• Forum - Amorces, ADN, Séquences, Cibles

[Biochimie] Demande de definitions

L'hybridation est la fixation de l'amorce sur un brin d'ADN complémentaire. L'amorce est une séquence d'ARN, c'est pour sa que l'on parle d' hybride.  [...] Lorsqu'on parle d'hybridation des amorces on parle de phénomene in vitro, et dans ce cas c'est en effet la complémentation des amorces d'ADN sur leurs séquences cibles.  [...]

[Biologie Moléculaire] Amorce sens et antisens

En ce qui concerne les amorces sens et antisens, je ne comprend pas pourquoi l'amorce sens est identique à la séquence cible tend dis ce que.  [...] l'amorce antisens et complementaire à la sequence cible pourtant les 2 amorces doivent hybrider avec l'ADN complémentaire pour débuter la réaction PCR.Je ne sais pas est ce que ma question est claire ou non mais lors de la comparaison de mais amorces avec les sequence cibles sur le site NCBI voila ce que j'ai trouvé.  [...]

[Biochimie] (licence/master) Question sur la pcr pour un rapport de stage, merci

c'est une PCR utilisant de petites amorces de séquences aléatoires ( 8-12 nucléodites)comprenant (60 à 70% G et C) puis une identification sur gel. C'est un moyen rapide pour identifier plusieurs espèces. C'est une méthode très sensible. Il y a pas besoin de connaitre les génomes.  [...] C'est une méthode de PCR récentes, qui utilise des amorces spécifiques, elles permettent d'amplifier plusieurs ADN cibles en même temps. L'ADN de chaque amplification est quantifié à tous les cycles par fluorescence spécifique pour chaque ADN cible. Il faut une connaissance du génome des différents parasites.  [...]

[Génétique] désignaion d'amorces pour une qpcr

D'arès mes connaissances les amorces doivent etre spécifiques pour quelles ne s'hybrident pas à des régions autres que mes cibles.Mais est ce que je peux désigner des amorces dégénérées etant donnée que les séquences présentent des variations meme dans les régions conservées.  [...] dans ce cas, si c'est vraiment infaisable (faut aligner toutes les séquences pour voir si on a quelques chances de poser des amorces) on peut faire des PCR multiplex (avec des pools d'amorces) mais la mise au point est du coup beaucoup plus complexe (notamment l'efficacité a prendre en compte).  [...]

amplification de l'ADN

Dans une cellule, les facteurs de transcription sont des protéines qui se fixent à l'ADN sur des séquences spécifiques (séquences régulatrices), et vont permettrent à leurs gènes cibles de s'exprimer ou non. Ca marche dans les deux sens.  [...] Si on reste dans le cadre de la PCR, la séquence d'ADN que tu as au départ sert de matrice et le brin synthétisé est complémentaire. Les amorces sont elles-mêmes complémentaires au brin matrice.  [...]

[Biologie Moléculaire] Technique pour obtenir des amorces souche spécifique sans séquence du génome

Or pour cela je dois tout d'abord déterminer des amorces spécifiques de mes souches, le problème est que les génomes de mes bactéries n'ont jamais été séquencés à ce jour et il n'est pas prévu car trop cher.  [...] Si tu cibles un gène très bien conservé chez d'autres souches bactériennes, tu peux designer tes amorces sur un consensus (à partir des leur séquences).  [...]

[Biologie Moléculaire] P53 et réparation de l'ADN

Une des activités favorites des biologistes moléculaires est d'aligner et de comparer entre elles des séquences d'ADN apparentées pour en identifier les régions les plus conservées. On suppose alors que ces régions correspondent à des domaines fonctionnels.  [...] La protéine s'organise autour d'un domaine central hydrophobe (résidus 110 à 290), qui se lie à des séquences d'ADN spécifiques (contenant des répétitions du motif RRRCA/TA/TGYYY). Deux des cibles majeures de p53 sont p21waf-1, un inhibiteur de kinases cycline-dépendantes impliqué dans l'arrêt du cycle cellulaire en G1, et Bax-1, un inhibiteur de bcl-2 impliqué dans le contrôle de l'apoptose.  [...]

Vitamine D

Merci Kryok pour ces claires explications. Comment évite-t-on (aujourd'hui, en France) les carences en vitamine D, je suppose que l'huile de foie de morue n'est plus de mise.   [...] il s'agit d'hormones stéroides (D2 et D3 inactives donnant des dérivés actifs, 25hydroxy et surtout 1-25dihydroxy et 24-25dihydroxy (lui, moins actif)),au niveau moléculaire, ces dérivés se fixent sur un récepteur nucléaire spécifique, le récepteur à la vitamine D, qui une fois activé se lie sur les séquences promotrices présentes sur l'ADN des gènes cibles, en activant leur transcription, ce qui expliquerait les effets variés observés.  [...]

[Génétique] Extraction, purification et analyse d'ARN (Nanodrop et bioanalyser)

De façon générale, s'agit-il de fixer l'amorce sur les séquences qui subissent la RT Dans ce cas...à quoi sert-il d'élever la température à 65 °C Parce qu'il semble superflu de dénaturer (on a affaire à des ARN simples brins). Serait-ce une température idéale pour fixer l'amorce sur les séquences cibles.  [...] Pour les PCR classiques on utilise toujours des amorces ADN. C'est plus facile a synthétiser et a manipuler. In vivo pour la réplication il y a synthese d'amorces ARN par la primase qui sont ensuite remplacées par de l'ADN mais en PCR il n'y a pas de raison.  [...]

[Biologie Moléculaire] La postion des éléments de réponse aux hormones

Le HRE est une séquence d'ADN qui n'est pas nécessairement toujours absolument identique dans tous les gènes cibles. Il peut y avoir de petites variation. En général on connait la séquence la plus efficace pour la fixation du récepteur de l'hormone. Donc on peut éventuellement la chercher directement sur la séquence éditée en fichier texte.  [...] Du coup, il existe des programmes qui permettent de trouver ces éléments de réponses dégénérés sur une séquence d'ADN. Ce ne sont pas des bases de données. En revanche il vont tout vous sortir sans chercher à comprendre la relevance biologique de la chose.  [...]