• Forum - ARN, Amorces, Fragment

[Biochimie] Northern et RT-PCR

Ou alors, en Northern, on a la taille de tout le fragment d'ARN tandis qu'en RT-PCR, on va amplifier seulement le fragment compris entre les deux amorces donc on aura une taille inférieure.  [...] Oui c'est a peu pret ca. En Northern tu as la taille de l'ARNm, alors qu'en RT-PCR le fragment ne correspond qu'a la distance entre les deux amorces.  [...]

[Biologie Moléculaire] replication d'ADN

oui bien sure qu'on synthétise les amorces d'ARN à partir d'ARN polymerase mais est ce au moment de la réplication je veux dire est-ce que ces amorces n'ont pas eté présentes avant la replication et elles ne les reste que s'ybrider.  [...] une amorce d'arn est synthétisée sur le leading strand lors de l'inititiation. Mais pour le brin tardif, la Pol alpha-Primase synthétise des amorces d'ARN pour chaque fragment d'okazaki. Donc pas uniquement lors de l'initiation de la réplication.  [...]

ADN plymérase beta

J'ai un petit problème. Je suis en licence de biochimie, biologie cellulaire et physiologie, et j'ai au programme le chapitre sur la réplication de l'adn chez les eucaryotes. J'aimerais beaucoup savoir, concernant ce chapitre, comment sont éliminées les amorces d'ARN des fragment d'Okazaki.  [...] c est l RNase H qui degrade les amorces ARN ds fragments d okasaki.  [...]

[Biologie Moléculaire] REplication

quelqu'un peut il me dire dans la réplication des procaryote ou eucaryote si l'amorce d'ARN n'est que sur le brin retardé (fragment d'okasaki). En effet, je ne comprend pas très bien mais sur tous les schémas vu, ils ne représentent que des amorces pour ce brin.  [...] les ADN polymérases ont besoin d'une amorce d'ARN synthéthisée par la primase pour commencer la réplication aussi bien du brin tardif que du brin avancé. Le fait que tu le trouve cité principalement pour le brin tardif vient probablement du fait qu'il faut une amorce d'ARN pour chaque fragment d'Okazaki alors que pour le brin avancé une seule amorce suffit au début du cycle de réplication.  [...]

[Biochimie] Mécanisme de réplication de l'ADN

svp esque vous pouvez m'expliquer ces passages (replication chez les procaryote phase de terminaison.les amorces ARN sont detruite hydrolyser puis remplacé par l'ADN grace a lactivité exonucleique de ADN plymerase 1(jusqu'ici cava) ensuite vien l'action de l'ADN plymerase 3 pour la synthese des complements de fragments les fragment ADn finalement liberer adjassant sont soudés par la lygase()) si quelquin peut m'exoliquer a partie densuite.  [...] apres que adn polymerase 1 transforme arn amorce en adn quel est le role de adn poly 3 ici elle a deja fait lelongation puisque on est a la terminaison de quel fragment il parle.  [...]

[Biologie Moléculaire] PCR classique - PCR en temps réel !

La PCR, polymerase chain reaction, est un ensemble de réaction visant à amplifier un fragment d'ADN recherché. Pour faire court, on prend des amorces (Brins d'ARN) qui iront s'hybrider au début et à la fin du fragment que l'on veut amplifier. Grâce à une polymérase (Taq.  [...] ), l'ajout de nucléotides, tampon (pour les bonnes conditions de fonctionnement de l'enzyme) le fragment voulu sera répliqué en des milliers d'exemplaires.  [...]

les fragement d'OKAZAKI

Par conséquent, comme tes deux brins vont dans des sens inverses, tu auras un brin avancé ( celui dans le sens 5'3') et un brin retardé avec fragment d'Okazaki (le brin dans le sens 3'5'). Bien sur, tout ce que je dis vaut pour l'ADN pol lors de la réplication.  [...] L'ARN polymérase n'a pas besoin d'amorces donc pas besoin de fragment d'Okazaki sur aucun des deux brins.  [...]

[Biochimie] la réplication d'ADN

et en même temps, la primase fixe une amorce d'ARN (pour le premier fragment d'Okasaki), le brin retardé commence alors lui aussi a être répliqué. Le problème d'orientation du brin retardé est réglé par le fait que ce brin forme localement une boucle, ce qui modifie sont orientation, du coup localement, on a les 2 brins matrices qui ont une même orientation, permettant ainsi à la pol III d'avancé sur l'ADN et de synthètiser les 2 brins.  [...] Ensuite, les amorces d'ARN sont retirées (donc cela concerne l'amorce du brin avancé et chaque amorce de chaque fragment d'Okasaki) grâce à l'ADN polymèrase I (qui contrairement à la pol III a une activité exonucléase 5'-. 3') puis comme d'ADN pol I n'a besoin que d'un 3'OH libre pour polymériser, elle va pouvoir combler les parties laissées libres par les amorces.  [...]

[Génétique] Réplication d'ADN

La DNApol ajoute un Desoxyribonucléotide triphosphate sur l'extrémité 3'OH du fragment synthétisé, et libère un pyrophosphate. Donc elle allonge le côté 3'OH. La direction est donc 5'P-. 3'0H.  [...] Ensuite une ADNpol vient sur ces amorces, et commence à copier le brin retardé dans le sens 5'3', c'est à dire en s'éloignant de la fourche jusqu'à l'amorce précédente. C'est ce qu'on appelle le fragment d'Okasaki. Ensuite les amorces d'ARN sont supprimées et remplacées par de l'ADN, et les fragments sont ligués.  [...]

[Génétique] ADN polymérase

Moi j'aurai dit que les 3 sont indispensables car chacune à un rôle précis, c'est vrai que l'ANN Pol 3 sert pour l'élongation de l'ADN du brin avancé et qui permet la formation des fragments d'Okazaki, mais l'ADN Pol 1 a aussi un rôle car la synthèse discontinue aboutit à une césure (lacune) entre l'extrémité 3' d'un fragment d'Okazaki et l'extrémité 5' de l'amorce d'ARN du fragment d'Okazaki suivant.  [...] L'ADN polymérase I vient se fixer sur la lacune. Elle allonge le fragment d'Okazaki par son activité de polymérase 5'. 3' et retire l'amorce d'ARN du fragment d'Okazaki suivant par son activité d'exonucléase 5'. 3'.  [...]