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Sens de lecture d'un plasmide

Je tente de faire une construction à l'aide d'un programme et j'ai trouvé la séquence de mon plasmide. J'ai repéré les sites de restriction à utiliser qui seront de part et d'autre de mon gène.  [...] Seulement je me pose la question de l'orientation de mon gène. Tout d'abord comment savoir où se trouve le 5' et où se trouve le 3' du plasmide J'ai une séquence qui est numérotée de 1 à 5369. Le 5' commence toujours en 1.  [...]

[Biologie Moléculaire] Pcr

Par exemple, un protocole pour amplifier des fragments de plasmides de 1 kpb, avec la Taq DNA Polymérase et primers avec Tm autour de 59-61 °C.  [...] Suivez pas à pas la démarche que j'avais indiqué (elle est toujours valable, il m'a fallu un court instant pour trouver la séquence de l'histone H2B).  [...]

[Biochimie] Rechercher sites de restriction

J aimerais savoir si il est possible de trouver un programme dans lequel on copie une sequence d adn et une ou plusieur enzymes et qu on puisse observer la decoupe de l adn au niveau de la structure primaire eventuellement en 3D ou en video.  [...] J'ai trouvé le programme dans lequel j'entre une sequence et je choisis une enzyme puis je récupère ma sequence avec des espaces aux niveau des sites de restrictions correspondant a l'enzyme choisie.  [...]

[Biologie Moléculaire] Programme de clonage

Je vous donne un exemple. en voulant cartographier le plasmide pEGFP-N1 de Clontech ( http.//www.clontech.com/images/pt/di...s/PT3027-5.pdf ), j'ai remarqué qu'après un Scan, le promoteur CMV n'apparaît pas. En effet, la séquence consensuelle diffère de celle de la librairie d'un seul nucléotide (en position 509 de votre séquence, il y a un C, alors que c'est un G dans la séquence consensuelle).  [...] Ayant quelques centaines de plasmides à répertorier, procéder à des alignements de séquence pour chacun d'entre eux me prendrait beaucoup de temps.  [...]

[Biologie Moléculaire] PCR et Taq : répétition de nucléotide

J'ai remarqué que même si mes PCR fonctionnent correctement, derriere si je séquence (enfin j'envoie à une société de séquencage) mon gène ZP4 j'ai un electrophérogramme illisible à partir d'une certain niveau.  [...] Tu séquences en sens et en anti-sens Comment lis tu tes séquences D'après une séquence rendue par le programme de séquençage ou directement sur les pics avec un programme type bioedit Je te demande parce que parfois les programmes des séquenceurs ne parviennent pas à lire une séquence sur les pics parce qu'ils sont trop faibles, un peu étalés, qu'il y a un bruit de fond, mais en les regardant toi même tu y arrives et tu complètes tes trous.  [...]

mystère de séquences...

Après séquençage de 3 génotypes avec la même amorce, nous avons 3 séquences qui a parti du même endroit, a un décalage d'environ 15 bases (je n'ai plus le nombre exactes mais c'est le même pour les 3).  [...] Ca sent très fortement la séquence répétée. Ton amorce se fixerait à plusieurs endroits, tant que tu es dans la région répétée ta séquence semble normale et quand tu atteinds les régions variables, tu obtiens un mélange de séquences. Utilise le programme blast en donnant comme élément à rechercher ton amorce (ou mieux, un segment de 50 nucléotides issus de la partie propre de la séquence).  [...]

[Génétique] DNA sequencer

Bonjour, je cherche un programme libre qui resemble a Sequencer. j'ai teste Bioedit mais je ne peux pas assemble mais sequence (reverse et forward).  [...]

[Biologie Moléculaire] Molécule de GABA

Je sais que le neurone à dopamine est stimulé donc lâche plus de dopamine (source de la sensation de plaisir) mais mon problème ce trouve juste au stade qui précède cela au niveau de l'inhibition du GABA en effet celui ci inhibe (diminue) la libération de la dopamine donc normalement atténue et non pas accentué la sensation du plaisir./.   [...] Merci d'avance. Bonne vacances pour ceux qui le sont déjà et bonne chance pour les gens tout comme moi passant leurs épreuves de bac.   [...]

Mvlst

je suis entrain de typer des souches en utilisant multi-virulence-locus sequence type MVLST.  [...] je veux savoir est ce qu'il y a un programme qui détermine automatiquement les 'sequence types STs ou c'est moi que je dois les déterminer.  [...]

L'origine absolue du code génétique

Même dans l'hypothèse où y parvenez (.), il vous faudra démonter expérimentalement que des protéines fonctionnelles(gauchisme, liaisons peptidiques, séquence correcte) pour les êtres vivants puissent apparaître naturellement, et dans l'eau de surcroît… Hélas c'est ici que vous perdez définitivement tout espoir de réussite.  [...] Faut dire aussi que besoin, intérêt, nécessité, code, programme sont des termes avec une connotation finaliste et qui, pourtant, sont partout dans les ouvrages de biologie. Ca n'aide pas à faire comprendre l'évolution.  [...]