai pris pour exemple les protéines, mais mon problème est général pour tout type de molécules, ARN, lipides, etc).  [...] Plus scientifiquement, ce dont tu parles fait partie de la plasticité de la cellule. Ou stochastique (aléatoire). Ces protéines (ou autres, hein.) ne sont généralement pas nécessaire à la survie de la cellule, ni à sa fonction (ces protéines là sont présentes en milliers, dizaines de milliers voire centaine de milliers de copies).  [...]

[Biologie Moléculaire] purification de ARNm procaryote

je dois faire une etude du transcriptome d'une bacterie,par la methode rna seq,pour creer ma librairie je dois purifier mes ARNm procaryotes des ARNm eucaryotes et autres ARN,ADN,ma question est donc comment isoler mon ARNm procaryote de restes des ARNs(ARNm eucaryotes,ARNr...).  [...] Par la suite, tu cherches à séparer des ARNm procaryotes d'eucaryotes. Ici c'est une autre histoire. Tu pourrais imaginer des méthodes visant à identifier les protéines fixées sur les ARNm. Par exemple, chez les eucaryotes la maturation de l'ARN fait appel à un épissage qui laisse des traces sur l'ARNm.  [...]

[Biologie Moléculaire] un gène= une proteine ??????

un gène qui se transcrit en ARNm donnera une protéine mais il existe d'autres types d'ARN comme les ARNmit, pour la mitochondrie, les ARNt, ARN de transferts qui servent à la synthèse des protéines, les ARNr qui servent à l'assemblage et à la fonctionnalité des ribosomes.  [...] 3) Si tu parles des protéines qui n'ont pas de peptide signal, elles resteront dans la cellule. Une protéine qui possède un peptide signal sera soit une protéine membranaire, soit elle est adressée à un organite, soit c'est une protéine qui sera exocytée. Si elle n'en possède pas elle restera dans la cellule, le type même de protéine sans peptide signal se sont les protéines du cytosquelette, actine, tubuline.  [...]

[Biologie Moléculaire] la petite histoire de l'ARN interference... que s'est-il passé dans les pétunias?

Fire et Mello apportent le début d'explication à des résultats étranges comme celui-ci avec leur papier de 1998 qui décrit pour la première fois que c'est l'ARN double brin qui serait en fait responsable du gene silencing observé. Ce qui n'est pas très clair, même dans les revues retraçant tout l'histoire, c'est que se passait-il exactement dans les pétunias de Jorgensen pour qu il y ait production d'ARN double brin à partir de ce transgène.  [...] As-tu regardé la publication de Jorgensen, peut-être ils proposent une hypothèse, bien qu'à l'époque l'ARN interférence n'était pas connue Es-tu sûre que Jorgensen a obtenu ce résultat en surexprimant un transgène inséré dans le génome du pétunia (il me semblait qu'il y avait une histoire de transfection d'ARN double brin non).  [...]

Est-ce que tous les gènes codent des protéines

Dans les séquences codantes, seule une petite partie des transcrits ARNs sont voués à quitter le noyau et être traduit en protéine. ce sont les ARN messagers. Il existe ainsi d'autres ARN non-messagers, tels que les ARN ribosomiques (à activité catalytique), les ARN interférants, les ARN petits nucléaires, les ARNt (de transfert, impliqué également dans la synthèse des protéines).  [...] Par contre je te rejoins sur l'histoire de l'ARN polymérase. que vient-elle faire dans le débat Il s'agit d'un complexe enzymatique dont le rôle est de transcrire l'ADN en ARN (comme son nom le laisse deviner). C'est bien une structure protéique donc je ne comprends pas non plus ta remarque wafik.  [...]

[Génétique] splicing+mutation

L'effet d'une mutation sur une zone de splice modifie obligatoirement l'exon aprés la mutation ou bien il y a d'autres moyens J'y comprend pas grand choses, le phénoméne d'epissage est super compliqué beaucoup de protéines intervenant à plusieurs niveau c'est compliqué à pour ma petite tête.  [...] est-ce que ta mutation ne pourrait pas jouer sur la stabilité de ton ARNm tu le detecterait normalement mais il serait moins abandondant, donc moins de protéine, donc probleme.  [...]

[Biochimie] pseudogènes

Mais attention, il existe des familles de gènes, càd un groupe de différents gènes qui viennent d'un même gène d'origine, et ils peuvent très bien être tous fonctionnels si les mutations qui les différencient résultent en des protéines fonctionnelles.  [...] Par contre, problème. tu m'écris dans ta réponse étant donné que le pseudogène n'est pas transcris... alors que tu parlais de codons STOP dans ta question initiale. Si une séquence n'est pas transcrite, il n'y a pas d'ARN (messager si on prend l'exemple d'un gène qui devrait coder une protéine), donc pas d'histoire de codon STOP.  [...]

[Génétique] Nombre de gènes et nombre de protéines chez l'Humain ?

Ce phénomène explique en tout ou partie (je ne suis pas spécialiste, peut être que d'autres mécanismes viennent compléter celui-ci) le fait qu'un seul gène puisse coder plusieurs protéines, d'où l'écart entre le nombre de gènes et le nombre estimé de protéines différentes dans une cellule donnée.  [...] Que veut dire. Ce qui me pose problème, c'est qu'avec 25000 gènes pour 21000 protéine, logiquement on n'est pas loin des 85% de gènes codant pour des protéines, donc transcrit en ARNm.  [...]

Proteines chaperon

Il m'a mis en relation avec lui et j'ai commencé un traitement à base de ce qu'il appelait proteines chaperons. qui consistait a des injections intramusculaires d'un mélange ou dosage a partir d'une serie d'ampoules seccables qu'il ouvrait devant moi.  [...] Mais ce qui m'a le plus intrigué dans les traitements reçus est relatif aux soins spécifiques par proteines chaperons pour une bronchite à répétition (2 à 3 successives chaque hiver ) qui a complétement disparue depuis quelques années.  [...]