• Forum - Arbre, Groupe, Question

[Evolution] Lecture d'un arbre phylogenetique

Bon c'est juste une petite question simple. J'ai un doute sur un truc, j'ai comme question. Le groupe des poissons a-t-il un sens d'après cet arbre phylogénétique.  [...] Qu'appelles tu avoir un sens Si ça signifie pour toi être monophylétique alors demandes toi comment on voit sur un arbre qu'un groupe est monohylétique, est un clade.  [...]

[Evolution] phylogénie

Dans l'exemple en question, le groupe n'est pas monophylétique car il manque des descendants. le bonobo chez les Panines, et quelques espèces chez les Hylobatoïdés. D'où l'intérêt d'utiliser des clades plutot que des espèces.  [...] En terminale, on trouvera fréquemment des exercices demandant de classer phylogénétiquement des espèces, puis souvent une question du genre les espèces x, y et z forment-elles un groupe monophylétique. Il est dans ce cas sous-entendu (et même souvent précisé) au sein de l'arbre qui vient d'être établi.  [...]

[Evolution] Distinction entre para et polyphylétique ?

On a d'idée sur le caractère poly ou paraphylétique d'un groupe que retrospectivement. qu'après avoir établie une classification qui reflète mieux la phylogénie réelle.  [...] Mais cela veut dire que pour dire qu'un groupe est paraphylétique on doit voir remonter dans l'arbre jusq'à trouver un ancêtre commun qui corresponde aux critère du groupe en question. Si cet ancêtre ne correspond pas aux critères du groupe alors il ne fait pas partie du groupe ( logique ) et donc on se retrouve avec un groupe polyphylétique.  [...]

Rhynia ou Aglaophyton ?

Il ne me semble pas non plus que la situation soit claire pour ta question bien que mes lectures les plus récentes parlent de deux espèces différentes (voir référence ci dessous). Au moins on peut dire que les deux font partie des Rhyniophytes qui sont probablement le groupe le plus proche des plantes vasculaires modernes, (entre les bryophytes et les lycophytes sur un arbre phylogénétique).  [...] je un étudiant en sv, et on étudie les cycles de reproduction des plantes pour voir l'évolution..., en fin, en étuduant les ptéridophytes (fougères),a on comancé avec le cycle de Rhynia et il considéré comme cycle transitoir entre gametophyte dominant et sporophyte dominant, car les chercheurs considère que Rhynia major (qui est un sporophyte à 2n ch.   [...]

[Evolution] caractéristique des Arbres

1ère question. Une arbre phylogénétique(AP) peut comporter des groupes paraphylétiques et polyphylétiques le groupe des reptiles en est un exemple(de paraphylie) et pourtant ils sont présents sur des AP ( si tu veux que je t'explique que signifient ces termes n'hésites pas).  [...] 3ème question. Les espèces qui se trouvent au sommet de l'arbre son toutes actuelles, les nSuds de l'arbres représentent des ancêtres communs, donc des espèces fossiles.  [...]

Arbre Phylogénétique non raciné

Donc une phylogénie montre l'histoire au cours du temps, mais malheureusement la plupart des méthodes bien que trouvant les connexions entre les séquences sont incapables de les orienter temporellement. Une méthode consiste à orienter manuellement sont arbre en ajoutant un groupe extérieur à son groupe d'étude (qui logiquement à aussi divergé avant les séquences d'intérêt...) c'est ce qu'on appelle l'enracinement.  [...] Tu penses vraiment qu'un chat (qui est un eucaryote.) est le groupe extérieur lorsque tu as une archée (procaryote et seul représentant d'un autre règne du vivant.) au plein milieu de ton arbre d'eucaryotes.  [...]

[Biochimie] Phylum

Je pense bien avoir précisé à quel étage dans la classification se situe ce groupe d'êtres vivants Relis et regarde un peu sur wiki ce que signifie phylum, ça répondra à ta question.  [...] Non, tu n'es pas obtus, c'est juste ta question qui n'est pas claire. Donc, le truc est que taxon veut juste dire un groupe organisé. Donc, un taxon peut être une espèce mais aussi bien un phylum. Donne un arbre et on verra.  [...]

[Evolution] Variations sur un thème de synthétase...

Sinon, il y a une dernière question qui m'échappe un peu... (les autres ça va ). En fait, dans l'arbre GluRS il y a un truc bizarre. les deux paires E1 et E2 chez C. elegans et D. radiodurans. En fait, tu as E1 de C. elegans dans un groupe avec H. sapiens (branches courtes), alors que E2 de C.  [...] Non. En revanche, il y a l'arbre de la question suivante qui permet peut-être d'expliquer la chose. En fait, on y voit qu'au sein des Eubactéries il y a (grossièrement) 3 groupes.  [...]

[Evolution] Comment reconnait on un extra groupe ?

Le groupe extérieurs se définis arbitrairement en utilisant un critères a priori. par exemple pour enraciner la phylogénie des eukaryotes on va utiliser une bactérie qui n'a pas de noyau. A noter que dans les autres méthodes de reconstruction phylogénétique l'enracinement est facultatif.  [...] 3. Il n'est pas indispensable d'utiliser le critère extra-groupe pour avoir un arbre. Mais il l'est si l'on veut que cet arbre soit enraciné, donc les caractères polarisés. Le choix de l'extra-groupe est une hypothèse, qui peut être consensuelle ou non. Par exemple, un dinosauromorphe X est choisi comme extra-groupe dans une analyse phylogénétique des dinosaures.  [...]

[Zoologie] Utilité du groupe externe en phylogénie

Le groupe externe sert non seulement à enraciné l'arbre mais aussi à polariser les caractères. Je m'explique. Comme le disait très bien MaliciaR, le groupe externe enracine l'arbre. Sans lui, ton arbre n'est pas orienté, n'importe quel de tes taxons peut être considéré comme groupe frère de tous les autres.  [...] Il y a un choix énorme dans le positionnement de la racine. n'importe quel taxon ou n'importe quel noeud (je n'ai plus la formule en tête mais ça augmente de façon exponentielle avec le nombre de taxons). Si tu n'as pas de groupe externe, ton arbre devrait être représenté sous forme d'étoile si tu veux.  [...]